| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1923013 | 50 (0.850) | 5 (0.090) | 4/248 | NT | 9.1% | coding (231/990 nt) | PP_1722 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 1923036 | 52 (0.920) | coding (208/990 nt) | PP_1722 | ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
CTTGCCCAGCTCCACCAGCTCCAGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGCCGAGCAGGGTGACGAATTCGCCG > NC_002947/1922869‑1923160 | cTTGCCCAGCTCCACCAGCTCCAGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGc < 3:252940/149‑1 (MQ=255)attGCCCAGCTCCACCAGCTCCAGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGc < 3:94426/148‑1 (MQ=255) ccagctccaccagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGAt > 8:129943/1‑142 (MQ=255) ccagctccaccagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGAt < 7:129943/142‑1 (MQ=255) agctccaccagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGctaagcccgc > 7:266943‑M1/1‑138 (MQ=255) caccagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCg > 1:191142/1‑149 (MQ=255) accagctccaGTACCTCGCCTACCCGCAGCTGCCTTTCGACCGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAACGCCACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGAAGCTATGGAACAACATGAAGATGCCCCGCTTTTTCgg > 8:72202/1‑149 (MQ=255) cagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCgg < 5:299349/147‑1 (MQ=255) cagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCgg > 6:299349/1‑147 (MQ=255) cagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGc > 2:186644/1‑149 (MQ=255) cagctccaGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGc > 6:141371/1‑149 (MQ=255) cAGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGcg < 6:111259‑M2/149‑3 (MQ=255) ccTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCAc < 8:148552/148‑1 (MQ=255) gcgTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGcttagcccgcaaaagcgtggcatcggcatggt < 1:26514‑M1/147‑33 (MQ=255) tACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGt < 2:191142/149‑1 (MQ=255) aCCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGctaagcccgcaaaagcgtggcatcggcatggt > 7:34683‑M1/1‑111 (MQ=255) aCCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGctaagcccgcaaaagcgtggcatcggcatggt < 8:34683‑M1/143‑33 (MQ=255) cccGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGt < 3:316471/147‑1 (MQ=255) cccGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTg < 5:141371/148‑1 (MQ=255) cccGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATCCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACCAAGTCGTga > 4:316471/1‑148 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGAt < 6:258219/111‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGAt > 5:258219/1‑111 (MQ=255) caggagctgGCTTTAGTCGGCCTTGACCTTCTGGATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTTGGTAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGctaagcccgcaaaagcgtggcatcggcatggtgttccaga < 8:266943‑M1/145‑41 (MQ=255) gCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCCCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCg > 7:167366/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCTTTCGTCGGCCTGGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGGTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGt < 4:73699/149‑1 (MQ=255) cTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAg > 1:169250/1‑149 (MQ=255) agaatgtcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAg > 5:189039‑M2/45‑149 (MQ=255) tttCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTc < 8:328984/133‑1 (MQ=255) tttCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTc > 7:328984/1‑133 (MQ=255) cgtcgGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTAt < 5:111259/148‑1 (MQ=255) tcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTgg > 6:57702‑M2/39‑132 (MQ=255) tcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTgg < 5:57702‑M2/94‑1 (MQ=255) TCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTg < 3:259983‑M1/149‑1 (MQ=255) ccTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGa > 1:6476/1‑90 (MQ=255) ccTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGa > 1:832/1‑90 (MQ=255) ccTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGa < 2:6476/90‑1 (MQ=255) ccTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGa < 2:832/90‑1 (MQ=255) cTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGc > 1:316153/1‑149 (MQ=255) cTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGc > 7:121279/1‑149 (MQ=255) ttCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATg > 2:174472/1‑114 (MQ=255) ttCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATg < 1:174472/114‑1 (MQ=255) cATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACTGTCATGTTAGGGAACAGCTCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTTGCCGTAGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAg < 4:144515/148‑1 (MQ=255) cATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCg < 2:169250/146‑1 (MQ=255) cATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAgg > 4:46239/1‑149 (MQ=255) cATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAg < 2:316153/148‑1 (MQ=255) aTGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGt > 3:94698/1‑149 (MQ=255) gcAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGc > 5:144755/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGc > 4:166670/1‑148 (MQ=255) gAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCaa < 4:94698/149‑1 (MQ=255) gCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATgca < 1:186644/149‑1 (MQ=255) ccgacATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCa < 6:189039‑M2/144‑1 (MQ=255) gacATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAgc > 5:160265‑M2/4‑149 (MQ=255) gacATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAgc > 6:365991‑M2/4‑149 (MQ=255) gacATTCTGCCCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAgc < 8:167366‑M2/146‑1 (MQ=255) aTTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATgcagcg > 6:92911/1‑147 (MQ=255) aTTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATgcagcg > 8:17168/1‑147 (MQ=255) tCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATgcagcgcag > 8:113725/1‑148 (MQ=255) cACGGTCATGTTAGGGAACTGCGCGTAGCTCTGGTACACGATGCCGATGCCACTCGTTTGCTGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGGCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCTAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTg < 7:72202/148‑1 (MQ=255) cACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTg > 8:161121/1‑148 (MQ=255) aTGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGc < 3:305457/148‑1 (MQ=255) tGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCg > 5:229550/1‑149 (MQ=255) ttAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCg > 7:92375/1‑147 (MQ=255) aaCAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGa > 5:74374/1‑149 (MQ=255) aGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCa < 5:120253/76‑1 (MQ=255) aGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCa > 6:120253/1‑76 (MQ=255) cgcgTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGc < 6:144755/149‑1 (MQ=255) gcgTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGcc < 3:46239/149‑1 (MQ=255) gTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGcc > 4:87509/1‑147 (MQ=255) tctGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGcggcatggtgttccagagctacgcgctgttaccaaacatgaccgtggagcagaatgtcgccttcggcctgcgcatccagaaggtcaaggccgactaaagccagctcctg < 8:266943‑M2/149‑110 (MQ=255) tGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACggg < 2:218054/138‑1 (MQ=255) tGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACggg > 1:218054/1‑138 (MQ=255) tGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGTCGAGCAgg < 7:17168/147‑1 (MQ=255) gAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGCCGAGCAggg < 6:160265/146‑1 (MQ=255) gAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGCCGAGCAGGGTGa < 4:259983/149‑1 (MQ=255) aaCACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCTGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGCCGAGCAGGGTGAc < 1:86620/149‑1 (MQ=255) acCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGcggcatggtgttccagagctacgcgctgttccctaacatgaccgtggagcagaatgtcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacgaaagccagctgcgggt > 7:34683‑M2/1‑32 (MQ=255) acCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGcggcatggtgttccagagctacgcgctgttccctaacatgaccgtggagcagaatgtcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacgaaagccagctgcgggt < 8:34683‑M2/143‑112 (MQ=255) acCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTAAGcggcatggtgttccagagctacgcgctgttccctaacatgaccgtggagcagaatgtcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacgaaagccagctgcgggtacgc < 1:26514‑M2/147‑116 (MQ=255) cGctaagcccgcaaaagcgtggcatcggcatggtgttccagagctacgcgctgttccctaacatgaccgtggagcagaatgtcgccttcggcctgcgcatgcagaaggtcaaggccgacgaaagccagctgcgggtacgcgaggtactg < 6:111259‑M1/149‑148 (MQ=255) | CTTGCCCAGCTCCACCAGCTCCAGTACCTCGCGTACCCGCAGCTGGCTTTCGTCGGCCTTGACCTTCTGCATGCGCAGGCCGAAGGCGACATTCTGCTCCACGGTCATGTTAGGGAACAGCGCGTAGCTCTGGAACACCATGCCGATGCCACGCTTTTGCGGGCTTAGCGGCACGATGTCGTGGCCGTCGAGCAGTATCTGCCCGCTGTCCACCGAGGTCAGCCCGGCAATGCAGCGCAGCAGGGTGGACTTGCCGCAGCCGGACGGGCCGAGCAGGGTGACGAATTCGCCG > NC_002947/1922869‑1923160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |