New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 469838 | 47 (0.800) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.0% | coding (1119/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
? | NC_002947 | = 469877 | 61 (1.080) | coding (1080/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
TGATGTCGATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAGGTGAAGTCGTTGGCATCGGCTT > NC_002947/469690‑469980 | tGATGTCGATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAG > 7:209240‑M1/1‑149 (MQ=255) tGTCGATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCTCAGTAg > 5:47435/1‑149 (MQ=255) tCGATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAgg > 1:138427/1‑148 (MQ=255) tCGATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAgg < 2:138427/148‑1 (MQ=255) gATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGcatcctg > 3:151501‑M1/1‑142 (MQ=255) aGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGcc > 5:176071/1‑147 (MQ=255) ccGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCagag > 2:344309/1‑149 (MQ=255) tggctggTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAgcgc > 4:48996/1‑141 (MQ=255) tggctggTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAgcgc < 3:48996/141‑1 (MQ=255) tggctggTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCg > 7:209750/1‑149 (MQ=255) gctggTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCgg < 8:4400/148‑1 (MQ=255) ctggTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGt < 2:268980/149‑1 (MQ=255) tggtggCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTg > 2:265345/1‑149 (MQ=255) tggCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCGAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAg < 7:76887/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGa > 7:47842/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCAGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGa > 6:11469/1‑149 (MQ=255) gATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGcatcctgcacccggaggacgcgctctgggctcaggcctactgcga < 4:151501‑M1/148‑46 (MQ=255) tGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGaaa < 8:173786/149‑1 (MQ=255) aCGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCgg < 8:47842/148‑1 (MQ=255) aCGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCgg < 2:56746/148‑1 (MQ=255) atTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCt > 4:146671/1‑147 (MQ=255) gCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGc < 6:176071/148‑1 (MQ=255) ccAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGcatcctgcacccggaggacgcgctctgggctcaggcctactgcgac < 8:244189‑M1/125‑47 (MQ=255) ccAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGcatcctgcacccggaggacgcgctctgggctcaggcctactgcgac > 7:244189‑M1/1‑79 (MQ=255) ccAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCAc > 7:195692/1‑149 (MQ=255) ggggCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAAt < 3:146671/149‑1 (MQ=255) ggggCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAAt < 2:41111/149‑1 (MQ=255) ggCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATgg < 1:265345/149‑1 (MQ=255) cTGACCGTCAGCCCGGATCACCCAGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGt < 5:11469/149‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAg < 2:318760/148‑1 (MQ=255) cccGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTa > 4:320640/1‑139 (MQ=255) cccGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTa < 3:320640/139‑1 (MQ=255) ggATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCt > 7:211411/1‑149 (MQ=255) aTCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTc > 7:148063/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCgg < 3:22747/148‑1 (MQ=255) cccGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTa > 5:7352/1‑130 (MQ=255) cccGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTa < 6:7352/130‑1 (MQ=255) ccGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATACTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCAt > 5:243104/1‑149 (MQ=255) gTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATgg < 4:21254/123‑1 (MQ=255) gTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATgg > 3:21254/1‑123 (MQ=255) gTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATggg < 8:195692/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCTCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGt < 6:47435/148‑1 (MQ=255) tCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTg > 3:68407/1‑148 (MQ=255) tCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTg > 3:316060/1‑148 (MQ=255) gCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCg > 6:255381/1‑133 (MQ=255) tgGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAg < 8:211411/147‑1 (MQ=255) cgcgCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAg > 2:128892/1‑149 (MQ=255) cgcgCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAg < 8:148063/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAg < 1:344309/148‑1 (MQ=255) gcgcCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGAGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGAAGCCAAGCAGGTCGTCGGCATGGGGTGAAACGAAGCGGTAgc > 4:261339/1‑148 (MQ=255) cgcCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAGGt > 2:288247/1‑149 (MQ=255) cccGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTc < 6:358301/116‑1 (MQ=255) cGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAGGTGAAGTCGtt < 8:209240/148‑1 (MQ=255) gCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAGGTGAAGTCGtt < 8:179876/141‑1 (MQ=255) gCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAGGTGAAGTCGtt > 7:179876/1‑141 (MQ=255) gTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGctgcgacagcgagaccgcagcggggcgcgaccacagcctggactaccgggtgatccgggctgacggtcagcccctctgg > 7:244189‑M2/1‑46 (MQ=255) gTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGctgcgacagcgagaccgcagcggggcgcgaccacagcctggactaccgggtgatccgggctgacggtcagcccctctgg < 8:244189‑M2/125‑80 (MQ=255) tCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGctgcgacagcgagaccgcagcggggcgcgaccacagcctggactaccgggtgatccgggctgacggtcagcccctctgggtacgcaatatcgtcagcatgatc < 4:151501‑M2/148‑104 (MQ=255) | TGATGTCGATCATCAGCCCGCGCATCACTGGCTGGTGGCCGTGCTCGATCATGCTGACGATATTGCGTACCCAGAGGGGCTGACCGTCAGCCCGGATCACCCGGTAGTCCAGGCTGTGGTCGCGCCCCGCTGCGGTCTCGCTGTCGCAGTAGGCCTGAGCCCAGAGCGCGTCCTCCGGGTGCAGGATGCTGCGCCAGAAACCGGGCCTGAGCCAGTCACTCAATGGGTAGCCAAGCAGGTCTTCGGCATGGGGTGAAACGTAGCTGTAGGTGAAGTCGTTGGCATCGGCTT > NC_002947/469690‑469980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |