Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,038,223 | A→C | 7.0% | T8P (ACC→CCC) | PP_3559 → | glycine betaine ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,038,223 | 0 | A | C | 7.0% | 204.3 / 5.0 | 68 | T8P (ACC→CCC) | PP_3559 | glycine betaine ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/35); new base C (3/2); total (31/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 |
GCCGTCATGAGCGAAAAACGCACGCCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGG > NC_002947/4038080‑4038369 | gCCGTCATGAGCGAAAAACGCACGCCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTg < 2:2569/149‑1 (MQ=255) cGTCATGAGCGAAAAACGCACGCCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCa < 2:149371/149‑1 (MQ=255) tGAGCGAAAAACGCACGCCCCCGCTCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGtttt < 1:149633/149‑1 (MQ=255) aGCGAAAAACGCACGCCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTc < 4:174377/148‑1 (MQ=255) aaaaCGCACGCCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGc < 1:44872/149‑1 (MQ=255) acgcCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGGGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTCTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAg > 2:181238/1‑148 (MQ=255) cgcCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCa < 5:324822/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGCCCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTg > 8:99989/1‑149 (MQ=255) aCCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggttg < 4:346509/149‑1 (MQ=255) aCCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggttg > 6:75008/1‑149 (MQ=255) aCCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggtt < 6:279056/148‑1 (MQ=255) ccTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggttg < 5:75008/148‑1 (MQ=255) tGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTg > 8:151485/1‑148 (MQ=255) cgcgATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAAc < 8:79168/149‑1 (MQ=255) gATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGCCCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTAc > 8:84181/1‑149 (MQ=255) aTAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACg < 1:130694/149‑1 (MQ=255) aTCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGCCCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGc < 7:84181/148‑1 (MQ=255) tCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGGATTGAACTACGGCGa > 2:233821/1‑149 (MQ=255) gcgAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGTTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGTTTGGTATTGAACTACGGCGacc < 5:53142/149‑1 (MQ=255) ggTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggtt > 5:316346/1‑125 (MQ=255) ggTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggtt < 6:316346/125‑1 (MQ=255) gtgtGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTg > 7:172745/1‑149 (MQ=255) gtgtGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTg > 5:76003/1‑149 (MQ=255) tgGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTgcg > 3:158436/1‑148 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGCCCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGaccac < 6:240318/141‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGCCCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGaccac > 5:240318/1‑141 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggttggt > 5:202476/1‑122 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACtggttggt < 6:202476/122‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGc > 5:202867/1‑135 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGc < 6:202867/135‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAg > 5:248250/1‑149 (MQ=255) gAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAg > 5:51409/1‑149 (MQ=255) cgtGGCGGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGGGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAAGTACGGCGACCACCTGCGGTGTTTGt < 6:200106/147‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGt < 4:158436/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGt < 6:76003/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCCGGCGGACCTCGCCGCCAAGGTCGACGCCAGCCTGTCCGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCCCCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTCAACTACGGCGACCACCAGCCCAGTTTGt < 8:172745/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTc > 6:106203/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCt < 6:51409/147‑1 (MQ=255) cggcggACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGac > 8:34675/1‑124 (MQ=255) cggcggACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGac < 7:34675/124‑1 (MQ=255) gcggACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGAc < 3:159418/143‑1 (MQ=255) gcggACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGAc > 4:159418/1‑143 (MQ=255) cATCGCC‑CCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCaa > 3:110551/1‑149 (MQ=255) tCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACg > 5:258319/1‑110 (MQ=255) tCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACg < 6:258319/110‑1 (MQ=255) ccgccAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGGTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAActgc < 5:90523/149‑1 (MQ=255) cgccAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAActgct < 7:289721/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGt > 1:51413/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGt > 3:284622/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGCAGTTGCAGCAACTGGTcaga < 7:151485/149‑4 (MQ=255) gAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCGACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTtgctg < 6:353255/131‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCGACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTtgctg > 5:353255/1‑131 (MQ=255) aGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTgg < 2:51413/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAActgc < 2:249677/135‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAActgc > 1:249677/1‑135 (MQ=255) cAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGaa > 2:194573/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACACCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGaa > 6:161446/1‑149 (MQ=255) aGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAAc < 4:110551/149‑1 (MQ=255) aGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAAc < 6:248250/149‑1 (MQ=255) tgtgAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGt > 2:116358/1‑149 (MQ=255) agcagcGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTgcg > 7:60609/1‑149 (MQ=255) agcGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTTGGCCTg > 8:324662/1‑132 (MQ=255) agcGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTTGGCCTg < 7:324662/132‑1 (MQ=255) ggTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGtt < 7:99989/149‑1 (MQ=255) ttCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGcc > 4:45878/1‑149 (MQ=255) gCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTtggt < 1:194573/149‑1 (MQ=255) cAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACTGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTtggtg > 1:241887/1‑149 (MQ=255) aGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTtggtgg < 8:60609/149‑1 (MQ=255) | GCCGTCATGAGCGAAAAACGCACGCCCCCGCGCGAAGCCGCCCTGACCTTCCTGCGCGATAATCGCGAGGTGTGGAAAGCCTGGCTGCCGGCGGACATCGCCGCCAAGGTCGAGGCCAGCCTGTGAGCAGCGGTTTCCCGCAGACCCTGCAGTTTTCCTTTGCCGACAGCATCAACCGCCTGGTCGACTGGTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGG > NC_002947/4038080‑4038369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |