| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,386,387 | G→T | 5.7% | A239A (GCC→GCA) | PP_2094 ← | nitrate‑binding protein NasS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,386,387 | 0 | G | T | 5.7% | 435.0 / 10.2 | 134 | A239A (GCC→GCA) | PP_2094 | nitrate‑binding protein NasS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (67/59); new base T (4/4); total (71/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAGAAG > NC_002947/2386242‑2386534 | aaTGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCGAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGgcg > 5:339706/1‑149 (MQ=255)aaTGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg > 7:167997/1‑146 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCCCGTGCGCTga < 3:66571/149‑2 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGt > 5:181997/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTg > 2:318446/1‑149 (MQ=255) aGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTggg < 7:146235/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTggg > 8:174224/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgggg < 2:212097/149‑1 (MQ=255) ggCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGGTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTAGGGGCTTTGCTCGATGAATCGGGTGGCGGTGTGGTTCGCGTTGATCAGCGCGGGGTCGCTGGTGgtgttt > 8:117971/1‑147 (MQ=255) gggCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg < 1:318446/149‑1 (MQ=255) gCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCgg > 1:159292/1‑148 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCa > 5:103661/1‑148 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCa > 7:219746/1‑148 (MQ=255) aTGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCa > 1:8736/1‑147 (MQ=255) tGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCTGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAg < 1:53808/149‑1 (MQ=255) tGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgggg < 3:279934/134‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTg > 7:215963/1‑128 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTg < 8:215963/128‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa < 4:318674/145‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAcg > 2:151864/1‑149 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCACCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAcg > 3:126587/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGGGGTGTCCAAGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAcgcg > 5:356786/1‑149 (MQ=255) aGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGgc < 8:219746/149‑1 (MQ=255) tgtCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTAt < 7:202081/122‑1 (MQ=255) tgtCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTAt > 8:202081/1‑122 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCa < 1:259938/143‑1 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCa < 4:42224/148‑1 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAg > 7:324130/1‑149 (MQ=255) cAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGa > 7:296424/1‑149 (MQ=255) aGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAc > 2:145081/1‑149 (MQ=255) ggTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAcc < 1:145081/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTc > 6:52871/1‑149 (MQ=255) cgcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTcc > 4:328824/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCggg < 5:52871/147‑1 (MQ=255) ccTGAGCAGTTGCGAGGTGCTGCGTCGGATTTCCGGCCTTTGATCGATGAATCGGCTGGCCGTGAGCATCCCCTTGAACACCGCACGGGCGCTGTAGGCGTATTGCTCGGAAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTATTCAGGGTGAt > 6:206710/2‑149 (MQ=255) cTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCTCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATc < 4:126587/149‑1 (MQ=255) cTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATc > 8:200487/1‑149 (MQ=255) gCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc < 7:278543/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc < 1:151864/148‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc < 4:335073/148‑1 (MQ=255) ttGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc > 1:38541/1‑145 (MQ=255) ttGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGa < 8:296424/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCg < 8:59149/149‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAg < 4:148548/102‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGa < 4:176888/119‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGa > 3:176888/1‑119 (MQ=255) ggTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGAct < 6:339706/149‑1 (MQ=255) tgcGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGActggctg < 4:20589/149‑1 (MQ=255) cggcggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCtggt > 7:23824/1‑149 (MQ=255) cggcggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCtggt < 1:265629/149‑1 (MQ=255) cggcggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCtggt > 1:154118/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGc > 1:21328/1‑148 (MQ=255) 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aTCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGcc < 7:81750/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTgg < 3:103880/139‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTgg > 4:103880/1‑139 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCa > 4:142308/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAcc < 3:41616/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAcc < 3:179607/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgcg > 3:147216/1‑149 (MQ=255) tCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAg < 6:273090/116‑1 (MQ=255) tCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAg < 3:340946/149‑1 (MQ=255) gCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAggg > 8:16276/1‑149 (MQ=255) ccTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGc > 3:318371/1‑149 (MQ=255) cTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCt > 5:39648/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGAAGCGGGCGCAGGCCAGGAGCTGTTCCGGTTGATCCGGCCAGATCGACGTGATGGTGTACACGGTGAAGCATTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGTCt > 8:337493/1‑148 (MQ=255) cccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc < 3:55931/126‑1 (MQ=255) cccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc > 4:55931/6‑131 (MQ=255) ccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCGAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc < 2:264042/126‑1 (MQ=255) ccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCa > 7:54466/5‑149 (MQ=255) acAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACTGCGTCGGCGGCCCAggg < 8:239141/141‑1 (MQ=255) gcgcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCAc > 2:131836/1‑144 (MQ=255) gcgcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCAc < 1:131836/144‑1 (MQ=255) gcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACg > 6:159912/1‑147 (MQ=255) cACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTAGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACg > 5:302256/1‑146 (MQ=255) aCGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAg > 1:146966/1‑148 (MQ=255) cGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAGaa < 1:313723/149‑1 (MQ=255) gggCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc < 7:65753/118‑1 (MQ=255) | AATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAGAAG > NC_002947/2386242‑2386534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |