Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,740,687 | C→T | 6.2% | T377M (ACG→ATG) | PP_3304 → | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,740,687 | 0 | C | T | 6.2% | 187.1 / 2.2 | 65 | T377M (ACG→ATG) | PP_3304 | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/29); new base T (2/2); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 |
GCTTTTCCTATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATGAGGTTTGCTCCTGCTTCGCCTG > NC_002947/3740541‑3740833 | gCTTTTCCTATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCATCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGc > 6:233115/1‑149 (MQ=255) cTTTTCCTATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCTTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGc < 5:233115/148‑1 (MQ=255) cTATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGtt > 8:34363/1‑149 (MQ=255) cTATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGtt > 1:330523/1‑149 (MQ=255) tATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTc > 4:265780/1‑149 (MQ=255) tATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTc > 2:345955/1‑149 (MQ=255) aTGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTcc > 7:318631/1‑149 (MQ=255) tGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTccc < 6:98016/149‑1 (MQ=255) tGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTc < 5:285123/147‑1 (MQ=255) gggtatTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTg > 1:337693/1‑149 (MQ=255) ggtatTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGc > 3:285746/1‑149 (MQ=255) ccAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACt < 2:316206/148‑1 (MQ=255) cAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTgg > 3:309016/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTg > 8:188455/1‑149 (MQ=255) ccTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCg < 1:345955/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCg < 2:330523/149‑1 (MQ=255) ttGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCAACTCAAA‑CCTCGgt > 4:342637/1‑149 (MQ=255) ttGACAATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTATGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGgt > 2:236226/1‑149 (MQ=255) gACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCATGCCg < 7:187033/103‑1 (MQ=255) gACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCATGCCg > 8:187033/1‑103 (MQ=255) gACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCATGCCg < 7:182004/103‑1 (MQ=255) gACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCATGCCg > 8:182004/1‑103 (MQ=255) gACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGgt < 7:188455/147‑1 (MQ=255) gACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGgt < 7:34363/147‑1 (MQ=255) acCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTgg < 1:219027/149‑1 (MQ=255) acCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTgg > 1:28655/1‑149 (MQ=255) gggAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATgg < 1:333246/148‑1 (MQ=255) ggAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGTGATCGGAGCAGTGTCGCCCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTg > 7:92223/1‑149 (MQ=255) gAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGc > 3:279243/1‑149 (MQ=255) gaagCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCtttt < 2:337693/149‑1 (MQ=255) gCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGc > 2:236505/1‑149 (MQ=255) aGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCtt < 8:318631/149‑1 (MQ=255) ggACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTg < 4:285746/149‑1 (MQ=255) gACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTGCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑GCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATgtt < 1:182136/136‑3 (MQ=255) gACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAACCCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTg < 1:236505/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGt < 4:279243/149‑1 (MQ=255) gCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGtgtg < 5:173351/116‑1 (MQ=255) gCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGtgtg > 6:173351/1‑116 (MQ=255) gCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATg < 7:168328/129‑1 (MQ=255) gCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATg > 3:143149/1‑148 (MQ=255) gCGTCAGACCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATg > 8:168328/1‑129 (MQ=255) tCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCaa < 5:197743/149‑1 (MQ=255) gCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACg > 7:131400/1‑149 (MQ=255) ttttGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAg > 3:310159/1‑149 (MQ=255) ttttGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAg > 3:341957/1‑149 (MQ=255) ttttGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAg > 7:264265/1‑149 (MQ=255) gggCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CATCGGTGGCATTACTGGCAATGGTGCTTTT‑CGATTGGTATGTAAAACTTAAGGCaa > 2:103938/1‑149 (MQ=255) ccTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGt > 5:305575/1‑147 (MQ=255) cTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCa < 4:341957/148‑1 (MQ=255) cTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAg > 4:179718/1‑149 (MQ=255) gACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTg < 5:333395/70‑1 (MQ=255) gACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTg > 6:333395/1‑70 (MQ=255) ccATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTTCCGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGt < 1:236226/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGa < 6:305575/149‑1 (MQ=255) tGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAg > 4:32459/1‑146 (MQ=255) tGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAg < 3:32459/146‑1 (MQ=255) gCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTa > 8:7129/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGc < 8:131400/149‑1 (MQ=255) gACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTAtctc > 7:52853/1‑136 (MQ=255) gACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTAtctc < 8:52853/136‑1 (MQ=255) aTGGTTTCCAGGCCGAAGGTCCCCTCGTTTTGCGTTCTGTGTGCGACTGAAA‑CCTTGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGGTTTT‑CGGTTGGTTTGTCATTGGTTTGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATTACGTTTGGTCCTg < 8:264265/148‑1 (MQ=255) ttCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATGAGGTTTGCTCCt > 8:206100/1‑142 (MQ=255) ttCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATGAGGTTTGCTCCt < 7:206100/142‑1 (MQ=255) ccACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATGAGGTTTGCTCCTGCTTCGcc < 4:309016/148‑1 (MQ=255) cACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATGAGGTTTGCTCCTGCTTCGCCTg < 3:265780/149‑1 (MQ=255) | GCTTTTCCTATGGGGTATGGGTATTGCCAATCCGCTGGGAACGGCCTTGACCATGACACCGTTCGGGAAAGAAGCAGGACTGGCGTCAGCCCTTTTGGGCTTCCTGACCATGGCGATCGGAGCAGTGTCGACCTGGATGGTTTCCACGCCGAAGTTCCCCACGATTGCCGTACTGGGTGCCACTCAAA‑CCTCGGTGTGCTTTCTGGCAATGGTGCTTTT‑CGCTTGGTATGTCAAACGTAAGGCAATTGTCAGGTAGGAGTATCTCTGCATGAGGTTTGCTCCTGCTTCGCCTG > NC_002947/3740541‑3740833 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |