| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GGCGCTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCC‑CGCTGATTCGGCAGTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGAAGCAA > NC_002947/2453849‑2454144 | cgcTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCC‑CGCTGATTCGGCAGTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGc < 1:224354/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCC‑CGCTGATTCGGCAGTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGc < 5:84822/148‑1 (MQ=255) tCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCC‑CGCTGATTCGGCAGTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAg > 8:44829/1‑149 (MQ=255) 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cAGTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGctgctg < 2:21460/149‑1 (MQ=255) gTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGac < 5:308106/149‑1 (MQ=255) tGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGacc < 4:171524/149‑1 (MQ=255) aaGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGaccac > 4:256630/1‑149 (MQ=255) cACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCgctg < 5:251337/136‑1 (MQ=255) cACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCgctg > 6:251337/1‑136 (MQ=255) cACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCAccc < 4:113869/149‑1 (MQ=255) aCGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGACAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCg > 8:185790/1‑149 (MQ=255) cgcgGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCgg > 1:129797/1‑149 (MQ=255) gcgGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCCCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCggg > 1:23119/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGc < 1:337438/149‑1 (MQ=255) ccGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCa < 7:137246/149‑1 (MQ=255) cGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAACTCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCa < 1:101141/149‑1 (MQ=255) ggggAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACt > 6:363377/1‑149 (MQ=255) gggAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTg < 7:275427/149‑1 (MQ=255) gggAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTg < 4:313522/149‑1 (MQ=255) ggAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGc < 1:267173/149‑1 (MQ=255) tGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAg > 7:97333/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGcc > 2:7719/1‑149 (MQ=255) tCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCAc < 8:148248/138‑1 (MQ=255) tCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCAc > 7:148248/1‑138 (MQ=255) gAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCGAGCG‑GCTGGTTTGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCggg < 2:199345/149‑1 (MQ=255) gAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCggg > 5:179679/1‑149 (MQ=255) gAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCggg > 2:169500/1‑149 (MQ=255) aaGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGaa < 7:221493/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGAAg > 3:105649/1‑148 (MQ=255) TGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGAAGCaa < 3:270893‑M1/149‑1 (MQ=255) | GGCGCTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCC‑CGCTGATTCGGCAGTGAAGA‑GCACGCGGCCGGGGAACTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCG‑GCTGGTTGGCCTTG‑‑GCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAA‑GCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGCTTGAGCCGGGCGAAGCAA > NC_002947/2453849‑2454144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |