| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,933,449 | T→C | 6.4% | E218G (GAA→GGA) | PP_2566 ← | leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,933,449 | 0 | T | C | 6.4% | 229.6 / 3.5 | 78 | E218G (GAA→GGA) | PP_2566 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/35); new base C (2/3); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 | |||||||||||
GTCATAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGAGCCTGCTGT > NC_002947/2933307‑2933596 | gTCATAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAgcgc > 7:43751/1‑149 (MQ=255) cATAGGGGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGAAATCCAgcgcct < 4:116148/149‑3 (MQ=255) aTAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGAAATCCAgcgc > 1:91335/1‑146 (MQ=255) aTAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGAAATCCAgcgc < 2:86612/146‑1 (MQ=255) aTAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGAAATCCAgcgc < 2:91335/146‑1 (MQ=255) aTAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGAAATCCAgcgc > 1:86612/1‑146 (MQ=255) gTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGTTCAATGCCTGGACGCTCAAGGCCTGACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGGTGGATTTCAGCGCGATTGgc > 7:346882/1‑149 (MQ=255) gTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGgc > 8:100461/1‑149 (MQ=255) gTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGgc > 5:352033/1‑149 (MQ=255) gTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGgc < 6:243105/149‑1 (MQ=255) ggTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTCCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCt > 4:33697/1‑149 (MQ=255) gTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCtt > 5:115655/1‑149 (MQ=255) tGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTc < 3:176643/149‑1 (MQ=255) aGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCAt < 7:218862/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGt < 3:250761/149‑1 (MQ=255) tGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGtt > 6:185281/1‑149 (MQ=255) gTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCaa < 6:254030/149‑1 (MQ=255) gCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAg > 4:181682/1‑147 (MQ=255) gCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCa < 7:100461/149‑1 (MQ=255) acaGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAAGGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAg > 7:134268/1‑145 (MQ=255) gCTGTGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATgg < 8:101462/134‑1 (MQ=255) gCTGTGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATgg > 7:101462/1‑134 (MQ=255) gcgcAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGCCCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCt > 5:244402/1‑149 (MQ=255) cgcAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAACGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCtt < 8:134268/149‑1 (MQ=255) gcAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCtt > 1:115321/1‑148 (MQ=255) gcAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCACCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCATGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCtt > 6:204933/1‑148 (MQ=255) cAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGa > 3:314674/1‑149 (MQ=255) cgcATCGAGCCCGGCCTTTCTCAGCAGTCCTATGAGCCTGGCGATCAATGCCAGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTCCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAAc < 8:346882/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGtt < 5:204933/149‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGcc > 2:125966/1‑147 (MQ=255) cccGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGcc > 4:58943/1‑147 (MQ=255) ccGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAg < 7:13935/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGt > 7:22781/1‑149 (MQ=255) ttGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCt < 6:30102/126‑1 (MQ=255) ttGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCt > 5:30102/1‑126 (MQ=255) gCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAgcg > 2:363186/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAgc < 6:115655/148‑1 (MQ=255) cTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAgcgc > 2:56501/1‑149 (MQ=255) agcagGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGcc < 5:185281/147‑1 (MQ=255) gAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGa > 1:92750/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGAc > 3:134288/1‑148 (MQ=255) cTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGaa < 4:90392/149‑1 (MQ=255) tGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAg > 1:218352/1‑149 (MQ=255) cAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCa > 8:16807/1‑149 (MQ=255) gCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGt > 6:95002/1‑149 (MQ=255) ccTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGt > 4:253049/1‑148 (MQ=255) cTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGt > 5:136286/1‑147 (MQ=255) tGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCATTCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAg > 1:31961/1‑149 (MQ=255) tGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAg > 1:246380/1‑149 (MQ=255) gACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGATGGCGGACTTCGTCAg < 1:125966/147‑1 (MQ=255) gACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGc < 8:22781/149‑1 (MQ=255) cccTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCt < 6:244402/149‑1 (MQ=255) ccTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTg > 2:30381/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCt < 3:320772/144‑1 (MQ=255) aaGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCt > 4:320772/1‑144 (MQ=255) ggCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAggg < 1:56501/149‑1 (MQ=255) gCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAgggg < 6:136286/149‑1 (MQ=255) gCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAgggg > 1:59801/1‑149 (MQ=255) gCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAgggg < 4:134288/149‑1 (MQ=255) ccTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGc < 8:43751/149‑1 (MQ=255) ccTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGc < 5:203751/149‑1 (MQ=255) ccTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGc < 4:66508/149‑1 (MQ=255) tCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCgt > 3:78547/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCgtgt > 2:68697/1‑149 (MQ=255) gTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGc > 5:295379/1‑149 (MQ=255) ttCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCt < 2:246380/149‑1 (MQ=255) cTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCa < 4:78547/149‑1 (MQ=255) tGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCGTGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAg > 6:274437/1‑149 (MQ=255) cAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAgcg < 6:295379/149‑1 (MQ=255) gACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGtt < 2:92750/149‑1 (MQ=255) aCAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTg < 3:33697/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGa < 5:95002/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGa < 1:68697/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGa < 2:218352/149‑1 (MQ=255) gcTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGc > 7:277713/1‑122 (MQ=255) gcTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGc < 8:277713/122‑1 (MQ=255) cTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGAGcc < 2:59801/149‑1 (MQ=255) tGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGAGCct > 7:260280/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTTGTGAGCCTGCTGt < 3:253049/148‑1 (MQ=255) | GTCATAGGTGGGGTGAGGGCTGCCGTCGCACAGCTGCGCAAGCGCATCGAGCCCGGCCTTGCTCAGCAGGCCTTTGAGCCTGGCGATCAATGCCTGGACCCTCAAGGCCTCACGGTTCGCTGCAATCGACAGGCGCTGGATTTCAGCGCGATTGGCGCCTTCATGGGTTGCAAGCAGATGGTCTTGATAACGTTTGCCAAGGTCCAGCGCCCGACAATGCCTGACGAAGTCCGCCATCGTCAGGCCTGCCAGGGGCGTGTCGCTGCCAGCGGCGTTGGTGAGCCTGCTGT > NC_002947/2933307‑2933596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |