| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,889,941 | G→A | 6.1% | A317T (GCT→ACT) | gabP‑II → | gamma‑aminobutyrate permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,889,941 | 0 | G | A | 6.1% | 194.1 / 2.0 | 65 | A317T (GCT→ACT) | gabP‑II | gamma‑aminobutyrate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/26); new base A (2/2); total (37/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
ACGACCCGCACCTGGGTGTTTCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCAGCGAGA > NC_002947/2889801‑2890088 | aCGACCCGCACCTGGGTGTTTCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGGGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCgcgc < 6:139626/149‑1 (MQ=255) cccGCACCTGGGTGTTTCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGc > 1:197753/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGTTTCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTtct‑c > 5:110553/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGTTTCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGATGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTtct‑c > 8:171716/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGcc > 5:75916/1‑148 (MQ=255) tGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGc > 6:3111/1‑148 (MQ=255) gcTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGAcgc > 5:133590/1‑149 (MQ=255) gcTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGAcgc < 6:133590/149‑1 (MQ=255) tACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGttct > 4:197737/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCCGGGTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCATGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGttct > 1:103146/1‑148 (MQ=255) ccTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGcc > 6:293999/1‑138 (MQ=255) ccTGGAGCTGCGGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGcc < 5:293999/138‑1 (MQ=255) cTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCaa < 5:3111/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCaa < 2:197753/149‑1 (MQ=255) tGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGttcttc > 3:213450/1‑146 (MQ=255) gTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccg < 7:171716/149‑1 (MQ=255) gTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccg < 2:103146/149‑1 (MQ=255) aTGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggt > 5:138113/1‑149 (MQ=255) tGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggt < 4:213450/148‑1 (MQ=255) tGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggt < 6:110553/148‑1 (MQ=255) gTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGtaccggtgtaccggtg > 8:138871/1‑148 (MQ=255) ttGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATTCTGTTCT‑CCCTCGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCaa > 2:290630/1‑116 (MQ=255) ttGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTAccggtgtaccggtgta > 2:358207/1‑149 (MQ=255) ctgatcaACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTaccggtgtaccggtgt < 4:295362/147‑1 (MQ=255) atgaACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTAcgc < 7:227717/149‑1 (MQ=255) atgaACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTAcgc > 8:227717/1‑149 (MQ=255) tgaACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggtgta > 6:180510/1‑137 (MQ=255) tgaACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggtgta < 5:180510/137‑1 (MQ=255) gtggtgCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATgg < 1:358207/148‑1 (MQ=255) gtgCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGACTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTGCTTCAATAGCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTAGGCGATCATGGGTTc > 4:232569/1‑149 (MQ=255) tgCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGATGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCg > 2:357124/1‑149 (MQ=255) gCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGt > 6:223351/1‑149 (MQ=255) gCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCACTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGt > 2:103348/1‑149 (MQ=255) gCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCACTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGt > 2:247903/1‑149 (MQ=255) tGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTgc > 7:27794/1‑149 (MQ=255) aCTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTgc < 6:75916/147‑1 (MQ=255) tCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCCGAGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgt > 8:126148/1‑149 (MQ=255) c‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtgg < 1:356943/149‑1 (MQ=255) gcagcTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGGACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtggccgtg < 4:65118/149‑1 (MQ=255) gcagcTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCATCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtggccgtg < 4:60280/149‑1 (MQ=255) gcagcTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGAGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACA‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtggccgtg > 8:305664/1‑149 (MQ=255) gcagcTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCACTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtggccgtg < 1:247903/149‑1 (MQ=255) cagcTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCACTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGGCGTCGTTCTTCAAGATCACCGCGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtggccgtg < 1:103348/149‑1 (MQ=255) cTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCgg > 5:323193/1‑96 (MQ=255) cTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCgg < 6:323193/96‑1 (MQ=255) tGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTCCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGt < 5:246528/126‑1 (MQ=255) tGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTACT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGt > 6:246528/1‑126 (MQ=255) ccTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggtgtaccg > 3:14356/1‑106 (MQ=255) ccTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGgtaccggtgtaccg < 4:14356/106‑1 (MQ=255) ccTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTAtg < 8:27794/147‑1 (MQ=255) cTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATggg < 3:92920/122‑1 (MQ=255) cTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATggg > 4:92920/1‑122 (MQ=255) tGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCa > 5:89487/1‑149 (MQ=255) tGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCATGGCCGTGGTATGTGCa > 6:118061/1‑149 (MQ=255) tcCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTgc > 7:87332/1‑123 (MQ=255) tcCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTgc < 8:87332/123‑1 (MQ=255) tcCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGAt > 5:332760/1‑149 (MQ=255) cGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCTACCCTGGCCCGGCGTGGCGACGCGCCGGCGTTGTTCAGGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCGGTGGTTTGTGCTTTgtt > 1:37474/1‑146 (MQ=255) ggCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCaa < 3:197737/149‑1 (MQ=255) cTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCa < 5:223351/149‑1 (MQ=255) cacCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCAGc < 2:37474/148‑1 (MQ=255) acCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCACAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCAGCg > 7:77550/1‑148 (MQ=255) cGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCgccgtggccgtg > 6:269117/1‑121 (MQ=255) cGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCAGCgaga > 7:100204/1‑149 (MQ=255) cGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCAGCgaga > 5:134412/1‑149 (MQ=255) | ACGACCCGCACCTGGGTGTTTCTGGCTATGGCGCTTATCGCCGTACCCTGGAGCTGCTGGGGGTGCCGTATGCCGAGCTGTTGATGAACTTCGTGGTGCTGACTTCC‑‑GTGAGCAGCTGCCTGATCTCCGGCCACTACACCGCTTCGCGCATGCTGTTCT‑CCCTGGCCCAGCGTGGCGACGCGCCGTCGTTCTTCAAGATCACC‑CGCGCCGGTACCGGTGTACCGGTGTACGCGATCATGGGTTCGTGCGCCGTGGCCGTGGTATGTGCATTGATCAACTTCAGCGAGA > NC_002947/2889801‑2890088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |