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a‑aCAGCGTCACCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCa < 5:48759/148‑1 (MQ=255) aCCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCAc > 3:104567/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGc > 6:146509/1‑130 (MQ=255) cTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCa < 8:294536/149‑1 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGt < 6:197990/50‑1 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGt > 5:197990/1‑50 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAg > 4:18366/1‑149 (MQ=255) tCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCAAGGTTGCGCAACATCGAGAACCCCGCCGAGGATGACCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAg > 8:261453/1‑149 (MQ=255) gTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAg < 1:309448/147‑1 (MQ=255) gTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCa < 4:85938/149‑1 (MQ=255) gTGAACGCTTTCACAGTGAGCGCATTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCa > 4:72527/1‑149 (MQ=255) tGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCAc < 3:13647/149‑1 (MQ=255) tGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGc > 4:227019/1‑119 (MQ=255) tGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGc < 3:227019/119‑1 (MQ=255) gcgcTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCTCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCCCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCCCCGAt > 7:235414/1‑148 (MQ=255) | CTGTAGGCCATCAGGTAAGCCTCTCGTCGAATGGTCGCCTCCAACGCTTCCAGCATTTGCTGCTGAGGCGGCAGCCAGCTTTGCACCGTCTGGTTGATACGCGCCTGCACGCTTGGCTCGA‑ACAGCGTCACCTGCTCGTGAATGCGCTCACTGTGAAAGCGTTCACGGGTCGCCACCAGTTGCGTCAACCCGGCCGTACCGATGGCGCCACCCAGGTTGCGCAACATCGAGAACACCGCCGAGGCTGAGCCGGCTTCACGCTTGTCCAGCCCGGCCACCGCCAGCACCGATAAC > NC_002947/2351832‑2352125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |