Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,459,307 | C→G | 5.3% | R352P (CGG→CCG) | PP_3075 ← | transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,459,307 | 0 | C | G | 5.3% | 248.0 / 3.5 | 76 | R352P (CGG→CCG) | PP_3075 | transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/34); new base G (2/2); total (40/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.51e-01 |
GCGCTCCAGCACATTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTCGACCCGAC > NC_002947/3459159‑3459452 | gcgcTCCAGCACATTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGcc < 8:51124/149‑1 (MQ=255) tCCAGCACATTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCaa > 6:316848/1‑149 (MQ=255) cAGCACATTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCGGCAAcg > 3:261350/1‑149 (MQ=255) aGCACATTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAAcgg > 2:5671/1‑149 (MQ=255) cacaTTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAAcggcg < 2:140/149‑1 (MQ=255) acaTTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCGGCAAcggctg < 4:261350/149‑3 (MQ=255) caTTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAAcggcgg > 5:168637/1‑148 (MQ=255) aTTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTG‑CCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGaa > 3:227613/1‑148 (MQ=255) gcAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCCACGGCGGCACatc > 5:30500/1‑148 (MQ=255) cgcgAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACat < 4:241309/141‑1 (MQ=255) cgcgAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACat > 3:241309/1‑141 (MQ=255) gcgAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCgg < 1:205783/147‑1 (MQ=255) cgAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGgcag > 6:145811/1‑149 (MQ=255) gAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGgcag > 7:264832/1‑148 (MQ=255) gTTCCCCGGCCATCCATGCCTGCCCAGCAGTTGCTGCCCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTCGCTGCCCACCTCACCCAATATGGCCTCGCACAGCGCCGGCACGACCTCCATCCCATGCCGCAACGGCGGAACATCGATCTCCCGCACAt > 8:191037/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACAtt > 5:109241/1‑147 (MQ=255) cccGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGCTCGGCAGCACATTCAg > 4:277264/1‑149 (MQ=255) cGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGcc < 6:288632/149‑1 (MQ=255) catgcatgCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGt > 6:158289/1‑148 (MQ=255) gcatgcCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCg < 2:344152/143‑1 (MQ=255) gcatgcCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCg > 1:344152/1‑143 (MQ=255) catgcCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATa < 5:316848/148‑1 (MQ=255) catgcCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATa < 5:158289/148‑1 (MQ=255) gcCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAgg > 2:49037/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAgg < 1:382/148‑1 (MQ=255) gCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGgc > 3:35259/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAAcggcgg < 4:51123/106‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAAcggcgg > 3:51123/1‑106 (MQ=255) cagcagTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGgcgc < 8:264832/149‑1 (MQ=255) agcagTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGcgcg < 5:145811/149‑1 (MQ=255) agTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGaa < 4:35259/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGAGCATCCAATTTGGCCTCGCACAGCGCGTGCAGGGCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCTGAACATCGATCGGCATCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGTCGCGGAAgt < 6:321460/149‑2 (MQ=255) tgctgcGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACat > 3:51551/1‑103 (MQ=255) tgctgcGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACat < 4:51551/103‑1 (MQ=255) tgcGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGt > 7:253215/1‑124 (MQ=255) tgcGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGt < 8:253215/124‑1 (MQ=255) gcgcTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCg > 6:184208/1‑134 (MQ=255) gcgcTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCg < 5:184208/134‑1 (MQ=255) cgcTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCcgc > 6:292239/1‑149 (MQ=255) gcTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCcgcg > 5:271222/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCggg < 6:109241/147‑1 (MQ=255) aGCTTCCAGCTCGTACTGGCTG‑CCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCAt < 4:227613/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATgg > 5:287410/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATgg > 7:323075/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATgg < 7:30533/147‑1 (MQ=255) tCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTg > 8:51349/1‑149 (MQ=255) gTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGACGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCa < 1:5671/149‑1 (MQ=255) gTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCa < 1:49037/149‑1 (MQ=255) tACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAg > 4:336204/1‑149 (MQ=255) cTGGCTGCCCAGGTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGGCGGTAATACAGGTCGGCGCGGATGGCCCCGCGGGCCATGGGAGCCTGCAgg < 7:191037/148‑1 (MQ=255) cTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGt < 3:336204/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGa > 2:278371/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATg < 7:51349/147‑1 (MQ=255) cccAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATg < 6:168637/147‑1 (MQ=255) cAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAgg > 1:232327/1‑149 (MQ=255) aGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTggcgg > 3:8884/1‑149 (MQ=255) gCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTggcgg > 8:61393/1‑148 (MQ=255) aaTATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAat > 2:272516/1‑149 (MQ=255) aaTATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAat < 6:30500/149‑1 (MQ=255) gCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATgc < 3:87116/148‑1 (MQ=255) gCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATgc < 5:292239/148‑1 (MQ=255) ccTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATgcg > 6:124762/1‑148 (MQ=255) tCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGca > 2:309669/1‑148 (MQ=255) gCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACAt < 3:277264/149‑1 (MQ=255) ggCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATgcg > 5:252272/1‑134 (MQ=255) ggCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATgcg < 6:252272/134‑1 (MQ=255) gCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCgcag > 7:99496/1‑148 (MQ=255) gTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTggcg < 3:306065/118‑1 (MQ=255) gTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTggcg > 4:306065/1‑118 (MQ=255) ctccAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGt > 4:341911/1‑149 (MQ=255) tccAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGtt > 4:188972/1‑149 (MQ=255) tccgCCGTTGCGGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTc > 1:145418/4‑149 (MQ=255) ccgCCGTTGCGGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTc < 2:145418/146‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTc > 2:211557/1‑148 (MQ=255) cAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTc < 1:278371/148‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTcgac < 1:272516/149‑1 (MQ=255) gCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTcgacccgac < 6:287410/148‑1 (MQ=255) | GCGCTCCAGCACATTGCGCAGCTCGCGAATGTTCCCCGGCCATGCATGCCTGGCCAGCAGTTGCTGCGCTTCAGCTTCCAGCTCGTACTGGCTGCCCAGCTCAGCCAATATGGCCTCGCACAGCGCGGGCAGGTCCTCCAGCCGTTGCCGCAACGGCGGAACATCGATCGGCAGCACATTCAGCCGGTAATACAGGTCGGCGCGGAAGGCCCCGCGGGCCATGGCAGCCTGCAGGTCGATGGAGGTGGCGGCAATGATGCGCACATCGCTGCGCAGCATCTGGTTCGACCCGAC > NC_002947/3459159‑3459452 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |