Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,884,812 | C→G | 9.5% | P93A (CCG→GCG) ‡ | PP_2540 → | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,884,812 | 0 | C | G | 9.5% | 186.8 / 8.9 | 63 | P93A (CCG→GCG) ‡ | PP_2540 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/31); new base G (2/4); total (28/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
TCTGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCA > NC_002947/2884664‑2884953 | tctGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGcc > 8:101784/1‑149 (MQ=255) ggAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGc > 7:76905/1‑149 (MQ=255) gatcAGACAGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACAGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGCCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGCTCGACATACTGGTCAACAACGCCGGTCGCCCGc > 4:271645/4‑148 (MQ=255) gAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGccc < 4:113957/146‑1 (MQ=255) cAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCAcc > 1:168318/1‑149 (MQ=255) aGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCg < 2:242178/149‑1 (MQ=255) aGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCg > 6:92051/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCggg < 2:134285/149‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGAGGTGCGCAGGGCCGGCCCGGGAATCGAGGGCCATCCCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGGTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCggcg < 8:150945/149‑3 (MQ=255) cGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCggcgt < 1:350276/149‑4 (MQ=255) cGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg > 8:3638/1‑148 (MQ=255) aatcGAGTTGCTCAGGTCCTGCCCGGTAATCGAGTTCCATACCGTGCCAGGAGTTGTTGCCGATCCCCCGGGGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGTTCGACATTCTGCTCAACAACGCCGGGTGCCCGCCACCGGGGGACt < 4:197445/146‑1 (MQ=255) aGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCggcgttgtt < 2:168318/149‑8 (MQ=255) aGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACtt < 4:298072/149‑1 (MQ=255) cGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 7:163908/142‑1 (MQ=255) cGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg > 8:163908/1‑142 (MQ=255) aGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGt > 2:234867/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGAtt < 1:234867/148‑1 (MQ=255) gggCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTGTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTggggg < 6:74824/149‑1 (MQ=255) cGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACtt < 7:266384/127‑1 (MQ=255) cGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACtt > 8:266384/1‑127 (MQ=255) gggAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACt > 4:93533/1‑149 (MQ=255) ggAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTg < 5:92051/149‑1 (MQ=255) gAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTgg < 3:93533/149‑1 (MQ=255) aTCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGc < 8:76905/148‑1 (MQ=255) tCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGgcg > 7:168215/1‑149 (MQ=255) cATCCCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCAGCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCt < 5:92650/149‑1 (MQ=255) cATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCTAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCTGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGctct < 4:115164/149‑1 (MQ=255) cATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCt > 8:292154/1‑149 (MQ=255) ggCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACAt < 1:69970/149‑1 (MQ=255) gCGATGTTGCCGATCCGAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATg < 7:9417/149‑1 (MQ=255) gCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGTGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATg > 1:57277/1‑149 (MQ=255) gCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATg < 7:3638/149‑1 (MQ=255) cGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGc < 5:172693/149‑1 (MQ=255) tGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCa > 2:182232/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGc < 1:59504/137‑1 (MQ=255) gTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGc > 2:59504/1‑137 (MQ=255) ttGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCAc < 7:101784/148‑1 (MQ=255) ccGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGcc > 6:102830/1‑148 (MQ=255) ccAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGa < 5:81711/148‑1 (MQ=255) ccAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTAGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAg > 7:227975/1‑149 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGc < 3:271645/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGa < 1:60456/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGAt < 5:102830/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATc > 6:258926/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTAGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATc > 1:39760/1‑148 (MQ=255) gcCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAg > 5:313426/1‑149 (MQ=255) gcTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCggtgg < 5:215286/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGgcgc > 7:145155/1‑100 (MQ=255) ttGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGgcgc < 8:145155/100‑1 (MQ=255) ggcggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatg > 6:37358/1‑149 (MQ=255) ggcggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGat < 2:294259/148‑1 (MQ=255) cTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatgg < 8:227975/149‑1 (MQ=255) gTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTgg > 6:325593/1‑149 (MQ=255) tCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCACGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGTGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCAATCGAGCTGATAAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGcgtcgt > 4:186387/1‑149 (MQ=255) gACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGTTTGGGGGCGGGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGtt < 3:186387/148‑1 (MQ=255) aCATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGtttt > 4:47445/1‑149 (MQ=255) gTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggt < 5:258926/149‑1 (MQ=255) gTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTAGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggt < 2:39760/149‑1 (MQ=255) acaacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggtggt > 6:152933/1‑148 (MQ=255) acaacGCCGGTGGCCCGCCACAGGGGGACTTACGTGATTGGGGGCTTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGACGAGCGTGGTGTTGGCCGggtggt > 8:282295/1‑148 (MQ=255) aacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCg > 6:369818/1‑105 (MQ=255) aacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCg < 5:369818/105‑1 (MQ=255) ccccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAata > 5:262191/3‑149 (MQ=255) cGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCa < 3:47445/149‑1 (MQ=255) | TCTGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCA > NC_002947/2884664‑2884953 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |