Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,830,229 | T→A | 6.3% | D384V (GAC→GTC) | PP_3383 ← | gluconate 2‑dehydrogenase flavoprotein subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,830,229 | 0 | T | A | 6.3% | 184.1 / 3.0 | 63 | D384V (GAC→GTC) | PP_3383 | gluconate 2‑dehydrogenase flavoprotein subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/31); new base A (2/2); total (30/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.60e-01 |
AGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGAAGTTACGCCCGACCACACCCTCGTTCTTTACCGGGTC > NC_002947/3830083‑3830377 | agtagtCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCg > 7:169975/1‑149 (MQ=255) gtagtCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCgg > 4:274803/1‑149 (MQ=255) gtagtCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCg < 6:274257/148‑1 (MQ=255) gtagtCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCg < 2:68234/148‑1 (MQ=255) gtCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGt > 1:202765/1‑149 (MQ=255) gtCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGt > 8:196504/1‑149 (MQ=255) ccgccctcCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAAtcgt < 1:305722/141‑1 (MQ=255) tttCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑a > 1:161208/1‑149 (MQ=255) tttCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGACGGCGTTGAAATCGTCG‑a > 7:289863/1‑149 (MQ=255) tttCTTCCAGGCACTGCCACAGGCCGGAGTGACCGGCGGGTTGGAGGTACCTGCAATCGGCCGGCTGCCGGACTCGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGACGTGCGGGACATGGTCGAAGTTGTCGGCCTTGAAATCGTCG‑a > 7:201944/1‑149 (MQ=255) tcttcCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑a < 5:32320/147‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATgg < 7:196504/146‑1 (MQ=255) cAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAAt > 7:266592/1‑149 (MQ=255) aGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATg > 3:20766/1‑149 (MQ=255) ggCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGc < 2:161208/149‑1 (MQ=255) cACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCa > 4:270371/1‑149 (MQ=255) cACTGCCCCAGGCCAGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCa < 5:109874/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGACGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCAc > 7:134284/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCAcc < 2:160235/149‑1 (MQ=255) ggCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGACGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCcg < 8:134284/149‑1 (MQ=255) tGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGAt > 1:270097/1‑148 (MQ=255) cccGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGaa > 4:181600/1‑149 (MQ=255) cggGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgt < 2:202765/149‑1 (MQ=255) gggTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgtt < 8:266592/149‑1 (MQ=255) ggTTTGAGGTACCTGCAATAGTCCGGGTGCCGGCCTGTTTCACCCAAATTGGCGAACCGCAGACGAAGCCGTGCTGGGCATGTTCGAAGTTTTCGGCTTTGAAATCGTCT‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGGGCCGATGAAGttgttg < 8:201944/149‑1 (MQ=255) ggTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGttgttg < 3:181600/149‑1 (MQ=255) ggAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGgtg < 2:270097/148‑1 (MQ=255) gAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAAtcgtc < 2:73350/104‑1 (MQ=255) gAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAAtcgtc > 1:73350/1‑104 (MQ=255) gAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGACGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTa < 8:289863/149‑1 (MQ=255) aGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAg < 4:158469/149‑1 (MQ=255) aGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAg < 4:219960/149‑1 (MQ=255) gTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGgt > 4:268427/1‑149 (MQ=255) ccGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGgtgt < 3:268427/148‑1 (MQ=255) cGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGttgttg > 5:24856/1‑137 (MQ=255) cGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGttgttg < 6:24856/137‑1 (MQ=255) ggCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgtt < 6:60816/135‑1 (MQ=255) ggCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgtt > 5:60816/1‑135 (MQ=255) ggccggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCgaa < 3:270371/149‑1 (MQ=255) ccggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCgaaga < 5:87814/149‑1 (MQ=255) ccggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCgaag > 8:59754/1‑148 (MQ=255) ggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAAc > 8:296700/1‑149 (MQ=255) ggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAAc < 7:296700/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTgg < 4:321180/121‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTgg > 3:321180/1‑121 (MQ=255) gTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGcc < 2:81958/139‑1 (MQ=255) gTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGcc > 1:81958/1‑139 (MQ=255) gTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTAc > 2:45114/1‑149 (MQ=255) aCCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGc < 4:153442/134‑1 (MQ=255) aCCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGc > 3:153442/1‑134 (MQ=255) ccACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGt > 2:137283/1‑149 (MQ=255) ccACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGt > 5:261289/1‑149 (MQ=255) cacaTTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGtt > 7:162757/1‑149 (MQ=255) ttGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCACTTCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGa < 7:230102/149‑1 (MQ=255) ggCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGAt < 3:274803/148‑1 (MQ=255) gAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGc < 6:261289/149‑1 (MQ=255) ccgccgACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGaa < 4:20766/149‑1 (MQ=255) ccgccgACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGaa < 8:169975/149‑1 (MQ=255) acgaAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCAAGTTCTGATAGGCGAAGTTACg > 6:372571/1‑149 (MQ=255) cgaAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGAAGTTACGc < 8:162757/149‑1 (MQ=255) gaAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGAATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGt > 1:78207/1‑121 (MQ=255) aGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGAAGTTACGccc > 2:304900/1‑148 (MQ=255) gAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGAAGTTACGCCCGACCACACCCTCGTTCTTTa > 1:5624/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGAAGTTACGCCCGACCACACCCTCGTTCTTTACCGGGTc > 2:182877/1‑149 (MQ=255) | AGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAACCGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCG‑ATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGAACGCCTTCACTGTACCCATGTTCTGATAGGCGAAGTTACGCCCGACCACACCCTCGTTCTTTACCGGGTC > NC_002947/3830083‑3830377 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |