New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 645850 = | 49 (0.830) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 8.4% | coding (245/1056 nt) | PP_0556 | acetoin catabolism protein |
? | NC_002947 | 645889 = | 41 (0.730) | coding (206/1056 nt) | PP_0556 | acetoin catabolism protein |
GTCACCGGCCTCGGCGGCGACCGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGCCTTGTCG > NC_002947/645702‑645996 | gTCACCGGCCTCGGCGGCGACCGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATggccg > 6:32826/1‑149 (MQ=255) gccgcctgaccgccaatgccgggctctattcgagcaccgacaaggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaaGGcc > 2:259217‑M1/146‑149 (MQ=255) aCCGGCCTCGGCGGCGACCGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATggccggc < 5:30722/148‑1 (MQ=255) ccTCGGCGGCGACCGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGc < 1:306476/149‑1 (MQ=255) caatgccgggctctattcgagcaccgacaaggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaaGGCCAGTGCTGGTCACg < 7:135133‑M1/17‑1 (MQ=255) gACCGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGATCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACggg > 2:223404/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATGGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGTTATCGGCCACGTTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGTATTTCGATGTCCGGCCAGTGCTGGTCAc < 1:329668/143‑1 (MQ=255) ggTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCct < 3:50573/149‑1 (MQ=255) cATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCctggctg > 8:241667/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCtggctggc < 7:271211/149‑1 (MQ=255) cgacaaggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaagg < 8:81822‑M1/2‑1 (MQ=255) cgacaaggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaagg > 7:81822‑M1/109‑110 (MQ=255) cgacaaggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaaGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCtt > 8:135133‑M1/109‑149 (MQ=255) cGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCtt > 7:89260/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCACGGCGCTCCTCGCCACGCGGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGa < 5:361184/146‑1 (MQ=255) gCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGATCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGa < 1:223404/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGa < 8:265908/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGa < 2:16004/149‑1 (MQ=255) ccAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGc > 5:35939/1‑149 (MQ=255) ggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaaGGGCAGTGCTGGGCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCAc < 7:51675‑M1/47‑1 (MQ=255) ggcctcggctatccagcgcctgctggccgctttcggtgccaccggcattggccaggtgttgttgcccagcgacatgaccggcatcgctgccgccgtgctcaaGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCa > 8:51675‑M1/103‑148 (MQ=255) gCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCAcg > 8:125868/1‑149 (MQ=255) cGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCAcggcg < 5:246959/149‑1 (MQ=255) cGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGACGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGcc > 7:127990/1‑134 (MQ=255) cGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGACGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGcc < 8:127990/134‑1 (MQ=255) gATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAg > 4:340852/1‑149 (MQ=255) gCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGcc < 7:125868/149‑1 (MQ=255) ccACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCg < 1:79123/149‑1 (MQ=255) gACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTgg < 5:32826/149‑1 (MQ=255) gACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTg < 7:241667/148‑1 (MQ=255) cATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGc > 3:297995/1‑148 (MQ=255) aTGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGTCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGcaa > 4:237868/1‑149 (MQ=255) gTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTg < 6:35939/149‑1 (MQ=255) aGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAAt > 4:364997/1‑149 (MQ=255) gCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTg < 2:297584/60‑1 (MQ=255) gCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTg > 1:297584/1‑60 (MQ=255) gTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGTCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGt < 3:237868/149‑1 (MQ=255) gCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGc < 3:340852/147‑1 (MQ=255) gCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCca < 2:265382/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCcag > 7:126915/1‑148 (MQ=255) aGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGc < 3:28877/124‑1 (MQ=255) aGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGc > 4:28877/1‑124 (MQ=255) tGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGgc < 8:126915/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGgcgc > 2:137507/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCtggctggc > 2:121781/1‑57 (MQ=255) gTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCtggctggc < 1:121781/57‑1 (MQ=255) tCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGa > 8:241351/1‑148 (MQ=255) tCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGa > 1:240082/1‑148 (MQ=255) tCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGa > 2:277008/1‑148 (MQ=255) cGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGt < 1:174436/87‑1 (MQ=255) cGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGt > 2:174436/1‑87 (MQ=255) gAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATa < 3:364997/148‑1 (MQ=255) gAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAg > 7:29468/1‑149 (MQ=255) gAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAg < 3:250053/149‑1 (MQ=255) gATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGcc > 3:15779/1‑148 (MQ=255) gATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCca < 2:44635/125‑1 (MQ=255) gATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCca > 1:44635/1‑125 (MQ=255) gATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGcc < 7:130672/148‑1 (MQ=255) tGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGCCTTg < 1:277008/149‑1 (MQ=255) ggccggccAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGCCTTGt > 8:110451/1‑149 (MQ=255) cggccAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGCCTTGTCg > 6:260962/1‑148 (MQ=255) cggccAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGCCTTGTCg < 5:260962/148‑1 (MQ=255) | GTCACCGGCCTCGGCGGCGACCGCCTTGTGGGTGCCATCACCGCCCAGCACGGCGATCATCGCCACGCCGCGCTGGACCATGTGCCGGGTAGCCAGGCGGGTATCGGCCACGGTCTGGCTCAGTGGCAGGTCGAGGATTTCGATGGCCGGCCAGTGCTGGTCACGGGCCCCCGGGCCCTGGCTGGCCTTGAGCACGGCGGCAGCGATGCCGGTCATGTCGCTGGGCAACAACACCTGGCCAATGCCGGTGGCACCGAAAGCGGCCAGCAGGCGCTGGATAGCCGAGGCCTTGTCG > NC_002947/645702‑645996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |