| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 485197 = | 68 (1.200) | coding (738/867 nt) | apaH | bis(5'‑nucleosyl)‑tetraphosphatase | |||||
GGCGAAGGCCTGCGGGTCGCGAATGTCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTGCAGAGCGGCC > NC_002947/484955‑485248 | ggcgAAGGCCTGCGGGTCGCGAATGTCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCgg < 6:246339/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGTCGCGAATGTCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAg < 1:222261/149‑1 (MQ=255) cGGGTCGCGAATGTCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAgg < 7:206304/147‑1 (MQ=255) cGGGTCGCGAATGTCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAgg 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tCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGGCGTTGAGTGGAGTGGTTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGgcg > 5:297816/1‑149 (MQ=255) cgacgacgaCCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGgcg > 3:145589/1‑148 (MQ=255) cgacgacgaCCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGgcg > 7:168697/1‑148 (MQ=255) cgacgacgaCCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGgcg > 3:151178/1‑148 (MQ=255) gtcgacgacCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGgcgc < 7:277777/146‑1 (MQ=255) 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gTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTg < 4:103545/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTg > 1:32988/1‑148 (MQ=255) ggTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTg > 4:343549/1‑146 (MQ=255) ggTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTg > 3:325861/1‑146 (MQ=255) tgCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGgcgc > 2:42559/1‑83 (MQ=255) tgCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGgcgc < 1:42559/83‑1 (MQ=255) gCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTGCAGAGCGGc > 8:48878/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGTGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTGCAGAGCGGcc < 4:325861/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTGCAGAGCGGcc < 5:178898/149‑1 (MQ=255) | GGCGAAGGCCTGCGGGTCGCGAATGTCGACGACGACCGCACCTTCTTTCTTGCGAAGCTCCAAGGCCTGCTCAGGAGGGATGCGCTTGAATTCGCTCATGGGTACTACTTCCTTCAGGTGTGGTCGTTGAGTGTAGTGGGTTGTGCCGGCTGGC‑GCAGGGTGCCGTCGTCGGCGCAGTCGCAGCGGTGGTATTCGCCGCTGTCGACGTTGTACAGGGTCATGGCGCCACCCCATACGCAGCCAGTGTCCAGGGCGATGACGTCGGGCTCGGTGACCTCACCCTGCAGAGCGGCC > NC_002947/484955‑485248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |