New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3522702 = | 70 (1.190) | 10 (0.240) +ATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTC |
6/186 | NT | 20.1% | intergenic (+489/‑208) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
? | NC_002947 | = 4495703 | 40 (0.680) | coding (13/960 nt) | PP_3987 | site‑specific recombinase |
CCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATT > NC_002947/3522563‑3522849 | ccGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTggcccaggccc < 3:148856/149‑1 (MQ=255) tCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATg < 2:124866/149‑1 (MQ=255) gtcgggtcgcatcatggtcggcgagctccagaaagaaatcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATg > 3:77168‑M1/137‑149 (MQ=255) gggtcgcatcatggtcggcgagctccagaaagaaatcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGc > 7:193559‑M1/134‑148 (MQ=255) ccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCg > 3:295808/1‑149 (MQ=255) ccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCg > 7:21087/1‑149 (MQ=255) ccGACAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCg > 4:341944/1‑149 (MQ=255) gCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTc < 7:293431/149‑1 (MQ=255) cAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCa < 1:177003/149‑1 (MQ=255) cAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCa < 6:356458/149‑1 (MQ=255) tGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCa < 8:21087/149‑1 (MQ=255) tGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAACACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCa < 3:207858/149‑1 (MQ=255) gTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAtgt < 3:32437/149‑1 (MQ=255) tCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACAAGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAtgtg > 5:292654/1‑149 (MQ=255) cTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGc < 6:128251/148‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGc > 5:128251/1‑148 (MQ=255) cTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCt > 4:207259/1‑149 (MQ=255) cTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCt > 7:307778/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCgg > 6:244269/1‑149 (MQ=255) cAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCa < 3:339401/149‑1 (MQ=255) tccagaaagaaatcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATg > 1:109796‑M1/111‑123 (MQ=255) tccagaaagaaatcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATg < 2:109796‑M1/13‑1 (MQ=255) cagaaagaaatcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggactgttgcgcctgctgcagcatCCCCAGCCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTcagac < 2:8202‑M1/41‑3 (MQ=255) aaagaaatcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCcgcg < 6:341043‑M1/44‑1 (MQ=255) cccGGCCTCGACACCCAGTCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGt < 6:154982/148‑1 (MQ=255) cGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCg > 8:93984/1‑149 (MQ=255) atcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGt < 5:298738‑M1/50‑1 (MQ=255) tcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatg < 3:133130‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgggagcacagcatcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatg > 4:133130‑M1/99‑99 (MQ=255) ccTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTg < 3:207259/149‑1 (MQ=255) ccTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCCTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCACGCCCAAGGCGTTAACCATGTGCTCGGCCTTCAGCCGCGGAGCGTTg > 4:202503/1‑149 (MQ=255) cTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTgg > 3:142897/1‑149 (MQ=255) tCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGt < 4:35865/145‑1 (MQ=255) tCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGt > 3:35865/1‑145 (MQ=255) gACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCGTGGCGTTCAGGAGGTGCTGGGCGTTGAGGCGCGGTGGggtggt > 4:276553/1‑147 (MQ=255) acCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCg < 3:298421/121‑1 (MQ=255) acCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCg > 4:298421/1‑121 (MQ=255) acCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTcacca < 5:244269/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTca < 6:347407/144‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTca > 5:347407/1‑144 (MQ=255) ccAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACg > 1:161239/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGcc > 2:138060/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGACAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCCGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGcc > 3:54815/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGAt < 1:179907/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTAAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTTCGTTGGTAACCCCGCACATTCCgct > 8:120548/1‑147 (MQ=255) taagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCAt > 5:341043‑M1/73‑149 (MQ=255) tGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATgg < 3:276553/149‑1 (MQ=255) agcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTTGTCACCACGCACATGCCGATGCCATgg > 1:8202‑M1/71‑149 (MQ=255) tAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTg < 3:42062/149‑1 (MQ=255) tgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg > 6:298738‑M1/64‑148 (MQ=255) gggCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTggg > 1:141130/1‑149 (MQ=255) gggCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg < 3:21656/148‑1 (MQ=255) gggCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg < 4:295808/148‑1 (MQ=255) cggCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCAAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTAAAAGTGCTGGCCCAGGCCCAAGGCCTAAAGCATGTGCACGGCGTTCAGCCGCGGTGCGATCGTGCCCACGCACATGCCGATGCCAAAGGCCTggg > 6:200856/2‑149 (MQ=255) gCAGCGGGTCCGGTTTGGGCGGTGCGTGCTCTTCGGCCTCCAGCACATGTTCTAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTGGTCGTTCTGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGct < 4:54815/149‑2 (MQ=255) gCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCa > 2:157959/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATg < 7:93984/149‑1 (MQ=255) gggTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTc < 2:161239/149‑1 (MQ=255) tCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACACACATGCCCATGCCATGGGCATGGGCATGCTCcag > 8:270048/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCaa > 1:62294/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGTCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCaa > 6:226690/1‑148 (MQ=255) tGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCCGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGc > 2:315547/1‑149 (MQ=255) cAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTg < 3:341944/149‑1 (MQ=255) gCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTgg > 3:112022/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCAt < 4:142897/147‑1 (MQ=255) cGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTTGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTgg < 5:25025/148‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGc < 7:120548/148‑1 (MQ=255) gCCACCAGCACTTGTTCATAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTc < 5:200856/149‑1 (MQ=255) gCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTc < 1:157959/149‑1 (MQ=255) ccaGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTaa < 4:112022/149‑1 (MQ=255) caGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg > 6:210157/1‑106 (MQ=255) caGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg < 5:210157/106‑1 (MQ=255) caGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAg > 7:84008/1‑149 (MQ=255) aGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGTCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAgc < 5:226690/149‑1 (MQ=255) cacaTGTTCATAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAgcgc < 3:202503/149‑1 (MQ=255) ttCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGgc < 5:92784/113‑1 (MQ=255) ttCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGgc > 6:92784/1‑113 (MQ=255) tCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTg < 1:38409/124‑1 (MQ=255) tCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTg > 2:38409/1‑124 (MQ=255) aaaGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGt < 3:330263/134‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGt > 4:330263/1‑134 (MQ=255) gTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTACATGAAccc > 4:254050/1‑148 (MQ=255) gcccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACAtt < 3:254050/148‑1 (MQ=255) | CCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATT > NC_002947/3522563‑3522849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |