New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1843419 | 61 (1.040) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.3% | coding (1375/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
? | NC_002947 | = 1843446 | 60 (1.070) | coding (1348/2754 nt) | gacS | sensor protein GacS |
CTGATCCAGAACTGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGAC > NC_002947/1843271‑1843566 | cTGATCCAGAACTGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTG < 5:218945‑M1/149‑1 (MQ=255) cTGATCCAGAACTGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTG < 7:219390‑M1/149‑1 (MQ=255) aGAACTGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAgt < 3:318112/149‑1 (MQ=255) aCTGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAgtgt < 2:173378/148‑1 (MQ=255) tGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTgcg > 2:183129/1‑149 (MQ=255) tGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCAGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGtcacctcaggat > 3:279556‑M1/1‑137 (MQ=255) cGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTgcgc < 8:116742/148‑1 (MQ=255) aaCCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGcaca > 5:12553/1‑149 (MQ=255) aaCCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGcaca > 6:162291/1‑149 (MQ=255) aaCCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCAATCTCTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGCGCTCGCGGGCC‑AGTGAGATGTCAGCCTGGCTGAAGCCCTGGAACAGAGTGCGcac > 2:359540/1‑148 (MQ=255) ggggTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGa < 1:183129/149‑1 (MQ=255) ggTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGa > 5:218219/1‑147 (MQ=255) gTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCAGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGtcacctcaggatgtgcgcacactgttccag < 4:279556‑M1/149‑31 (MQ=255) tACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGtcacctcaggatgtgcgcacactgttccagg < 1:330141‑M1/149‑32 (MQ=255) tGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggcc < 7:198807‑M2/148‑7 (MQ=255) tCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGtcacctcaggatgtgcgcacactgttccaggccttc < 2:258546‑M1/149‑37 (MQ=255) gACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGc < 5:37191/149‑1 (MQ=255) gACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGAGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGc < 3:88880/149‑1 (MQ=255) cacCGATCTCGCCGCCCATCTGATCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCTGACCGGCGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTTTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑g < 3:201440/149‑1 (MQ=255) acCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGc < 2:51021/146‑1 (MQ=255) acCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGc > 1:51021/1‑146 (MQ=255) ccGCTCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑Ggt < 2:256041/149‑1 (MQ=255) cGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑Ggtg > 6:178394/1‑149 (MQ=255) cGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑Ggtg > 4:257938/1‑149 (MQ=255) aTCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTc > 6:56804/1‑149 (MQ=255) cATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGa > 4:33829/1‑149 (MQ=255) ttCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATgcgc > 5:151826/1‑148 (MQ=255) ttCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATg < 5:162291/145‑1 (MQ=255) aGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTgcgc < 5:178394/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTgcgcg > 4:230780/1‑148 (MQ=255) gcgcTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTgcgcg < 3:230780/148‑1 (MQ=255) gcTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAg > 8:336353/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCCAAGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCt > 1:66950/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTc > 7:248627/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑ACAGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATACTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCCCGCAGTCTTCGTGCTc > 8:71815/1‑149 (MQ=255) gCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCt < 8:248627/149‑1 (MQ=255) cgccAGCCCGGCGGCACCGGTCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCtt > 1:290071/3‑149 (MQ=255) ccccAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCtt > 8:35371/1‑149 (MQ=255) ccAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTcc < 3:257938/149‑1 (MQ=255) ccAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTc > 2:338690/1‑148 (MQ=255) gACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAg > 6:325747/1‑148 (MQ=255) aCCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCa > 7:334534/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCa < 6:218219/149‑1 (MQ=255) cgccgGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGgcgcgc < 5:56804/149‑1 (MQ=255) gccgGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCa < 7:35371/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCacgac > 3:87832/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGAt > 7:292181/1‑149 (MQ=255) ggCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATg > 7:82564/1‑149 (MQ=255) gggCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGAt < 6:348211/91‑1 (MQ=255) gggCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTg < 4:87832/149‑1 (MQ=255) gggCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCA‑GGTGTCCTGCACGCTGAt > 5:348211/1‑91 (MQ=255) c‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCtt < 8:82564/149‑1 (MQ=255) gTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTcg > 6:12458/1‑149 (MQ=255) tGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTcgc < 2:290071/149‑1 (MQ=255) aGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTcgctg < 6:151826/149‑3 (MQ=255) aGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCgg < 3:33829/149‑1 (MQ=255) ttGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCa > 3:335414/1‑115 (MQ=255) ttGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCa < 4:335414/115‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCCTAGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACt > 1:287858/1‑149 (MQ=255) tGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGAt > 6:336429/1‑149 (MQ=255) gCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCTGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGAt < 6:12553/147‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCg > 8:260948/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggtgtcga < 2:258546‑M2/149‑114 (MQ=255) aaGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATg < 4:178236/120‑1 (MQ=255) aaGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATg > 3:178236/1‑120 (MQ=255) aaGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGtt < 8:292181/149‑1 (MQ=255) ggCCTGtcacctcaggatgtgcgcacactgttccaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggtgtcgaca < 7:198807‑M1/148‑143 (MQ=255) ggCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGc < 5:325747/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGc < 7:336353/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGc > 5:35986/1‑149 (MQ=255) ccTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcccgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggtgtcgacagta < 1:330141‑M2/149‑119 (MQ=255) cTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGAcaggccttcagccaggctgacaactcactggcctgccagcccggcggcaccggtctggggctggtgatttccaagcgcctgatcgaacagatgggcggcgagatcggtgtcgacagtac < 4:279556‑M2/149‑120 (MQ=255) tGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGAc > 8:243007/1‑149 (MQ=255) ggAACAGTGTGCGCGCATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGAc > 7:319842/1‑148 (MQ=255) | CTGATCCAGAACTGCGAACCTTCGCCCGGGGTACTGTCGACACCGATCTCGCCGCCCATCTGTTCGATCAGGCGCTTGGAAATCACCAGCCCCAGACCGGTGCCGCCGGGCTGGCGGGCC‑AGTGAGTTGTCAGCCTGGCTGAAGGCCTGGAACAGTGTGCGCACATCCTGAGGTGACAGGCCGATGCC‑GGTGTCCTGCACGCTGATGCGCAACTGCGCGCAGTCTTCGTGCTCGTCTTCCAGCATGGCGCGCACGACGATGGTGCCTTCGCGGGTGAACTTGATGGCGTTGCTGAC > NC_002947/1843271‑1843566 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |