New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 929128 = | 39 (0.660) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.3% | coding (16494/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 929206 = | 52 (0.910) | coding (16416/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGT > NC_002947/928982‑929273 | cTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAg < 1:189222/149‑1 (MQ=255) aacgacgggcaactgttggtggtacgccaggccgatgctgccggcaacctgtccgccagcaccagcctgaccgcgccggacaccaccccgccagccgccccgctggccaccatcaacgccaacggcacctcggtcagtggttctggcCa > 5:225390‑M1/148‑149 (MQ=255) tGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAgg > 4:364957/1‑149 (MQ=255) cgacgggcaactgctggtggtacgccaggccgatgctgccggcaacctgtccgccagcaccagcctgaccgcgccggacaccaccccgccagccgccccgctggccaccatcaacgccaacggcacctcggtcagtggttctggcCAgg < 4:257207‑M1/4‑1 (MQ=255) cagGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTtgc < 6:237220/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTtgctg < 7:281695/149‑1 (MQ=255) aGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTg < 2:149679/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGc < 4:189771/149‑1 (MQ=255) ggggTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTa < 8:989/144‑1 (MQ=255) ggggTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTa > 7:989/1‑144 (MQ=255) aGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACgg > 6:304115/1‑148 (MQ=255) cGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCt < 5:62860/148‑1 (MQ=255) gcAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCAc > 6:44547/1‑149 (MQ=255) tgtgGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGgcgc > 3:96412/1‑131 (MQ=255) tgtgGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGgcgc < 4:96412/131‑1 (MQ=255) cagcctgaccgcgccggacaccaccccgccagccgccccgctggccaccatcaacgccaacggcacctcggtcagtggttctggcCAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGAcc > 7:8337‑M1/86‑149 (MQ=255) acacATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTAc > 6:262430/1‑120 (MQ=255) cacaTTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGtgctgc > 6:55031/1‑149 (MQ=255) aTTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGa > 2:104809/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACACTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTg > 2:328480/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTg < 5:277879/146‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTg > 6:277879/1‑146 (MQ=255) tGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGaa > 2:162070/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGaa > 3:98524/1‑149 (MQ=255) caccccgccagccgccccgctggccaccatcaacgccaacggcacctcggtcagtggttctggcCAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGcc < 8:307062‑M1/81‑1 (MQ=255) caccccgccagccgccccgctggccaccatcaacgccaacggcacctcggtcagtggttctggcCAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGcc > 7:307062‑M1/65‑145 (MQ=255) tCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAAc < 5:55031/148‑1 (MQ=255) ggTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCAc < 5:304115/149‑1 (MQ=255) tGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTg < 1:104809/149‑1 (MQ=255) ggTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGCTGCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGATGCCAACCGTTGCGTTACCCATTACGTTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGATGCCGACCTGGCCAGAACCACTGAcc > 1:226739/1‑149 (MQ=255) ggTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGATGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGCGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCg > 6:350386/1‑149 (MQ=255) gTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGa < 1:323096/145‑1 (MQ=255) gTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGa > 2:323096/1‑145 (MQ=255) aGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGtt < 1:328480/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTgg > 8:62321/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCg > 5:12279/1‑149 (MQ=255) tCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGAtggt < 2:226739/149‑1 (MQ=255) gATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGAtggtgg > 2:248939/1‑149 (MQ=255) c‑gccgcAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCg < 5:147182/149‑1 (MQ=255) cAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGggcg < 3:80387/149‑1 (MQ=255) ggCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGc > 4:330738/1‑149 (MQ=255) gCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCg > 4:72995/1‑149 (MQ=255) cTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCgg < 6:12279/149‑1 (MQ=255) aCCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGggt < 3:364957/149‑1 (MQ=255) ccACGAACAGGCCGGTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGGGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGggtg < 5:350386/149‑1 (MQ=255) cACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGTCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGggtgg > 8:248930/1‑149 (MQ=255) aCGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGggtggt > 6:213616/1‑149 (MQ=255) aCGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGggtggt < 7:248930/149‑1 (MQ=255) aCGAACAGCCCGTTGCTGCCAACCGTTGCGGTACCCAGTACTTAACCGCAGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGATCCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGCTGACGTTCGCGTTGAtggac > 4:297611/1‑121 (MQ=255) gAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGgtgt < 5:44547/149‑1 (MQ=255) | CTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGCGCCTGGTTGTCGATCTGC‑GCCGCAGTCAGGCTGACCACGAACAGGCCGTTGCTGCCCACCGTTGCGGTACCCAGTACGGTACCGGCGCTGTTGCGCACGGTGACCGTGCTGCCGACCTGGCCAGAACCACTGACCGAGGTGCCGTTGGCGTTGATGGTGGCCAGCGGGGCGGCTGGCGGGGTGGTGT > NC_002947/928982‑929273 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |