| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,386,384 | A→C | 6.0% | R240R (CGT→CGG) | PP_2094 ← | nitrate‑binding protein NasS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,386,384 | 0 | A | C | 6.0% | 415.8 / 14.3 | 135 | R240R (CGT→CGG) | PP_2094 | nitrate‑binding protein NasS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/59); new base C (4/4); total (72/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CTCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAG > NC_002947/2386237‑2386531 | tCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACg > 2:265629/1‑149 (MQ=255) aaTGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCGAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGgcg > 5:339706/1‑149 (MQ=255) aaTGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg < 8:167997/146‑1 (MQ=255) aaTGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg > 7:167997/1‑146 (MQ=255) aaTGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGgcg > 3:42224/1‑149 (MQ=255) tGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCt > 7:109722/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGt > 5:181997/1‑149 (MQ=255) aGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTggg > 8:174224/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgggg < 2:212097/149‑1 (MQ=255) gggCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg < 1:318446/149‑1 (MQ=255) gCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCgg > 1:159292/1‑148 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCa > 5:103661/1‑148 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCa > 7:219746/1‑148 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCCAGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgc > 4:136454/1‑133 (MQ=255) aTGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCa > 1:8736/1‑147 (MQ=255) tGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgggg > 4:279934/1‑134 (MQ=255) tGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgggg < 3:279934/134‑1 (MQ=255) tGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa < 4:182382/148‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGCGGGGTTTAGAGGTAAGCGGTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCTGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAg < 1:59115/148‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTg < 8:215963/128‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTg > 7:215963/1‑128 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa > 3:318674/1‑145 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa < 4:318674/145‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAcg > 2:151864/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGGGGTGTCCAAGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAcgcg > 5:356786/1‑149 (MQ=255) tgtCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTAt > 8:202081/1‑122 (MQ=255) tgtCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGc > 2:148806/1‑148 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCa < 1:259938/143‑1 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCa > 2:259938/1‑143 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCa < 4:42224/148‑1 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAg > 7:324130/1‑149 (MQ=255) aGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAc > 2:56883/1‑149 (MQ=255) aGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAc > 2:145081/1‑149 (MQ=255) ggTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAcc < 1:145081/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTc > 6:52871/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTc < 2:159292/149‑1 (MQ=255) cgcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTcc > 4:328824/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCgg < 8:324130/149‑1 (MQ=255) ttGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCggg > 3:20589/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCggg < 5:52871/147‑1 (MQ=255) ccTGAGCAGTTGCGAGGTGCTGCGTCGGATTTCCGGCCTTTGATCGATGAATCGGCTGGCCGTGAGCATCCCCTTGAACACCGCACGGGCGCTGTAGGCGTATTGCTCGGAAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTATTCAGGGTGAt > 6:206710/2‑149 (MQ=255) gCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc < 7:278543/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc < 1:151864/148‑1 (MQ=255) ttGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc > 1:38541/1‑145 (MQ=255) gcgGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAg < 4:148548/102‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAg > 3:148548/1‑102 (MQ=255) ggTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGa > 3:176888/1‑119 (MQ=255) ggTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGAct < 6:339706/149‑1 (MQ=255) tgcGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGActggctg < 4:20589/149‑1 (MQ=255) cggcggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCtggt > 1:154118/1‑149 (MQ=255) cggcggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGACCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGActggctg < 1:32977/147‑1 (MQ=255) cggTTTTCCTGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGc < 7:174224/149‑1 (MQ=255) ggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGc > 1:21328/1‑148 (MQ=255) ggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATACGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGc > 7:135532/1‑148 (MQ=255) gTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCa < 7:200487/149‑1 (MQ=255) ttCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAgg < 2:38541/148‑1 (MQ=255) ccGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAAGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGt > 5:261370/1‑148 (MQ=255) cGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCACACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCTGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGTTGATCCGGCCAGAt < 8:209653/126‑1 (MQ=255) cGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCACACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGAt > 7:209653/1‑126 (MQ=255) gCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTggg < 4:358892/63‑1 (MQ=255) cTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCggg < 3:122117/108‑1 (MQ=255) cTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCggg > 4:122117/1‑108 (MQ=255) cTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGc > 3:279875/1‑149 (MQ=255) gATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGAt < 7:279409/114‑1 (MQ=255) gATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGAt > 8:279409/1‑114 (MQ=255) 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aTCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGcc < 7:81750/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTgg < 3:103880/139‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTgg > 4:103880/1‑139 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCa > 4:142308/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAcc < 8:23824/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAcc < 3:41616/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgcg > 3:147216/1‑149 (MQ=255) tCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAg < 6:273090/116‑1 (MQ=255) tCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAg > 5:273090/1‑116 (MQ=255) gCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAggg > 8:16276/1‑149 (MQ=255) ccTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGc > 3:318371/1‑149 (MQ=255) cTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCt > 5:39648/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAAGCGGGCGCAGGCCAGGAGCTGTTCCGGTTGATCCGGCCAGATCGACGTGATGGTGTACACGGTGAAGCATTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGTCt > 8:337493/1‑148 (MQ=255) cccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc < 3:55931/126‑1 (MQ=255) cccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc > 4:55931/6‑131 (MQ=255) ccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCGAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc < 2:264042/126‑1 (MQ=255) ccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc > 1:264042/5‑130 (MQ=255) ccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCa > 7:54466/5‑149 (MQ=255) tCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCAcc > 7:31467/1‑148 (MQ=255) acAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACTGCGTCGGCGGCCCAggg > 7:239141/2‑142 (MQ=255) acAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACTGCGTCGGCGGCCCAggg < 8:239141/141‑1 (MQ=255) gcgcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCAc < 1:131836/144‑1 (MQ=255) gcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACg > 6:159912/1‑147 (MQ=255) aCGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAg > 1:146966/1‑148 (MQ=255) | CTCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAG > NC_002947/2386237‑2386531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |