New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5602436 | 68 (1.160) | 5 (0.090) | 4/248 | NT | 6.9% | coding (1046/5418 nt) | PP_4924 | subtilase family serine protease |
? | NC_002947 | = 5602448 | 69 (1.220) | coding (1034/5418 nt) | PP_4924 | subtilase family serine protease |
ACGTTGCTCACCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑CCATCACGATAGAACTGAGCCAGATGCTGATTGGGTCG > NC_002947/5602295‑5602581 | aCGTTGCTCACCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGa < 8:233586/148‑1 (MQ=255) aCGTTGCTCACCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAg < 8:141571/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAgcaa > 3:119524‑M2/1‑145 (MQ=255) aCCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAgc < 2:70495‑M2/147‑3 (MQ=255) aCCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAgc < 7:343454‑M2/147‑3 (MQ=255) gCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCtcgacctcagcggcaaggg < 6:131281‑M1/147‑20 (MQ=255) gCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCg > 6:289043/1‑149 (MQ=255) ggTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGGCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGt < 8:339308/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGa < 8:343454/148‑1 (MQ=255) ccGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGAc < 7:334837/149‑1 (MQ=255) tCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACgt > 2:59937/1‑149 (MQ=255) aTGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACgtgt > 1:297652/1‑149 (MQ=255) cACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGTCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCa > 5:189674/1‑149 (MQ=255) cACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCa > 7:250921/1‑149 (MQ=255) aCCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAAc > 6:318648/1‑141 (MQ=255) aCCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCCCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCAc > 1:310522/1‑149 (MQ=255) aCCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGCTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAAc < 5:318648/141‑1 (MQ=255) gCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTg < 5:205933/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCa > 2:352973/1‑149 (MQ=255) 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gCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGcc < 1:352973/149‑1 (MQ=255) cccAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt < 8:250921/148‑1 (MQ=255) cccAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt > 6:358130/1‑148 (MQ=255) cccAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt > 6:4272/1‑148 (MQ=255) cccAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt > 3:154059/1‑148 (MQ=255) cAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAg > 5:352675/1‑149 (MQ=255) tGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACg < 5:4272/149‑1 (MQ=255) gcggcgCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACgg > 2:215894/1‑149 (MQ=255) cggcgCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGc < 3:369360/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCtcgacctcagcggcaagggcgttggtctgacgg < 4:91033‑M1/104‑34 (MQ=255) gcgcAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCtcgacctcagcggcaagggcgttggtctgacgg > 3:91033‑M1/1‑71 (MQ=255) gcgcAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCtcgacctcagcggcaagggcgtt < 1:20420‑M1/94‑24 (MQ=255) gcgcAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCtcgacctcagcggcaagggcgtt > 2:20420‑M1/1‑71 (MQ=255) gTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGAGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTgcg > 6:57693/1‑148 (MQ=255) tGAACGACTGTTATCGATATCGCACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCCGACCATCGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCCTGGGCATTGCTGCCAACCCGGCGAGAACCACGGCATTGCGCa < 6:39707/149‑1 (MQ=255) aaCCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAgg < 3:123238/149‑1 (MQ=255) aaCCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCCCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAgg < 2:310522/149‑1 (MQ=255) aCCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATtgct < 8:284152/115‑1 (MQ=255) aCCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATtgct > 7:284152/1‑115 (MQ=255) cACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTg < 6:189674/149‑1 (MQ=255) tGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt > 1:224570/1‑121 (MQ=255) tGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt > 1:219206/1‑121 (MQ=255) tGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt < 2:224570/121‑1 (MQ=255) tGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGtt < 2:219206/121‑1 (MQ=255) tatcgatatcgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATcc > 3:185097/1‑149 (MQ=255) tcgatatcgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCgg < 4:336336/149‑1 (MQ=255) tcgatatcgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCgg < 4:154059/149‑1 (MQ=255) gatatcgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGgtt > 1:10307/1‑149 (MQ=255) atatcgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGgttg > 3:340604/1‑149 (MQ=255) atatcgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGgttg > 6:214290/1‑149 (MQ=255) cgaACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCa > 8:138549/1‑149 (MQ=255) cGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATtgctgc > 6:284119/1‑91 (MQ=255) cGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATtgctgc < 5:284119/91‑1 (MQ=255) cGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑CCATCa < 2:10307/149‑1 (MQ=255) cTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCAt < 7:110078/82‑1 (MQ=255) cTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCAt > 8:110078/1‑82 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aaCGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑c < 4:114613/119‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑CCATCACGATAGAACTGAGCCAGATGCTGATTgg > 3:86229/1‑149 (MQ=255) cccTTGCCGCTGAGGTCGAgcaagggcgttggtctgacgggtatcgaggaaggcgtactgttcgatatcgataacagtggttcactgcgccgcaccggctgggcagaccggctgaccggcatgctggtgcatgacaacggtaccggc < 6:131281‑M2/147‑129 (MQ=255) cccTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑CCATCACGATAGAACTGAGCCAGATGCTGATTggg < 4:185097/149‑1 (MQ=255) ttGCtcgacctcagcggcaagggcgttggtctgacgggtatcgaggaaggcgtactgttcgatatcgataacagtggttcactgcgccgcaccggctgggcagaccggctgaccggcatgctggtgcatgacaacggtaccggccaggt > 3:119524‑M1/1‑4 (MQ=255) ttGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑CCATCACGATAGAACTGAGCCAGATGCTGATTGGGTCg > 7:283719/1‑149 (MQ=255) gCtcgacctcagcggcaagggcgttggtctgacgggtatcgaggaaggcgtactgttcgatatcgataacagtggttcactgcgccgcaccggctgggcagaccggctgaccggcatgctggtgcatgacaacggtaccggccaggt < 2:70495‑M1/147‑146 (MQ=255) gCtcgacctcagcggcaagggcgttggtctgacgggtatcgaggaaggcgtactgttcgatatcgataacagtggttcactgcgccgcaccggctgggcagaccggctgaccggcatgctggtgcatgacaacggtaccggccaggt < 7:343454‑M1/147‑146 (MQ=255) gCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTGCCCATCACGATAGAACTGAGCCAGATGCTGATTGGGTCg < 1:59937/148‑1 (MQ=255) | ACGTTGCTCACCTGGCCGGTACCGTTGTCATGCACCAGCATGCCGGTCAGCCGGTCTGCCCAGCCGGTGCGGCGCAGTGAACCACTGTTATCGATATCGAACAGTACGCCTTCCTCGATACCCGTCAGACCAACGCCCTTGCCGCTGAGGTCGAGCAAGAGCGGGTCGACAAACGTGTTCACCGTGGTCATTGCTGCCAACCCGTTGAGTACCACGGCATTGCGCAGGCTGAAATCCGGTTGTTCATTG‑CCATCACGATAGAACTGAGCCAGATGCTGATTGGGTCG > NC_002947/5602295‑5602581 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |