New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1098363 | 58 (0.990) | 5 (0.090) | 5/248 | NT | 8.8% | coding (216/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
? | NC_002947 | = 1098419 | 48 (0.850) | coding (160/525 nt) | kdsC | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase |
CGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGTG > NC_002947/1098217‑1098510 | cGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCg > 1:11785/1‑149 (MQ=255) gAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGt > 3:148952/1‑149 (MQ=255) aTCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTc < 7:27207/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTc > 7:179320/1‑148 (MQ=255) aCCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGa < 3:176244/148‑1 (MQ=255) gtcgggcaggtcgTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcga > 6:269007‑M1/1‑130 (MQ=255) gtcgCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGc < 2:11785/149‑1 (MQ=255) cccAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCtgat > 4:143106/1‑149 (MQ=255) aGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTgatgat < 2:124905/149‑1 (MQ=255) gCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCtt < 8:332584/128‑1 (MQ=255) gCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCtt > 7:332584/1‑128 (MQ=255) ccACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtg < 1:306054/149‑1 (MQ=255) cTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCggtggt > 5:157581/1‑148 (MQ=255) gATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCa < 8:232582/147‑1 (MQ=255) aTCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCcggcgttcgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaac < 1:77290‑M1/149‑53 (MQ=255) aTCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGc > 3:366276/1‑149 (MQ=255) tCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGcc > 2:270943/1‑149 (MQ=255) aTAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGccc > 2:27794/1‑148 (MQ=255) tAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGa < 7:154694/149‑1 (MQ=255) tAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGa < 4:148952/149‑1 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccggg < 1:59849‑M1/149‑59 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgg < 4:267773‑M1/148‑58 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg > 6:157581‑M2/1‑147 (MQ=255) gCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCCCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAg > 7:203317‑M2/1‑147 (MQ=255) aGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggcca < 5:269007‑M1/148‑62 (MQ=255) ggCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCAt < 5:167995/148‑1 (MQ=255) ggCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCAt < 8:179320/148‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCtg > 7:108641/1‑118 (MQ=255) gCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCtg < 8:108641/118‑1 (MQ=255) gCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGa < 1:270943/149‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTgcgc < 3:231550/111‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTgcgc > 4:231550/1‑111 (MQ=255) ccAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAg > 8:185931/1‑148 (MQ=255) ttCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCt < 3:143106/149‑1 (MQ=255) gCGAGCAGGCCTTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCCCGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGAt < 5:361023/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGccc < 1:27794/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTCGATGccc > 8:18914/1‑149 (MQ=255) aGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAg < 6:152119/149‑1 (MQ=255) accaccAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAggg > 3:186745/1‑148 (MQ=255) caccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggcc < 7:335289‑M2/115‑5 (MQ=255) caccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggcc > 8:335289‑M2/1‑111 (MQ=255) caccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTAt > 5:119500/1‑149 (MQ=255) ccaATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTg < 3:248796/149‑1 (MQ=255) caATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGccc > 2:191980/1‑106 (MQ=255) caATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGccc < 1:191980/106‑1 (MQ=255) gTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCt > 1:32388/1‑149 (MQ=255) tcctccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt > 3:128850/1‑149 (MQ=255) tccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCtga > 7:7270/1‑76 (MQ=255) tccCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCtga < 8:7270/76‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAAt > 6:163003/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGa < 5:358107/104‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGa > 6:358107/1‑104 (MQ=255) cTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTg < 4:366276/149‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTg > 6:151632/1‑149 (MQ=255) ttGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCGTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGc > 1:209842/1‑149 (MQ=255) gTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCAt > 7:37847/1‑149 (MQ=255) gTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGa < 7:185931/149‑1 (MQ=255) cGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGa < 5:163003/149‑1 (MQ=255) gggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCt > 1:125091/1‑134 (MQ=255) gggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCt < 2:125091/134‑1 (MQ=255) ggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAgg < 5:77570‑M2/78‑3 (MQ=255) ggATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAgg > 6:77570‑M2/1‑76 (MQ=255) ccGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAg < 8:37847/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGACCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAg > 5:70988/1‑149 (MQ=255) ccGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTCGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAg < 7:18914/149‑1 (MQ=255) cGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt < 8:325428/118‑1 (MQ=255) cGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCtt > 7:325428/1‑118 (MQ=255) cGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAgg > 4:84306/1‑149 (MQ=255) cGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAgg > 4:345422/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCG‑CCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCg < 7:303867/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcct < 5:269007‑M2/148‑88 (MQ=255) ggCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtg > 8:335289‑M1/1‑4 (MQ=255) ggCCtcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtg < 7:335289‑M1/115‑112 (MQ=255) cctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcc < 5:77570‑M1/78‑77 (MQ=255) cctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcc > 6:77570‑M1/1‑2 (MQ=255) cccGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc < 1:59849‑M2/149‑92 (MQ=255) cccGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGTg < 4:186745/149‑1 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccggggggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc > 7:203317‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcgggcgtgaccaccgcgatcatcagcgggcgcaagacccccgtggtcgaacgccgggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc > 6:157581‑M1/1‑1 (MQ=255) ccGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAggccaggaacctcggtatcccgcacctctaccaaggccgggaggacaaattggtggtgcttgacggcctgctcgccgaactgggcctaagc < 4:267773‑M2/148‑92 (MQ=255) ccGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGt > 6:44801/1‑147 (MQ=255) | CGGCGAATCACCGGCAGGTCGGGCAGGTCGTCGCCCAGGTAAGCCACTTGATCATAGCTTAGGCCCAGTTCGGCGAGCAGGCCGTCAAGCACCACCAATTTGTCCTCCCGGCCTTGGTAGAGGTGCGGGATACCGAGGTTCCTGGCCCGGCGTTCGACCACGGGGGTCTTGCGCCCGCTGATGATCGCGGTGGTCACGCCCGAGGCCATGAGCATCTTGATGCCCTGGCCGTCGAGGGTATTGAACGTCTTGAATTCGCTGCCATCCTCGAGGAAGTACAGGCGCCCGTCGGTG > NC_002947/1098217‑1098510 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |