New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 981803 | 48 (0.820) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.8% | coding (680/1863 nt) | hscA | DnaK‑like molecular chaperone |
? | NC_002947 | = 981841 | 49 (0.880) | coding (718/1863 nt) | hscA | DnaK‑like molecular chaperone |
CCTACGGCCTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGTCAGTGTCAGCCACGG > NC_002947/981698‑981989 | ccTACGGCCTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttc < 1:181437‑M2/149‑6 (MQ=255) ccTACGGCCTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttc > 6:203706‑M2/1‑144 (MQ=255) aCGGTCTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGAc > 7:249416/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttcga > 3:141362‑M2/1‑140 (MQ=255) cTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGc > 1:290772/1‑149 (MQ=255) tGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGc > 6:211473/1‑148 (MQ=255) ccAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTg > 4:302834/1‑149 (MQ=255) aGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGcc < 6:176075/149‑1 (MQ=255) gAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCg > 1:169773/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTg < 5:211473/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCGTGGTGACCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCAGcctgc > 2:177302/1‑145 (MQ=255) gagtggtgTCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGatcatc < 5:356930/147‑1 (MQ=255) gtggtgGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGa < 6:88836/149‑1 (MQ=255) ggtggCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAg > 8:329614/1‑148 (MQ=255) ggtggCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAg > 8:324765/1‑148 (MQ=255) gtggCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCa < 7:329614/149‑1 (MQ=255) gtggCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCa < 7:324765/149‑1 (MQ=255) aTGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGACCTg > 3:163267/1‑149 (MQ=255) tGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCTGCTCGATGATCCAGCCGGcaata < 2:206187/145‑5 (MQ=255) tGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGc < 5:375455/145‑1 (MQ=255) ggcggcGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCAGTCGTCCg > 3:7298/1‑148 (MQ=255) ggcggTACTTTGGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTTGCGTTTTCCAATTGCTGGCCACCGGCGGTTATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCt < 8:235703/149‑1 (MQ=255) ggcggTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCt < 5:33681/149‑1 (MQ=255) gcggTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTg < 2:169773/149‑1 (MQ=255) tttCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCgg > 3:118288/1‑149 (MQ=255) tCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGatca < 6:229500/111‑1 (MQ=255) tCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGatca > 5:229500/1‑111 (MQ=255) tCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCgg < 8:249416/147‑1 (MQ=255) atatTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTAc < 4:7298/148‑1 (MQ=255) tttCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGGAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCa < 2:181437/148‑1 (MQ=255) tCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAgc < 2:290772/148‑1 (MQ=255) gcCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGctgctg > 5:230499/1‑149 (MQ=255) cTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCa < 6:230499/149‑1 (MQ=255) tATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttcgaatacgccagcggtcaggcgcaggatggaaatatcgaaagtaccgccgcccagatcatagatggccaccacgccttcggcgttctggtccaggcc < 3:189770‑M2/149‑102 (MQ=255) tATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttcgaatacgccagcggtcaggcgcaggatggaaatatcgaaagtaccgccgcccagatcatagatggccaccacgccttcggcgttctggtccaggc > 4:189770‑M2/1‑48 (MQ=255) aTTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGcgccg > 6:40188/1‑149 (MQ=255) gAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttcgaatacgccagcggtcaggcgcaggatggaaatatcgaaagtaccgccgcccagatcatagatggccaccacgccttcggcgttctggtccaggccgtagg < 7:156117‑M2/149‑107 (MQ=255) aaGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGacttcgaatacgccagcggtcaggcgcaggatggaaatatcgaaagtaccgccgcccagatcatagatggccaccacgccttcggcgttctggtccaggccgtaggc > 8:156117‑M2/1‑42 (MQ=255) tGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAgg > 3:175396/1‑147 (MQ=255) cTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGc > 7:62392/1‑149 (MQ=255) gCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTAtt > 3:77892/1‑51 (MQ=255) gCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTAtt < 4:77892/51‑1 (MQ=255) cACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCaaa > 3:279448/1‑122 (MQ=255) cACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCaaa < 4:279448/122‑1 (MQ=255) cACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGa < 3:302834/149‑1 (MQ=255) gcggTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGAc > 6:135230/1‑145 (MQ=255) gcggTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGAc < 5:135230/145‑1 (MQ=255) ggTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGc > 7:312461/1‑149 (MQ=255) ggTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGc > 5:342106/1‑149 (MQ=255) tatcaCCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCt > 4:73015/5‑148 (MQ=255) tACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACg > 5:24639/1‑149 (MQ=255) ccGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTg > 4:356281/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGAGCATGCTATTGCCGGGGGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGCCCCGGCGACCCCGCGCGCGCTGCTGCAACCCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTgg > 6:244393/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGatcatc > 6:367222/1‑49 (MQ=255) cGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGatcatc < 5:367222/49‑1 (MQ=255) gCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGACCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGt < 4:163267/149‑1 (MQ=255) ggtggtGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGTCAgtgt > 7:100911/1‑149 (MQ=255) gacgacTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGccc < 6:376221/118‑1 (MQ=255) gacgacTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGccc > 5:376221/1‑118 (MQ=255) gacgacTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGTCAGTGTCAGCCa > 5:65819/1‑149 (MQ=255) acgacTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGTCAGTGTCAGCCAc > 6:291884/1‑149 (MQ=255) gacTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGTCAGTGTCAGCCACgg > 3:68271/1‑149 (MQ=255) | CCTACGGCCTGGACCAGAACGCCGAAGGCGTGGTGGCCATCTATGATCTGGGCGGCGGTACTTTCGATATTTCCATCCTGCGCCTGACCGCTGGCGTATTCGAAGTGCTGGCCACCGGCGGTGATACCGCCTTGGGTGGTGACGACTTCGACCATGCTATTGCCGGCTGGATCATCGAGCAGGCTGGCCTGTCGTCCGATCTGGACCCGGCTACCCAGCGCGCGCTGCTGCAAACCGCCTGCGCCGCCAAGGAAGCCCTGACCGACGCTGACGTGGTCAGTGTCAGCCACGG > NC_002947/981698‑981989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |