| New junction evidence | |||||||||||
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4:277868‑M1/149‑141 (MQ=255) ccTGCATCACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggat < 5:214455‑M2/148‑39 (MQ=255) cTGCATCACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCTGATGCAGGCCGGTAACCGCATTCGGCCGAAAgcggttac < 3:360827/149‑6 (MQ=255) cATCAggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgatcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaa < 4:360827‑M1/147‑143 (MQ=255) cATCAggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgagcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaaga < 5:82160‑M1/149‑145 (MQ=255) cATCAggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgagcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaa < 3:299544‑M1/147‑143 (MQ=255) cATCACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCTGATGCAGGCCGGTAACCGCTTTCGGCCGAATGCGCCAGAc < 6:4117/147‑1 (MQ=255) aTCAggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgagcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaagag < 1:329624‑M1/149‑146 (MQ=255) tCAggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgagcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaagag > 5:280613‑M1/1‑3 (MQ=255) tCACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCTGATGCAGGCCGGTAACCGCTTTCGGCCGAATGCGCCAGACCAg > 3:89426/1‑148 (MQ=255) cAggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgagcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaagag > 8:67141‑M1/1‑2 (MQ=255) cACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaa > 2:51648‑M2/1‑103 (MQ=255) cACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaa < 1:51648‑M2/144‑42 (MQ=255) aggtacaggatgcaccgctgggccacgtggcgatgccggcggccggttcgccattgtcggcggcgctggacccgcgggtggatgagcagacggtgcaggacgtgatgcaggcgccggtggcggctgaagacaccgaggatgaagagaa < 4:220782‑M1/148‑148 (MQ=255) aCGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCTGATGCAGGCCGGTAACCGCTTTCGGCCGAATGCGCCAGACCAGCAc < 6:82160/149‑1 (MQ=255) | GTGGCGTTTTCATTTGTGTTTCTGCTGGGCTGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGACTTGCTGACCTCTTCAGGCGCCTGTTGCTGCGCGCCCTTCTCTTCATCCTCGGTGTCTTCAGCCGCCACCGGCGCCTGCATCACGTCCTGCACCGTCTGCTCATCCACCCGCGGGTCCAGCGCCGCCGACAATGGCGAACCGGCCGCCGGCATCGCCACGTGGCCCAGCGGTGCATCCTGTACCTGATGCAGGCCGGTAACCGCTTTCGGCCGAATGCGCCAGACCAGCAC > NC_002947/4988368‑4988663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |