Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,456,997 | G→T | 7.4% | R23L (CGC→CTC) | PP_2150 → | thiamine biosynthesis lipoprotein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,456,997 | 0 | G | T | 7.4% | 389.1 / 15.7 | 121 | R23L (CGC→CTC) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/49); new base T (4/5); total (67/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATC > NC_002947/2456850‑2457145 | atCCTACAGTATTATCGCGGCCCCTGTATGAGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCTGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAgcgc < 8:20512/148‑1 (MQ=255) cTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCAGGCGCTccag > 4:26668/1‑147 (MQ=255) tACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTgg > 4:216283/1‑149 (MQ=255) cAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggt > 1:59541/1‑149 (MQ=255) aGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtg > 6:14169/1‑149 (MQ=255) aGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtg < 3:346780/149‑1 (MQ=255) aGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtg < 5:143652/149‑1 (MQ=255) ggATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTgg > 7:153656/1‑145 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtggt > 3:119946/1‑149 (MQ=255) gATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCAGGCGCTCCAGggtggg < 2:281871/149‑2 (MQ=255) ttATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTcc > 3:77866/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtgggatagg > 1:128796/1‑143 (MQ=255) gCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTgg > 2:164346/1‑137 (MQ=255) cTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCAt > 1:214549/1‑149 (MQ=255) gCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATgg > 4:174764/1‑149 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg < 5:14169/149‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg > 7:133554/1‑147 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATggg > 3:175501/1‑147 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcag < 3:216283/149‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcag > 7:284420/1‑147 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCagcagc < 8:283623/148‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTggg < 4:175521/125‑1 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTAc < 7:280276/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTAc < 2:59541/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACa < 8:133554/148‑1 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTggg > 1:45569/1‑121 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTggg < 2:45569/121‑1 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGTAGCTACAGCa > 7:106376/1‑149 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCa < 1:292529/149‑1 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAg > 6:277331/1‑148 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAg < 7:69209/148‑1 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGt < 4:119946/149‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagc > 2:282166/1‑132 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagc < 1:282166/132‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGt < 3:133229/148‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTa > 1:26231/1‑149 (MQ=255) gcgAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACg > 6:189432/1‑149 (MQ=255) cgAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGt > 3:232454/1‑149 (MQ=255) agGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCcgc > 2:6146/1‑148 (MQ=255) cAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGcc < 6:335751/149‑1 (MQ=255) gCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGcc > 8:112348/1‑149 (MQ=255) gCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGCGGcc > 7:337434/1‑149 (MQ=255) gCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCACCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGACTCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGcc > 3:108887/1‑149 (MQ=255) ccGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCt < 8:18700/149‑1 (MQ=255) ccGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCt > 6:128191/1‑149 (MQ=255) cGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCGGCTGAAACCAAGCCCCCCCCGTGGAGCGCATGGGTGGACCGCCAATGGCCACCAGAAACAGAAACAATAACGACCGCGCCCATGGTGCCCCGc > 1:98787/1‑149 (MQ=255) gagaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGc < 8:284420/149‑1 (MQ=255) aCCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGcc < 4:77866/149‑1 (MQ=255) cccTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGc > 7:215408/1‑147 (MQ=255) cTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGTAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAg > 4:293743/1‑149 (MQ=255) cTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAg < 3:174764/149‑1 (MQ=255) cTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTAGCCCGCTGCCGGCCCAg > 1:123108/1‑149 (MQ=255) tACTGTGCGCACAGCCCTACTGTACATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTCCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCACCAGCTACAGCAACCAGAACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAgg > 7:65444/1‑149 (MQ=255) gtgCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCt < 8:189590/134‑1 (MQ=255) gtgCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCt > 7:189590/1‑134 (MQ=255) tgCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCAACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGc < 7:281356/147‑1 (MQ=255) gcACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATg < 5:277331/149‑1 (MQ=255) aGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGcc > 8:108373/1‑133 (MQ=255) aGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGcc < 7:108373/133‑1 (MQ=255) gCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGt < 5:189432/149‑1 (MQ=255) gCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGt < 6:358423/149‑1 (MQ=255) tACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggt > 5:71533/1‑113 (MQ=255) tACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggt < 6:71533/113‑1 (MQ=255) gTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCg > 1:134399/1‑121 (MQ=255) gTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCa > 1:313968/1‑149 (MQ=255) ttCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAAGTGCAGATGGCGGTGGAAACCAt > 3:238371/1‑149 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCATCATCTACATCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc < 2:214549/148‑1 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATcc > 8:164635/1‑149 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc < 3:249637/148‑1 (MQ=255) tgctgcTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCAc > 2:232249/1‑149 (MQ=255) tgctACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGa > 2:134624/1‑148 (MQ=255) ctACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACAt > 8:47342/1‑149 (MQ=255) tACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGCGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATc < 8:337434/149‑1 (MQ=255) cTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGa > 1:76733/1‑149 (MQ=255) cTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGa < 2:123108/149‑1 (MQ=255) tCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac > 4:351059/1‑149 (MQ=255) tCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac > 4:287510/1‑149 (MQ=255) tCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCAAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac > 8:46596/1‑149 (MQ=255) aCCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGacca > 4:289189/1‑149 (MQ=255) tGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCacta > 1:46391/1‑149 (MQ=255) gCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCt > 4:117054/1‑91 (MQ=255) aaCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGa < 6:229797/137‑1 (MQ=255) aaCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGa > 5:229797/1‑137 (MQ=255) aaCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTc > 4:66068/1‑149 (MQ=255) aCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTc > 1:168924/1‑148 (MQ=255) aCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCg > 7:71790/1‑149 (MQ=255) aCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCg < 2:293946/149‑1 (MQ=255) cAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCa > 7:103690/1‑125 (MQ=255) cAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCa < 8:103690/125‑1 (MQ=255) gtcggaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGAc > 4:58953/7‑148 (MQ=255) accACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac < 5:85686/128‑1 (MQ=255) ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACcgc > 8:274882/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCgcgg > 1:214923/1‑149 (MQ=255) cccTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCgcggc > 1:162746/1‑149 (MQ=255) cccAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCgcggc < 3:58953/149‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGAtt < 2:128796/148‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTcc < 1:232249/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGTAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCa < 3:293743/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCa < 8:278168/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATc < 3:289189/149‑1 (MQ=255) | CTCCTACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGC‑‑CTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATC > NC_002947/2456850‑2457145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |