| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 260854 | 77 (1.310) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.1% | coding (184/852 nt) | tauB‑I | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 260891 | 77 (1.380) | coding (221/852 nt) | tauB‑I | taurine ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
GAAGCGTTCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCACCGAACGTCACCGGCAGGCTCG > NC_002947/260743‑261038 | gAAGCGTTCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCTGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGa < 4:101863/149‑1 (MQ=255) aaGCGTTCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGAc > 8:61135‑M2/1‑148 (MQ=255) aaGCGTTCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTCGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGAc > 1:30679‑M2/1‑148 (MQ=255) aaGCGTTCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGGTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGAc > 5:297762‑M2/1‑148 (MQ=255) ttCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGAcggcca > 3:107068‑M2/1‑143 (MQ=255) ttCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGCACGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGAcggcc > 1:283490‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGccc > 4:272960/1‑149 (MQ=255) aGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGccc < 1:112417/149‑1 (MQ=255) cGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGtt < 4:215365/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGa < 6:337116/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑TGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGc > 4:290068/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCGTAGTTCGTCTGCATCATCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGc > 1:210594/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGcc < 6:6812/149‑1 (MQ=255) ggCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCg > 4:39043/1‑149 (MQ=255) gCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGt < 8:251176/149‑1 (MQ=255) gACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑TGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCa < 3:290068/147‑1 (MQ=255) gACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCa < 5:151944/147‑1 (MQ=255) gACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTAAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCAcc > 1:113688/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGtt > 7:135885/1‑130 (MQ=255) tGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGtt < 8:135885/130‑1 (MQ=255) cGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTg < 4:287408/149‑1 (MQ=255) gTGGAGCCGGGCT‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCACCGTgg > 2:86228/1‑149 (MQ=255) gCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTc < 6:185684/149‑1 (MQ=255) 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cTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGc < 3:39043/149‑1 (MQ=255) tCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGcaccac < 8:111819/132‑1 (MQ=255) tCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGcaccac > 7:111819/1‑132 (MQ=255) cGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTa < 3:266831/149‑1 (MQ=255) ggTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACAcc > 6:280739/1‑132 (MQ=255) ggTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACAcc < 5:280739/132‑1 (MQ=255) 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ccACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAgg < 3:173048/149‑1 (MQ=255) gTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTg < 4:271183/147‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAgc > 2:135577/1‑149 (MQ=255) cccAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGAcggccagggcgccgagcaacgtcgacttgccacaaccggaggggccgaggatgcagacgaactcgcccggctccacggcaaagtccagccgctgcaccgcctcgaacgcttcgctgccgtgc > 3:168943‑M2/1‑26 (MQ=255) cccAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGNCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAgc < 1:34273/148‑1 (MQ=255) agcagcGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCAc < 5:59817/149‑1 (MQ=255) gcGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCACCGaa < 1:293711/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCACCGAAc < 5:182251/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCACCGAAc > 6:182251/1‑148 (MQ=255) aGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCACCGAACGTCAc > 8:134450/1‑149 (MQ=255) gACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCCCCGAACGTCACCGGCAGGCTcg > 4:227891/1‑149 (MQ=255) | GAAGCGTTCGAGGCGGTGCAGCGGCTGGACTTTGCCGTGGAGCCGGGCG‑AGTTCGTCTGCATCCTCGGCCCCTCCGGTTGTGGCAAGTCGACGTTGCTCGG‑CGCCCTGGCCGGCCACCTGGTGCCCAGCAGCGGCCAGCTGAACGTGGACGGCCAGCCCGTTGACGGGCCGTCACCGCAGCGTGGCATGGTGTTCCAGCACCACACCTTGCTGCCCTGGCGTAGCGTGCTCGACAACGTGGCCTTCGGCCTGAAGATGCAGGGCCTGGAGCGCACCGAACGTCACCGGCAGGCTCG > NC_002947/260743‑261038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |