| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,520,081 | T→A | 5.4% | intergenic (+700/‑180) | PP_5580 → / → PP_5582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,520,081 | 0 | T | A | 5.4% | 234.1 / 2.3 | 74 | intergenic (+700/‑180) | PP_5580/PP_5582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/34); new base A (2/2); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
GCTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGT > NC_002947/3519933‑3520227 | gCTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAAtgcttgct > 2:149211/1‑149 (MQ=255) cTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAAtgcttgct > 3:223822/1‑148 (MQ=255) gACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATg < 5:73112/148‑1 (MQ=255) gCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTcc > 5:272078/1‑149 (MQ=255) gCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTcc > 4:121313/1‑149 (MQ=255) ttAGGGCGTCTTGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTTAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTg < 8:344529/147‑1 (MQ=255) aGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTa > 6:69860/1‑148 (MQ=255) gggCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTa > 4:289688/1‑147 (MQ=255) tGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGTTATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAatat > 3:303001/1‑149 (MQ=255) tGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAatat > 4:352583/1‑149 (MQ=255) tCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCAtt < 3:121313/149‑1 (MQ=255) tatTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAg > 4:58502/1‑149 (MQ=255) tttGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGTTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGc > 1:146189/1‑148 (MQ=255) tttGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagcat > 7:338189/1‑115 (MQ=255) tttGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagcat < 8:338189/116‑2 (MQ=255) tttGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagcat < 6:92200/116‑2 (MQ=255) tttGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagcat > 5:92200/1‑115 (MQ=255) tGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCga < 1:149211/148‑1 (MQ=255) gagaATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGTTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCgag < 2:146189/148‑1 (MQ=255) gaATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATg > 2:12560/1‑149 (MQ=255) aaTCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATgg > 2:21954/1‑149 (MQ=255) tCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGc > 7:86658/1‑148 (MQ=255) aGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGaaa < 3:289688/149‑1 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGt > 6:92846/1‑149 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGt > 7:285321/1‑149 (MQ=255) cAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTg > 6:195903/1‑149 (MQ=255) gATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGt > 1:284249/1‑149 (MQ=255) tatCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTgg < 3:58502/148‑1 (MQ=255) tatCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGc < 6:272078/149‑1 (MQ=255) tCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATATGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCtt < 5:189257/149‑1 (MQ=255) tCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCa > 2:166491/1‑118 (MQ=255) tCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCa < 1:166491/118‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTg > 4:134398/1‑148 (MQ=255) tGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTGTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTa < 4:136164/149‑1 (MQ=255) tGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTa < 8:285321/149‑1 (MQ=255) gccgccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGtt < 6:269063/140‑1 (MQ=255) gccgccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGtt > 5:269063/1‑140 (MQ=255) ccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAttttt < 4:303001/149‑1 (MQ=255) tGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCAtt < 3:310120/110‑1 (MQ=255) tGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCAtt > 4:310120/1‑110 (MQ=255) ggaggaCGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCAGTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc > 1:119948/1‑148 (MQ=255) gaggaCGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc < 3:352583/147‑1 (MQ=255) gaggaCGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc < 4:223822/147‑1 (MQ=255) gATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACaaaaa > 2:54762/1‑149 (MQ=255) gATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGAAATAGTGCTCATGGTACAGAAATATTCATTCAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACaaaaa > 6:53840/1‑149 (MQ=255) tGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTTTTTTTACGCCAAAAAtt > 4:82660/1‑149 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTCTTACGACAAAAATTc > 2:199423/1‑148 (MQ=255) atatTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa < 5:92846/148‑1 (MQ=255) atatTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAg > 3:129524/1‑149 (MQ=255) tatTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGt < 1:7742/149‑1 (MQ=255) ttGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTg < 5:69860/148‑1 (MQ=255) ttGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTg > 1:158462/1‑148 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCAcc < 1:21954/149‑1 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATCCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCAc < 8:86658/148‑1 (MQ=255) tATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCttt > 2:182183/1‑148 (MQ=255) gAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACa > 6:125648/1‑148 (MQ=255) atatAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAg > 8:104689/1‑149 (MQ=255) taGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa > 4:82195/1‑130 (MQ=255) taGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa < 3:82195/130‑1 (MQ=255) taGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc < 5:189494/148‑1 (MQ=255) ggTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTa < 5:195903/148‑1 (MQ=255) tgAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGt < 2:284249/149‑1 (MQ=255) agcagcACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGa < 1:12560/149‑1 (MQ=255) gcagcaCGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGaa > 4:112769/1‑149 (MQ=255) agcaCGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAAt < 1:54762/148‑1 (MQ=255) gcaCGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTATAGCTGTCGAAtt > 4:346937/1‑148 (MQ=255) ggATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGc < 4:129524/149‑1 (MQ=255) aTAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGt < 5:125648/149‑1 (MQ=255) gcactattgcttgcaTAAGCAAGCATTAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAt > 6:271841/8‑149 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATTGTTCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGTTTGGCTTGTATTTTTACGACAATAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAtt < 3:60678/148‑1 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttg > 5:149649/1‑149 (MQ=255) tCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGt < 3:352266/82‑1 (MQ=255) tCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGt > 4:352266/1‑82 (MQ=255) tattgcttgcaTAAGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgtt > 7:286481/4‑149 (MQ=255) aaTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgttt > 6:325661/1‑149 (MQ=255) aaTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgttt < 6:149649/149‑1 (MQ=255) aTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCt > 2:189569/1‑121 (MQ=255) aTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCt < 1:189569/121‑1 (MQ=255) cttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATtgtttgtt < 3:112769/148‑1 (MQ=255) cttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATtgtttgtt < 5:325661/148‑1 (MQ=255) attgcttATGCAAGCTATAGTGCTCCTTGTACAGTAATATTCATTGAGCTATATGTCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACTACAAAAATTCTATAGTGCTCCTTTACAAAGTGTAGCTGGCGTATTTATGCGTGATtgtttgtt < 5:53840/147‑1 (MQ=255) ttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc < 2:155414/116‑1 (MQ=255) ttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc > 1:155414/1‑116 (MQ=255) ttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTtgttgt > 1:228691/1‑149 (MQ=255) gcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTgtgt > 4:218005/1‑149 (MQ=255) gcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTgtgt > 1:37274/1‑149 (MQ=255) | GCTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGT > NC_002947/3519933‑3520227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |