Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,179,892 | T→C | 5.5% | Q261R (CAG→CGG) ‡ | PP_2790 ← | sigma‑54 dependent sensory box protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,179,892 | 0 | T | C | 5.5% | 215.6 / 2.2 | 73 | Q261R (CAG→CGG) ‡ | PP_2790 | sigma‑54 dependent sensory box protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/32); new base C (2/2); total (39/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 |
GGCACGTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCGGGGATA > NC_002947/3179744‑3180035 | ggCACGTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCct < 5:324903/149‑1 (MQ=255) aCGTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCctgct < 8:23448/149‑1 (MQ=255) gTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCctgctg > 7:215524/1‑148 (MQ=255) gTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCtgctgc < 6:141561/149‑1 (MQ=255) gTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCtgctgc < 8:288314/149‑1 (MQ=255) aGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGtt > 2:262930/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCggg > 8:154501/1‑148 (MQ=255) tGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAg > 4:65254/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCAGGCGCTGCAggaag > 8:108015/1‑132 (MQ=255) tGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCAGGCGCTGCAggaag < 7:108015/135‑4 (MQ=255) tCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGATCACCACGGCGTGCGAACCGAGCCCCATCACGCGGTGTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCATGCTCCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGctgctg > 5:177879/1‑148 (MQ=255) aGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCa < 3:65254/148‑1 (MQ=255) gACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGcg > 8:153764/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGcggcc < 8:215524/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGcggcc > 3:98017/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTCCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGcggcc > 8:331967/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAg < 3:26359/122‑1 (MQ=255) aGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAg > 4:26359/1‑122 (MQ=255) ggCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGcggccgg > 7:140611/1‑149 (MQ=255) ggTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCa < 7:153764/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAgcgctg > 2:175024/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAgcgctg > 5:158871/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAgcgctgcgc > 8:65469/1‑149 (MQ=255) ccGTTCACCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAgcgctgcgc > 1:198708/1‑148 (MQ=255) ccAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCgg > 7:23348/1‑148 (MQ=255) ccggATAGGCAGTAAATTGTTCAGCTCGTCGTGCGAACCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCgg < 6:177879/145‑1 (MQ=255) cAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCAGGCGCTGCAggaa > 7:18530/1‑94 (MQ=255) cAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCAGGCGCTGCAggaa < 8:18530/96‑3 (MQ=255) cAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCAGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCgg > 6:339047/1‑147 (MQ=255) aGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAg < 7:65469/149‑1 (MQ=255) aTAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTc < 2:46494/149‑1 (MQ=255) aGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTc > 6:27798/1‑147 (MQ=255) gCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCa < 4:94687/141‑1 (MQ=255) gCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCa > 3:94687/1‑141 (MQ=255) gCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCcagc > 5:210946/1‑149 (MQ=255) gCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCcagc > 6:343616/1‑149 (MQ=255) aGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTc < 8:32417/92‑1 (MQ=255) aGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTc > 7:32417/1‑92 (MQ=255) aGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCcagcag > 5:75586/1‑149 (MQ=255) aGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCACCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCcagcag > 7:294898/1‑149 (MQ=255) tAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCt < 1:175024/149‑1 (MQ=255) aaaTTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTg > 5:95190/1‑149 (MQ=255) cTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCATCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCaa < 1:262930/148‑1 (MQ=255) tCACCACGGCGTGCGCGCCGAGCCGCATCACGCGGTGTTCTGCCCCCGGGCCTTCCTGCAGCGCCTGCGGCCGGTCCAGGGCCGGGCCCCGCTGCGGCAGCGGCCGGCCCCGCGCTGCGCGAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAgg > 5:264914/1‑149 (MQ=255) actgCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAgg < 4:206643/146‑1 (MQ=255) ggCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGt > 7:92372/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTgcgc < 3:348866/137‑1 (MQ=255) gCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTgcgc > 4:348866/1‑137 (MQ=255) gCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGtt < 8:23348/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGtt < 8:140611/149‑1 (MQ=255) cGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTg < 4:98017/149‑1 (MQ=255) cgagccgagcCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGc < 6:158871/148‑1 (MQ=255) cgagccgagcCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGc < 6:72383/148‑1 (MQ=255) cgagccgagcCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCg < 7:154501/149‑1 (MQ=255) ccgCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCaa < 3:72086/125‑1 (MQ=255) ccgCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCaa > 4:72086/1‑125 (MQ=255) cATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGc < 7:331967/149‑1 (MQ=255) cACGCGGTTCTCTGCACCCGGGCCTTCCTCCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCCGCGCTAACCGGCACGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACCCCtt < 8:92936/149‑1 (MQ=255) aCGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAg < 7:252156/119‑1 (MQ=255) aCGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAg > 8:252156/1‑119 (MQ=255) cgcgTTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑gg < 6:210946/149‑1 (MQ=255) cgGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGtt < 2:198708/149‑1 (MQ=255) cttcACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGAcc > 2:27427/1‑149 (MQ=255) ttcACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCg > 5:59112/1‑149 (MQ=255) ttcACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCg > 2:321822/1‑149 (MQ=255) cACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCgc < 5:339047/148‑1 (MQ=255) aCCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCgctg > 1:292933/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAgg > 4:119257/1‑109 (MQ=255) ccGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAgg < 3:119257/109‑1 (MQ=255) ccGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCgctgc > 1:301212/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCggg > 5:9319/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTTCGGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCgggg < 1:27427/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCgggg < 8:294898/148‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCgggg < 5:27798/148‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCggg < 1:321822/147‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCggg < 6:75586/147‑1 (MQ=255) aGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCGGGGa > 4:195769/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCGGGGata > 5:166842/1‑149 (MQ=255) | GGCACGTTGCACAACAGTGATGTCCTGGCAGGTCAGGACCAGGCCGGTACGTTCGCCGTTCTCCAGGATAGGCAGTAAATTGCTCACCACGGCGTGCGAGCCGAGCCGCATCACGCGGTTTTCTTCACCCGTGCCTTCCTGCAGCGCCTGCTGCAGGTCCAGTTCCGGGCACAGCTGCTGCAGCGGCCGGCCCAGCGCTGCGCTAACCGGCAGGTCCAGCAGCTGCGCAAGGGCAGGGTTGAGCGACTGCACCACGCCTT‑GGTTGTCGACCGCTGCTACGCCGGCGGGGATA > NC_002947/3179744‑3180035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |