Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,724,716 | A→T | 7.9% | intergenic (‑125/+23) | azlC ← / ← PP_2386 | branched‑chain amino acid transport protein AzlC/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,724,716 | 0 | A | T | 7.9% | 189.9 / 4.8 | 63 | intergenic (‑125/+23) | azlC/PP_2386 | branched‑chain amino acid transport protein AzlC/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/29); new base T (2/3); total (31/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 |
CTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTG > NC_002947/2724570‑2724861 | cTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAgg < 3:156535/149‑1 (MQ=255) ggcgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTGCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAggc < 5:109/147‑1 (MQ=255) gccgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACTGGGCAGGGGATGGATTGAACGATCTTGCTGGTCGAGTCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGCCCAACTTACAACAGGGCCGCAAgcagg > 8:243652/3‑145 (MQ=255) gcgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAggcggc > 6:157990/1‑149 (MQ=255) cgggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCCTTGCGGcc < 1:106415/149‑1 (MQ=255) gggcgATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTTGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGccc > 6:140284/1‑149 (MQ=255) tgtgGGGCATGATGGCTGCATGACGTCTACGTGGCAGTCCAGCATGTCAGACGTGTCAGGGGATGTCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCCTTGCGGccctgttgt < 1:170907/149‑7 (MQ=255) gtgGGGCAGGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATg < 8:288832/148‑1 (MQ=255) cATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTgg > 4:69767/1‑149 (MQ=255) ggCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCCTTGCGGccct > 5:103336/1‑130 (MQ=255) ggCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCCTTGCGGccct < 6:103336/131‑2 (MQ=255) gCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATg < 5:157990/148‑1 (MQ=255) cATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGggcgg < 1:232905/149‑1 (MQ=255) aTGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGggcggc > 8:282338/1‑149 (MQ=255) aTGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGggc < 3:197750/146‑1 (MQ=255) aTGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGggc > 4:197750/1‑146 (MQ=255) aCGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTg < 2:55519/148‑1 (MQ=255) tACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTcag > 8:21079/1‑148 (MQ=255) aggcaggcCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTcagc < 5:320335/145‑1 (MQ=255) aggcaggcCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTcagc > 6:320335/1‑145 (MQ=255) aggcCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTgg > 8:267904/1‑121 (MQ=255) aggcCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTgg < 7:267904/121‑1 (MQ=255) aggcCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTg > 2:311076/1‑149 (MQ=255) ccAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTgcgc > 3:68101/1‑149 (MQ=255) cATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGtt < 4:13854/149‑1 (MQ=255) aTGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTg > 4:348244/1‑149 (MQ=255) tGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTgc > 1:132870/1‑149 (MQ=255) aCAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTgc > 7:154221/1‑147 (MQ=255) aCAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTgc < 8:154221/147‑1 (MQ=255) cAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCa < 2:255361/149‑1 (MQ=255) ggggCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCAt < 2:132870/149‑1 (MQ=255) ggCAGGGGATGGCTTGAACGTTCTTGCTGGTCGTGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCTACTGACATCAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTTGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCAt < 3:69767/147‑1 (MQ=255) cAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGAt < 1:311076/149‑1 (MQ=255) ggggATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGTTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGt < 7:274740/149‑1 (MQ=255) ggggATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGt < 7:243652/149‑1 (MQ=255) gCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACgg < 7:166007/148‑1 (MQ=255) cTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCt > 4:282734/1‑149 (MQ=255) gCTGGTTGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTgca < 5:140284/143‑1 (MQ=255) gCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGc > 7:299498/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTc < 3:348244/147‑1 (MQ=255) tCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTg > 7:59358/1‑149 (MQ=255) gCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCgctg < 7:21079/149‑1 (MQ=255) gtTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCtgt > 6:353443/1‑149 (MQ=255) ttCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCtgt < 5:353443/148‑1 (MQ=255) cGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAgg > 6:17601/1‑131 (MQ=255) cGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAgg < 5:17601/131‑1 (MQ=255) gTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGt > 2:85135/1‑149 (MQ=255) cAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAg > 5:67481/1‑149 (MQ=255) aaCCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAg < 7:282338/148‑1 (MQ=255) ccTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTc < 3:282734/149‑1 (MQ=255) gCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTc < 7:87633/141‑1 (MQ=255) gCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTc > 8:87633/1‑141 (MQ=255) cAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAgg > 3:225006/1‑149 (MQ=255) aaCTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGc > 5:285096/1‑149 (MQ=255) aaCTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGc > 4:194349/1‑149 (MQ=255) aCTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCg < 8:59358/149‑1 (MQ=255) cTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCgg > 2:274621/1‑149 (MQ=255) acaacaGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTac > 8:328883/1‑149 (MQ=255) ttcggggCCGCCTTGCGGCCCTGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTacac > 1:357157/5‑149 (MQ=255) aacaGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTacac > 1:247544/1‑149 (MQ=255) aGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTc > 6:324002/1‑149 (MQ=255) ccGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGcc < 6:67481/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTg < 8:299498/149‑1 (MQ=255) | CTTGGCGGGCGATGTGGGGCATGATGGCTGCATGACGGCTACGAGGCAGGCCAGCATGACAGACGGGGCAGGGGATGGCTTGAACGATCTTGCTGGTCGAGGCGTGTTCGTCTCAACCTCAGTGGCCAACTGACAACAGGGCCGCAAGGCGGCCCCGAATGACCCTGGGTTATGGGCGGCTGGTCAGCAGCTGTTGCGCCGTTGCGCAGCCATTGATGTCTACGGCTTTCTGCAGCAGGCTCGTGCGCTGCTGTGGGTCGAGGTCGCCAAGCAGGCGGTACACCTCGGCCTG > NC_002947/2724570‑2724861 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |