Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,457,059 | T→G | 6.6% | E77A (GAG→GCG) | hbdH ← | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,457,059 | 0 | T | G | 6.6% | 237.8 / 7.5 | 76 | E77A (GAG→GCG) | hbdH | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/39); new base G (3/2); total (35/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.39e-01 |
ATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGC > NC_002947/3456912‑3457207 | aTGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTc < 4:213329/149‑1 (MQ=255) cccGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTcgc < 7:276838/148‑1 (MQ=255) cccGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTcgc < 2:147894/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGt < 6:110431/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCGAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACGCGAGTTCGGc < 5:1633/149‑1 (MQ=255) gcgcGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTg > 5:263766/1‑148 (MQ=255) cgcgTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATTCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGaa < 6:79162/149‑1 (MQ=255) cgcgTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGaa < 2:205629/149‑1 (MQ=255) cgcgTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCCGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGaa < 1:199395/149‑1 (MQ=255) gcgTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGaa > 1:55581/1‑148 (MQ=255) aaTACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGAt < 3:141901/149‑1 (MQ=255) aTACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATc < 6:263766/149‑1 (MQ=255) cGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTgg < 2:138384/149‑1 (MQ=255) ggCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGa < 3:252246/149‑1 (MQ=255) ccGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGAcc < 3:4212/149‑1 (MQ=255) ccGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGAc < 1:236281/148‑1 (MQ=255) ccGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGAc > 2:236281/1‑148 (MQ=255) aCAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGAt < 4:357613/139‑1 (MQ=255) aCAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGAt > 3:357613/1‑139 (MQ=255) gTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCg > 4:236176/1‑133 (MQ=255) gTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATcc > 7:182755/1‑148 (MQ=255) gggCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACGCGAGTTCGGcg < 2:87874/110‑2 (MQ=255) ggCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGt < 2:55581/149‑1 (MQ=255) tCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCggg > 3:269935/1‑149 (MQ=255) tGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGGGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGggtg < 7:224434/148‑1 (MQ=255) gTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCg < 5:135792/139‑1 (MQ=255) gTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCg > 6:135792/1‑139 (MQ=255) tCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGACGAAGGGGGGCGCCGAAAAACACTACGGCCAGGATGAACAAACACTCGATCATGACCACATCCTACAGGTCGGCCg > 1:297526/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGa > 3:119290/1‑119 (MQ=255) ccAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGa < 4:119290/119‑1 (MQ=255) ccAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGca > 1:119402/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGca > 3:288609/1‑149 (MQ=255) tttCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACaaa < 2:278140/101‑1 (MQ=255) tCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGAc > 8:263606/1‑123 (MQ=255) tCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGAc < 7:263606/123‑1 (MQ=255) gggAACTGCTCAACTGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCAcccc > 3:222359/1‑149 (MQ=255) gggAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCAcccc > 6:151011/1‑149 (MQ=255) tGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGAc < 6:301407/101‑1 (MQ=255) tGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGAc > 5:301407/1‑101 (MQ=255) tGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGAAGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGATCGGCCAGGTAGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGACGGCCGGGTGGTGGCCAACCTTCACCCCGTGCCg > 4:210324/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCt < 5:360390/84‑1 (MQ=255) ccGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCt > 6:360390/1‑84 (MQ=255) gTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTcc > 7:321724/1‑149 (MQ=255) tGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCg < 4:269935/149‑1 (MQ=255) cacaTGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCa > 8:87517/1‑149 (MQ=255) cacaTGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCATTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGcc > 5:124336/1‑106 (MQ=255) cacaTGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCATTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGcc < 6:124336/106‑1 (MQ=255) agaTGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGCC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGGTCGGGCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGGCAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAAGCTTCCCCACGAGCCGGGGAAGTTCCGGCAt > 6:69711/3‑149 (MQ=255) tGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGc > 1:317846/1‑108 (MQ=255) tGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGc < 2:317846/108‑1 (MQ=255) tGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCggg > 5:68442/1‑149 (MQ=255) aTACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGcc < 6:68442/149‑1 (MQ=255) tACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGcc < 8:321724/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCgg < 8:182755/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCgg < 2:119402/149‑1 (MQ=255) gttgttGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCAc < 4:288609/149‑1 (MQ=255) ttgttgACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCAc > 3:93017/1‑148 (MQ=255) ttgACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCaaa < 7:87517/149‑1 (MQ=255) ttgACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCaaa < 4:93017/149‑1 (MQ=255) tgACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCaaa < 2:293730/148‑1 (MQ=255) gACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGc < 3:332970/91‑1 (MQ=255) gACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGc > 4:332970/1‑91 (MQ=255) ccAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCCGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCg > 7:229933/1‑149 (MQ=255) aGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGtt < 5:151011/149‑1 (MQ=255) ggATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGtt > 3:300328/1‑148 (MQ=255) gAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACg < 1:326192/148‑1 (MQ=255) aC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGAt < 4:222359/149‑1 (MQ=255) tggccgAACGCGAGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGtt > 4:184843/3‑149 (MQ=255) tggccgAACGCGAGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGtt > 4:218387/3‑149 (MQ=255) tggccgAACGCGAGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCAGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGtt > 6:56305/3‑149 (MQ=255) cgccgAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGggtg < 8:196304/70‑1 (MQ=255) cgccgAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTg > 7:11137/1‑149 (MQ=255) gccgAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCg > 4:233343/1‑133 (MQ=255) gccgAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCg < 3:233343/133‑1 (MQ=255) ccgAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGgc > 7:164817/1‑149 (MQ=255) cTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAg > 5:178362/1‑149 (MQ=255) tCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACATCCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGc > 1:346553/1‑149 (MQ=255) | ATGCCCGGCAGCGCCAGGCGCGTGCCATGGAATACGGCCGACAGGTTCAGGGCGATGATCTTGTCCCAGCTTTCTGGCGGGAACTGCTCAACCGGTGCCACATGCTGGATACCGGCGTTGTTGACCAGGATGTCGAC‑‑‑‑‑‑‑GCCGCCGAACTCGCGTTCGGCCAGGTTGAACAAAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGC > NC_002947/3456912‑3457207 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |