Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 642,515 | Δ1 bp | 6.7% | coding (472/1107 nt) | acoC ← | acetoin cleaving system dihydrolipoyllysine‑residue acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 642,515 | 0 | C | . | 6.7% | 190.7 / 7.2 | 60 | coding (472/1107 nt) | acoC | acetoin cleaving system dihydrolipoyllysine‑residue acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (24/32); new base . (2/2); total (26/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.86e-01 |
GCCGGCCAGGTGGGCCTTGGCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGGGCCGGCCCCT > NC_002947/642375‑642661 | gccgcccAGGTGGGCCTTGGCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGcagcc‑a < 1:15296/149‑1 (MQ=255) ccggccAGGTGGGCCTTGGCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGcagcc‑ag > 3:63408/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGtt > 3:78913/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGGCGCT‑GGCTGCCGAGCGGCGggtcatcg < 3:90181/149‑6 (MQ=255) gCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACa < 7:283648/148‑1 (MQ=255) gCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACa < 7:295093/148‑1 (MQ=255) cGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGc < 4:63408/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAgtt < 2:23966/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAgttgt > 8:343178/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAgttgtt < 2:113567/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAgttgtt < 4:12891/149‑1 (MQ=255) tggtCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAg < 5:368403/149‑1 (MQ=255) ggtCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAgg < 5:324219/149‑1 (MQ=255) aGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTcacc < 3:144374/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTcaccac < 3:72039/149‑1 (MQ=255) gCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGa < 1:237126/132‑1 (MQ=255) gCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGa > 2:237126/1‑132 (MQ=255) tttCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTgcacc < 7:343178/149‑1 (MQ=255) tCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTgcacca < 8:22090/148‑1 (MQ=255) aaCTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGt < 2:311177/136‑1 (MQ=255) aaCTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGt > 1:311177/1‑136 (MQ=255) cTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGTAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCg < 8:322998/149‑1 (MQ=255) cTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCg > 3:214277/1‑149 (MQ=255) tcatcaAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCg > 7:120052/1‑148 (MQ=255) aTCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCg < 8:120052/146‑1 (MQ=255) aTCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGgtg > 3:265427/1‑149 (MQ=255) gTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGc < 3:139303/97‑1 (MQ=255) gTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGc > 4:139303/1‑97 (MQ=255) cGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCAcc < 6:149545/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCt > 6:278087/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCt < 4:78913/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGaa > 8:44058/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCAccc < 4:97389/140‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCAccc > 3:97389/1‑140 (MQ=255) ccTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAAc < 4:214277/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAAc < 3:122081/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGCCAGGTCGAGGGCGAAGACCCGCCGCTCGGAAGCC‑AGAGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGAGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAAc > 1:141464/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTgcaccag > 1:53781/1‑114 (MQ=255) cTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTgcaccag < 2:53781/114‑1 (MQ=255) cGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGGCGCT‑GGCTGCCGAGCGGCggg < 1:319627/61‑1 (MQ=18) cGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGGCGCT‑GGCTGCCGAGCGGCggg > 2:319627/1‑61 (MQ=18) ccGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGcgcccgcc > 3:288635/1‑148 (MQ=255) cGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTa > 6:114996/1‑149 (MQ=255) cGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACACGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTa > 4:365141/1‑149 (MQ=255) aGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTc > 4:287379/1‑149 (MQ=255) aGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCtt < 3:287379/149‑1 (MQ=255) gggCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTc < 6:319161/149‑1 (MQ=255) tcaaccaCCCGGCGCT‑GGCTGCCGAGCGGCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCt > 5:134791/7‑148 (MQ=255) gATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAg > 3:2767/1‑149 (MQ=255) gATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAg > 2:256271/1‑149 (MQ=255) aTGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAgg < 5:114996/149‑1 (MQ=255) tGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCATCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCTCCTTCTGAgg < 2:141464/148‑1 (MQ=255) gACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGcgcc > 6:144342/1‑125 (MQ=255) gACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGcgcc < 5:144342/125‑1 (MQ=255) gccgcTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGggccggc > 1:194506/1‑149 (MQ=255) gccgcTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGggccggc < 4:288635/149‑1 (MQ=255) cgcTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGGGCCGGccc > 6:129143/1‑149 (MQ=255) gcTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGGGCCGGcccc > 7:151245/1‑149 (MQ=255) cTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGGGCCGGCCCCt < 5:129143/149‑1 (MQ=255) cTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGGGCCGGCCCCt < 8:151245/149‑1 (MQ=255) | GCCGGCCAGGTGGGCCTTGGCGATGTCCAGGTGGTCGAGCAGGGCGAGCACGGTTTCGCTCAACTCATCCAGGTCGCCCCGCTGCAGGGCCTTGGCCGACTCGCCGTGGCCCGGCAGGTCGAGGGCGATGACCCGCCGCTCGGCAGCC‑AGCGCCGGGTGGTTGAACAGCCAGTTGTTGAGGTCACCACCAAACCCGTGCACCAGCACCAGCGGTGTACCGCCTTCACCCAGCTCGAACCAGCGCAGCAGGCGCCCGCCTACTTCCGCCTTCTGAGGGGCCGGCCCCT > NC_002947/642375‑642661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |