| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4247728 | 47 (0.800) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 6.1% | coding (189/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
| ? | NC_002947 | = 4247766 | 48 (0.870) | coding (151/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI | |||||
ATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGTCATT > NC_002947/4247618‑4247913 | aTCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTg > 1:323445/1‑149 (MQ=255) tCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGg < 1:135782‑M2/149‑2 (MQ=255) aCCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGCAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgc > 8:120887‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcggg < 5:88978‑M2/149‑6 (MQ=255) aTCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGCAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCaa < 1:209973/149‑1 (MQ=255) tCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAAt < 3:272187/149‑1 (MQ=255) ggCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATa < 2:323445/148‑1 (MQ=255) aCCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATg > 3:42675/1‑149 (MQ=255) gAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCg < 6:297532/149‑1 (MQ=255) tCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAAt < 2:338518/149‑1 (MQ=255) ggggTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCAc < 2:135782/148‑1 (MQ=255) ggggTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACg < 4:42675/149‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTAc < 2:119166/149‑1 (MQ=255) gCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACa < 8:184544/148‑1 (MQ=255) gTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGGTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAggg < 1:32910/148‑1 (MQ=255) gTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGgt > 8:198513/1‑149 (MQ=255) tCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGgtg < 7:63152/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt < 5:77686/148‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGtgtg > 7:306105/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACg > 7:308747/1‑149 (MQ=255) gggCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt > 4:149490/1‑142 (MQ=255) gggCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt < 3:149490/142‑1 (MQ=255) gCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCgg < 6:88978/149‑1 (MQ=255) cGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGccc < 3:197256/110‑1 (MQ=255) cGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGccc > 4:197256/1‑110 (MQ=255) tgaCGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCg < 2:142933/149‑1 (MQ=255) aGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg < 7:198513/149‑1 (MQ=255) aGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg < 8:306105/149‑1 (MQ=255) acCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGtctc > 3:211951/1‑149 (MQ=255) cccccGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTcc > 1:257262/1‑149 (MQ=255) ccccGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACCGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCa > 3:296104/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGc < 4:99805/149‑1 (MQ=255) cACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTg > 4:347835/1‑149 (MQ=255) cTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtcagtggcaagccgggggtgtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccaagcctatgccgactcggtgccgat < 7:59469‑M2/149‑103 (MQ=255) gACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGcc > 3:266601/1‑148 (MQ=255) aCCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCTACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACg < 4:220809/135‑1 (MQ=255) aCCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCGACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACg > 3:220809/1‑135 (MQ=255) cccGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACAAGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTCCAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGACCACGGTCGCCACGCCGTAGTTGGCcaa > 1:212038/1‑148 (MQ=255) ccGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCcaac > 8:28089/1‑148 (MQ=255) gcgcgTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtcagtggcaagccgggggtgtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccaagcctatgccgactcggtgccgatgctggt < 1:364982‑M2/148‑109 (MQ=255) gcgcgTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCaacaac < 8:308747/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAac < 5:40533/115‑1 (MQ=255) gTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAac > 6:40533/1‑115 (MQ=255) cGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtcagtggcaagccgggggtgtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccaagcctatgccgactcggtgccgatgctggtgatttccagc > 2:364982‑M2/1‑31 (MQ=255) ccATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTgg > 4:160368/1‑149 (MQ=255) cATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGc < 3:347835/149‑1 (MQ=255) aTGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGCGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGcc > 4:101302/1‑149 (MQ=255) aTGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGCCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGcc > 1:291199/1‑149 (MQ=255) tGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCg > 6:359429/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCTAACACg < 1:1086/102‑1 (MQ=255) aaGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg > 2:1086/1‑102 (MQ=255) gCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCTCTGCCAGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTg > 4:65685/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTg > 5:144513/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCg < 7:325068/137‑1 (MQ=255) ccTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCg > 8:325068/1‑137 (MQ=255) cTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTaa < 5:359429/149‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAg > 2:186698/1‑149 (MQ=255) tGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAg > 1:56963/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGt > 5:222079/1‑148 (MQ=255) gTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGtcat < 7:28089/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTCAATACATGGTGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGtcatt > 2:259247/1‑148 (MQ=255) | ATCACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGTCATT > NC_002947/4247618‑4247913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |