| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,824,517 | G→T | 6.0% | E44* (GAG→TAG) ‡ | PP_2478 → | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,824,517 | 0 | G | T | 6.0% | 207.4 / 3.6 | 67 | E44* (GAG→TAG) ‡ | PP_2478 | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/30); new base T (2/2); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.82e-01 | |||||||||||
TTGAGGAGGCGTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGG > NC_002947/2824373‑2824661 | ttGAGGAGGCGTGAGATGAAAAAGCCCAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAggc < 3:93728/149‑1 (MQ=255) cGTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGc < 6:359469/149‑1 (MQ=255) cGTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCGCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGc < 3:187667/149‑1 (MQ=255) gTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTg > 6:53865/1‑144 (MQ=255) gTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTg < 5:53865/144‑1 (MQ=255) gTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCgg > 4:112086/1‑147 (MQ=255) tGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGTCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAg < 5:324296/149‑1 (MQ=255) gAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCTCGGCGGCTGCgctt < 8:271309/142‑4 (MQ=255) gAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCTCGGCGGCTGCgctt > 7:271309/1‑139 (MQ=255) aaaaaGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGCTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCt > 3:290116/1‑149 (MQ=255) ccgCCTACCGCAGTGACTGGTGTTATGTCCCGTCGCCGCCGCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCGCCGGGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAATGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTgg < 8:243140/147‑1 (MQ=255) aGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGt < 3:119418/149‑1 (MQ=255) gCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTGTGCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGt < 1:257126/149‑1 (MQ=255) tAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTg < 4:43200/143‑1 (MQ=255) tAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTg > 3:43200/1‑143 (MQ=255) tAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGa > 4:338557/1‑147 (MQ=255) tAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGa < 3:338557/147‑1 (MQ=255) aCGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTg < 5:248938/141‑1 (MQ=255) aCGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCCAGGCGGCTGCGGCAGGGCCGCTTggatctcg > 6:248938/1‑142 (MQ=255) gAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTc > 1:153245/1‑149 (MQ=255) aCTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCcgcg > 7:176835/1‑147 (MQ=255) ttGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAgg < 8:303681/147‑1 (MQ=255) gATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGAAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGAAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGAGGAGGGtt > 2:32919/1‑148 (MQ=255) tGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACgg < 3:112086/148‑1 (MQ=255) gTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTg > 7:10668/1‑149 (MQ=255) tCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGc > 7:11353/1‑149 (MQ=255) gTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGGTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCGTGGGGATCCCTACGCGGAGGGTTACGGTGCCatt > 3:301066/1‑149 (MQ=255) ccgccTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATGACTCCGCGGAGGGTTACGGTGACTTTGTcc > 6:300477/1‑149 (MQ=255) ccgccTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTcc > 1:70585/1‑149 (MQ=255) cgccTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGt < 7:173020/138‑1 (MQ=255) cgccTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGt > 8:173020/1‑138 (MQ=255) ttGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCAtt > 1:213977/1‑147 (MQ=255) ttGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCAtt < 2:213977/147‑1 (MQ=255) ttGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTgg > 7:24152/1‑149 (MQ=255) cAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGccc < 8:10668/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑a < 4:339043/149‑1 (MQ=255) gCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑At > 8:102500/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATg > 8:141014/1‑149 (MQ=255) aGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATgg < 8:176835/149‑1 (MQ=255) gtttCGCCGTGAGTGGCTTGGTGTTGATTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTg < 4:290116/146‑1 (MQ=255) gTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTg < 2:153245/149‑1 (MQ=255) gTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTg < 7:141014/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCACATTGGCCACG‑ATGGCGTGGTCACGGt > 5:188664/1‑148 (MQ=255) tgtTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCGCGGTGATCTCGCCGaa > 6:147214/1‑148 (MQ=255) ttGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGGCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTGCGCATTGGCCCCGAATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGaaaa < 1:32919/149‑1 (MQ=255) ttGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAAt > 3:138179/1‑149 (MQ=255) aGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTg < 7:102500/148‑1 (MQ=255) ccTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATg > 8:87258/1‑149 (MQ=255) cTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATgg > 2:343504/1‑149 (MQ=255) tGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGTAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATggg > 5:361934/1‑149 (MQ=255) gCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGc < 8:24152/148‑1 (MQ=255) aCCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCg > 3:311459/1‑104 (MQ=255) aCCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCg < 4:311459/104‑1 (MQ=255) cgccgcTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTATGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGt > 2:260367/1‑149 (MQ=255) cgcTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTgcg > 1:70975/1‑149 (MQ=255) 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cAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTa > 5:32544/1‑149 (MQ=255) cAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTa < 2:149364/149‑1 (MQ=255) aaaaGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGCCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTAt > 6:8920/1‑149 (MQ=255) aaaGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTAtt < 4:60461/149‑1 (MQ=255) gcAGCCGCCTCGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTAtt < 4:175829/144‑1 (MQ=255) gcAGCCGCCTCGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTAtt > 3:175829/1‑144 (MQ=255) gccgccGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGCCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCatgat < 5:8920/149‑1 (MQ=255) cgccgAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATgg < 4:301066/149‑1 (MQ=255) cgccgAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATgg > 4:157677/1‑149 (MQ=255) | TTGAGGAGGCGTGAGATGAAAAAGCCTAACGAAGTGACTGTTGATATGTCCCGTCGCCGCCTCTTGCAGGGCAGCGGTATCGCCCTCAGTGGCTTGGTGTTGAGTACCTGGCTACCGCCGCTGGTG‑GCCAAAAGCGCAGCCGCCGAGGCGGCTGCGGCAGGTCGGCTTGGTGATCACTCCGCGGAGGGTTACGGTGCCTTTGTCCGCATTGGCCCCG‑ATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGG > NC_002947/2824373‑2824661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |