New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 737967 = | 52 (0.880) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 6.6% | coding (583/624 nt) | coaE | dephospho‑CoA kinase |
? | NC_002947 | 738017 = | 62 (1.070) | coding (533/624 nt) | coaE | dephospho‑CoA kinase |
CAGGTCGATCAGTTTGCAACGGTCCGAACAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCCGCGCCAGGG > NC_002947/737819‑738110 | caggTCGATCAGTTTGCAACGGTCCGAACAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCTATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAg < 8:70603/149‑1 (MQ=255) gacccaacgcgtactggtgatcgatgcgccgcaggacctgcaaatagcccgtaccctggcgcgggacaacaccagtgccgagcacgtgcaggccattttgcaggcgcagttggcccgtgaggatcgcttgcgccatgccgatgatgtgg > 2:195590‑M1/148‑149 (MQ=255) gTTTGCAACGGTCCGAACAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCt > 1:88900/1‑149 (MQ=255) cGAACAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAgcgc > 5:134810/1‑149 (MQ=255) aaCAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCgg > 6:165135/1‑149 (MQ=255) cAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGc > 5:129443/1‑148 (MQ=255) aaaaCGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGc > 2:230574/1‑147 (MQ=255) aaCGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAgg > 5:113017/1‑149 (MQ=255) aaCGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAgg > 2:58602/1‑149 (MQ=255) ccGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGgccgcc > 1:201692/1‑149 (MQ=255) tCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCAcatcat > 7:277571/1‑149 (MQ=255) tCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCAcatcat > 6:134166/1‑149 (MQ=255) cATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCg < 8:277571/149‑1 (MQ=255) cATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCg < 1:230574/149‑1 (MQ=255) cATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCg > 4:64402/1‑149 (MQ=255) cATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCg < 3:64402/149‑1 (MQ=255) cATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGCTAAAAGTGGTGCATGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCAGCCGTCGTTTACCACCACATAATCg > 7:187646/1‑149 (MQ=255) cacaGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATg > 2:296379/1‑149 (MQ=255) cacaGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATg < 4:133796/149‑1 (MQ=255) cgcgcCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCaa < 1:64711/149‑1 (MQ=255) caccagtgccgagcacgtgcaggccattttgcaggcgcagttggcccgtgaggatcgcttgcgccatgccgatgatgtGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCAcatcat < 6:377513‑M1/57‑1 (MQ=255) caccagtgccgagcacgtgcaggccattttgcaggcgcagttggcccgtgaggatcgcttgcgccatgccgatgatgtGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCAcatcat > 5:377513‑M1/79‑135 (MQ=255) accagtgccgagcacgtgcaggccattttgcaggcgcagttggcccgtgaggatcgcttgcgccatgccgatgatgtGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACcaca < 2:137989‑M1/53‑1 (MQ=255) accagtgccgagcacgtgcaggccattttgcaggcgcagttggcccgtgaggatcgcttgcgccatgccgatgatgtGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACcaca > 1:137989‑M1/78‑130 (MQ=255) cgcAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGaccac > 2:207938/1‑123 (MQ=255) cgcAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGaccac < 1:207938/123‑1 (MQ=255) cgcAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGAt > 2:293090/1‑149 (MQ=255) tGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCAc < 6:134810/148‑1 (MQ=255) gggCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGtt < 6:190695/109‑1 (MQ=255) gggCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGtt > 5:190695/1‑109 (MQ=255) aTCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCaa < 6:113017/149‑1 (MQ=255) gACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTg > 6:107444/1‑149 (MQ=255) tCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCt > 3:164545/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGCCCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTg > 3:342095/1‑148 (MQ=255) aaTGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGT‑AAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGc > 8:102551/1‑148 (MQ=255) gctCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGc < 1:58602/149‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGtt > 7:154324/1‑84 (MQ=255) tCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGtt < 8:154324/84‑1 (MQ=255) tCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCt > 4:294271/1‑149 (MQ=255) tCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCt > 5:291523/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCt < 2:294280/147‑1 (MQ=255) gcCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCt > 5:243594/1‑149 (MQ=255) ctcctTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCTGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCg < 1:293090/149‑1 (MQ=255) ctcctTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACAACCACATCATCGCCATGGCGGAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCg > 1:250645/1‑149 (MQ=255) tcctTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCgg > 8:158691/1‑149 (MQ=255) tttCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCAc > 8:293629/1‑149 (MQ=255) tttCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGATCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGACTTCGTTGACCAACACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGTGCAAACTGCGCATGCACAATGGCCTGAACGTGCTCggaaa > 5:277498/1‑146 (MQ=255) tttCAAAGTCAGGTAAAACTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACAACATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCAc > 5:41250/1‑149 (MQ=255) aaGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGgtg < 5:107444/149‑1 (MQ=255) ggTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTcc > 4:309724/1‑149 (MQ=255) gTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTccc < 6:291523/149‑1 (MQ=255) gTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTccc > 4:77734/1‑149 (MQ=255) aaaaGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCcgc > 3:277385/1‑149 (MQ=255) aaaGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGACATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCcgcg < 8:210810/149‑1 (MQ=255) aaGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCCgcgc < 2:88900/149‑1 (MQ=255) gtggtgCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCCGCGCCa < 3:294271/149‑1 (MQ=255) gtggtgCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACCGGTGTTGTCCCgcgc > 8:179494/1‑147 (MQ=255) tggtgCAGGCGGGCAATCTGCGCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCCGCGCCAg < 3:290312/149‑1 (MQ=255) gtgCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCg < 2:66551/124‑1 (MQ=255) gtgCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCCGCGCCAggg < 6:129443/149‑1 (MQ=255) | CAGGTCGATCAGTTTGCAACGGTCCGAACAAAACGGCCGGAACGCGTTTTTTTCGCTCCATTCCACAGGCGCGCCGCAAGTTGGGCAATCGACGGTCAATGGCTGGCTCATGGCTGGCCTCCTTTCAAAGTCAGGTAAAAGTGGTGCAGGCGGTCAATCTGCTCGTGCAGCGCGGCCAGGCCGCCGTCGTTGACCACCACATCATCGGCATGGCGCAAGCGATCCTCACGGGCCAACTGCGCCTGCAAAATGGCCTGCACGTGCTCGGCACTGGTGTTGTCCCGCGCCAGGG > NC_002947/737819‑738110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |