New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3912159 | 62 (1.050) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.1% | coding (505/1092 nt) | PP_3452 | GGDEF domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 3912189 | 51 (0.900) | coding (535/1092 nt) | PP_3452 | GGDEF domain‑containing protein |
CTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGCCGACCGCCAGCTGCGGA > NC_002947/3912048‑3912336 | cTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagcta > 7:217114/1‑149 (MQ=255) gTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATcc > 8:109945/1‑149 (MQ=255) aTTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGc < 7:109945/148‑1 (MQ=255) aTTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGc > 7:257886/1‑148 (MQ=255) ttcttcTGCGCCATGGTCATCAGCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGc > 7:236423/1‑147 (MQ=255) ttcttcTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCTCATCGATTTTTTTGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCaa < 1:304292/149‑1 (MQ=255) ctcttctGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCaa < 4:298292/148‑1 (MQ=255) ttctGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAgg > 8:126391/1‑148 (MQ=255) cATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTg > 2:176572/1‑148 (MQ=255) tcatcaCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAAt > 2:234338/1‑149 (MQ=255) tcaCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTc > 5:201156/1‑149 (MQ=255) caCCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTc > 8:281422/1‑148 (MQ=255) ccTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTAc < 6:169288/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTAc < 8:182610/149‑1 (MQ=255) aTGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCaa < 8:236423/149‑1 (MQ=255) tGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAg < 7:126391/149‑1 (MQ=255) cTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGgt > 8:239917/1‑149 (MQ=255) cTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGgt > 7:95396/1‑149 (MQ=255) aaTCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGgtgt < 7:239917/148‑1 (MQ=255) aTCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTg < 1:234338/149‑1 (MQ=255) tCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGc > 8:331832/1‑149 (MQ=255) ccGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTcagctacagc > 6:103102/1‑93 (MQ=255) cGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTg < 7:281422/149‑1 (MQ=255) gTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGc > 2:90249/1‑119 (MQ=255) gTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGc < 1:90249/119‑1 (MQ=255) aCCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGa > 2:329458/1‑145 (MQ=255) aCCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGa < 1:329458/145‑1 (MQ=255) acacCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGcc < 7:119493/149‑1 (MQ=255) cacCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCt < 2:120738/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGAGCGCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGTTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGt < 6:334089/149‑1 (MQ=255) cGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGt < 1:176572/149‑1 (MQ=255) cATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAAttt > 1:121996/1‑111 (MQ=255) cATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAAttt < 2:121996/111‑1 (MQ=255) aGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGcc > 4:96499/1‑149 (MQ=255) gATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGAc < 8:101893/149‑1 (MQ=255) cgcTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGAc < 4:257531/149‑1 (MQ=255) gcTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACa > 1:256077/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTc < 8:257886/148‑1 (MQ=255) ggCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAATGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCaa < 6:201156/149‑1 (MQ=255) gcgcCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAAc > 5:60962/1‑149 (MQ=255) gcgcCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAAc < 3:96499/149‑1 (MQ=255) cATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGtcagcatggcgccttcgagcgcatcgggctcgatgcgggtgtggtagaacggattaagcatcacccaggtgatgaccatggcgcagaagaatgaccagcgccgcaccgg < 2:270292‑M2/147‑110 (MQ=255) gCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCt > 5:247620/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGtcagcatggcgccttcgagcgcatcgggctcga > 6:165724‑M2/1‑31 (MQ=255) aTCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGtcagcatggcgccttcgagcgcatcgggctcga < 5:165724‑M2/64‑34 (MQ=255) aGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAg > 2:277418/1‑103 (MQ=255) aGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAg < 1:277418/103‑1 (MQ=255) gCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATg < 2:256077/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATgg < 7:331832/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATgg < 8:217114/149‑1 (MQ=255) ccGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAg > 5:200741/1‑149 (MQ=255) cGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAgg > 5:171370/1‑149 (MQ=255) gtgtTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATg < 3:255961/141‑1 (MQ=255) gtgtTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGc < 6:60962/149‑1 (MQ=255) gtgtTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACATGCAGATCCGCAACGCCAAGCTCCACAAATTCTACCTGTCAAACGTGTTGATCGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACAGACATTCCAAACCGCCGCTCCTTCATgtagatcg > 4:255961/1‑141 (MQ=255) ccTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGCCGACCGCCAGCTGc > 8:209978/1‑149 (MQ=255) cTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGCCGACCGCCAGCTGCg < 7:276219/149‑1 (MQ=255) tGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGCCCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGCCGACCGCCAGCTGCg > 4:203642/1‑148 (MQ=255) gTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGc < 4:257464/131‑1 (MQ=255) gTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGCCGACCGCCAGCTGCGGa < 8:95396/148‑1 (MQ=255) | CTACCGGTGCGGCGCTGGTCATTCTTCTGCGCCATGGTCATCACCTGGGTGATGCTTAATCCGTTCTACCACACCCGCATCGAGCCCGATGCGCTCGAAGGCGCCATGCTGATCAGCTATGCCGTGTTTCTAAGCGGCCTGGTCAGCTACAGCTACCTGCAGATCCGCAAGGCCAAGCTGCACAATTTCTACCTGTCCAAGGTGTTGCTGGAGCAAGCCTACGTCGATGCCCTGACCGACATTCCCAACCGCCGCTCGTTCATGGCCCAGGCCGACCGCCAGCTGCGGA > NC_002947/3912048‑3912336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |