Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,981,175 | T→C | 9.5% | D176G (GAC→GGC) | cobW ← | adenosylcobalamin biosynthesis protein CobW |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,981,175 | 0 | T | C | 9.5% | 168.8 / 7.4 | 63 | D176G (GAC→GGC) | cobW | adenosylcobalamin biosynthesis protein CobW |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/30); new base C (3/3); total (30/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
TCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGACGGTGCAGGC > NC_002947/3981028‑3981323 | tCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGt > 5:273609/1‑148 (MQ=255) tGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCAGCAGGTCGGCGCTGACCAGCTGGCCAGCgc < 6:143277/149‑2 (MQ=255) gCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGaa > 6:171201/1‑148 (MQ=255) cTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCt < 3:225586/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGt > 5:236733/1‑149 (MQ=255) cttgCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAgggg < 8:275115/146‑1 (MQ=255) ctgGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAgggg < 2:89164/149‑1 (MQ=255) ctgGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAggg < 6:189820/148‑1 (MQ=255) cTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt > 3:36322/1‑148 (MQ=255) gATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCa < 5:60997/148‑1 (MQ=255) aTCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATg < 5:171201/149‑1 (MQ=255) aCTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTc < 3:26163/149‑1 (MQ=255) cTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTc > 8:172122/1‑148 (MQ=255) tttCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGCTTCATGGTCCa > 8:80681/1‑149 (MQ=255) tttCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATgg < 4:154935/145‑1 (MQ=255) tttCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATgg > 3:154935/1‑145 (MQ=255) cgccgGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAg > 6:66682/1‑149 (MQ=255) cggcAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGa < 5:143151/149‑1 (MQ=255) gcAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGc > 6:315198/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTg < 8:316497/149‑1 (MQ=255) ttcttcGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTgc > 5:131329/1‑149 (MQ=255) ggCCACCTCGGCACGCACCTTGTCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg < 4:36322/148‑1 (MQ=255) ggCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg < 5:66682/148‑1 (MQ=255) aCCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATc < 7:172122/149‑1 (MQ=255) cTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGa > 2:105551/1‑149 (MQ=255) ggCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGAc < 6:131329/147‑1 (MQ=255) acgcacCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCACCACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGt > 5:182721/1‑149 (MQ=255) cgcacCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTc < 1:105551/149‑1 (MQ=255) gcacCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTcc > 7:157671/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCggg < 6:273609/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg > 5:352028/1‑129 (MQ=255) ttGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTgg < 6:352028/129‑1 (MQ=255) gCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCa > 3:187340/1‑148 (MQ=255) ttCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGTTCGGCGCTGGCCAGCAGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCCATTCATGGTCCAGCTTACGCTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAgg > 8:292017/1‑149 (MQ=255) cGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGt < 8:157671/148‑1 (MQ=255) gCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAg > 6:120408/1‑144 (MQ=255) gCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAg < 5:120408/144‑1 (MQ=255) gATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCgg > 5:137380/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGc > 5:58155/1‑149 (MQ=255) tCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGcc > 7:45951/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACg > 2:11420/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCg < 5:315198/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCgg < 6:58155/149‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCggg < 3:204473/149‑1 (MQ=255) gTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCt < 7:80681/147‑1 (MQ=255) ttCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCATGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc < 6:236733/149‑1 (MQ=255) aaCACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCa > 5:316372/1‑126 (MQ=255) aaCACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCa < 6:316372/126‑1 (MQ=255) acacCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGAc > 3:331261/1‑148 (MQ=255) accaccAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGCCCTGGTCCGGGTAGGCGGCATAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCAc > 6:6254/1‑149 (MQ=255) ccaccaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACg > 2:230916/1‑149 (MQ=255) caccaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCt > 8:60167/1‑138 (MQ=255) caccaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCt < 7:60167/138‑1 (MQ=255) caccaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACgg > 2:169986/1‑149 (MQ=255) accaGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGt < 8:45951/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGa < 4:331261/149‑1 (MQ=255) ctgttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGAGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGa > 5:249853/6‑149 (MQ=255) gttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc < 4:240735/130‑1 (MQ=255) gttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc > 3:240735/4‑133 (MQ=255) gttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc < 2:203889/130‑1 (MQ=255) gttcgcTGACCAGCTGGCCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTc > 1:203889/4‑133 (MQ=255) gcTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCAt < 1:11420/149‑1 (MQ=255) gcTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCAt > 3:349487/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGa < 6:137380/148‑1 (MQ=255) tCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGACGGTGCAGGc > 5:4709/1‑149 (MQ=255) | TCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCGGCAAAGGTGCCAGCGGCCACGGCCGGGCTGTCGACCACGGTAATGACCGCATCGACGGTGCAGGC > NC_002947/3981028‑3981323 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |