| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1948946 = | 68 (1.160) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.2% | coding (709/1746 nt) | PP_1749 | acetyltransferase |
| ? | NC_002947 | 1948996 = | 46 (0.840) | coding (659/1746 nt) | PP_1749 | acetyltransferase | |||||
CCCGAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGCCAGGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1949102‑1948946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccaggccaCGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGCTGC > NC_002947/1948996‑1949143 CCCGAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCG > 8:268982/1‑149CCCGAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCG > 8:167644/1‑149CCCGAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCG > 6:337494/1‑149CCCGAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCG > 4:78105/1‑149 GAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGC > 3:103759/1‑147 TGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGCCAGGCC > 5:286946/1‑148 GTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGCCAGGCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGC > 4:244521/1‑148 TGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGCCAGGCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCCCCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCA > 2:196841/1‑149 CCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGCCAGGCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGG < 3:244521/149‑1 GCCAGGCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCAT > 1:325149/1‑149 CAGGCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGA < 4:124363/149‑1 GGCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTTCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACG < 1:52696/149‑1 GCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGC > 4:91197/1‑149 GCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAG > 2:67233/1‑138 GCCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAG < 1:67233/138‑1 CCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGG > 7:249209/1‑110 CCACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGG < 8:249209/110‑1 ACGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGCTGC < 2:325149/149‑1 CCCGAGCATGGCAGCAGCCTGTGGTGCCTGGCGGTGGACCCACACTGCACCCGCCCCGGCGTGGGTGAAGTGCTGGTGCGCCACCTGATCGAACACTTCATGAGCCGTGGCCTGGCCTACCTGGACCTGTCGGTGCTGCACGACAACCGCCAGGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1949102‑1948946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccaggccaCGGCTCATGAAGTGTTCGATCAGGTGGCGCACCAGCACTTCACCCACGCCGGGGCGGGTGCAGTGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGCTGC > NC_002947/1948996‑1949143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |