| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5727157 = | 56 (0.950) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.4% | coding (1481/1680 nt) | opgG | glucans biosynthesis protein G |
| ? | NC_002947 | 5727201 = | 53 (0.950) | coding (1437/1680 nt) | opgG | glucans biosynthesis protein G | |||||
GTTGTTCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTT > NC_002947/5727053‑5727331 | gttgttCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGAc > 2:74834/1‑149 (MQ=255) gttCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttg > 3:106172/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgt > 2:107282/1‑149 (MQ=255) gcgacaacgccgaggtggtcgagaacaatctgcgctataaccctgagaccaagggctggcgcctgaccctgcgcctgaaggtcaaggaagccaacaagTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgttg > 8:81673‑M1/99‑149 (MQ=255) ggCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgttg < 4:106172/148‑1 (MQ=255) ttGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCATGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTc > 8:99701/1‑149 (MQ=255) gCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCtt > 8:108997/1‑149 (MQ=255) gCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCtt > 8:248164/1‑149 (MQ=255) aGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGa < 1:107282/149‑1 (MQ=255) gATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGAc > 1:245090/1‑149 (MQ=255) cTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTc < 7:210239/148‑1 (MQ=255) tCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAg > 1:78611/1‑149 (MQ=255) tCAGACTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGATTGGCTTGCTGGGAAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCAACAGTGCGGCGCGCAATTCGGTAGACTAGTTGGATTCCTTGACCTTCAg > 3:146803/1‑149 (MQ=255) gCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACCTTCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGgc < 1:291804/149‑1 (MQ=255) ttGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAg > 4:89404/1‑149 (MQ=255) gACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAg < 2:78611/147‑1 (MQ=255) cGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTc < 2:69016/149‑1 (MQ=255) ggCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCa < 7:99701/149‑1 (MQ=255) tttCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgttg < 5:274174/118‑1 (MQ=255) tttCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgttg < 5:269181/118‑1 (MQ=255) tttCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgttg > 6:269181/1‑118 (MQ=255) tttCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACttgttg > 6:274174/1‑118 (MQ=255) ttCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGgcg > 7:43576/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGgcgc > 3:308394/1‑149 (MQ=255) ggCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg < 2:245090/148‑1 (MQ=255) aTGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGtct > 1:261896/1‑149 (MQ=255) aTGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGtc > 7:288630/1‑148 (MQ=255) ggCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCa < 8:132746/119‑1 (MQ=255) ggCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCa > 7:132746/1‑119 (MQ=255) cGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAg < 2:310803/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAgcgc < 8:288630/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑GATGAGGCACCAGTGCGGCGCGCTTTTGGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGTCCTTCTGGCTCAGGGTCAGGCGCCAGACCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGAAGa < 4:146803/148‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGa < 2:261896/148‑1 (MQ=255) cTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTtct > 7:210040/1‑149 (MQ=255) cTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTtc < 7:248164/148‑1 (MQ=255) ggCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg < 8:99023/118‑1 (MQ=255) tCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGaccac < 8:47909/149‑1 (MQ=255) tCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGacca > 4:254171/1‑148 (MQ=255) ggCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCtt > 6:126260/1‑108 (MQ=255) ggCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCtt < 5:126260/108‑1 (MQ=255) ggCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCg < 1:224118/139‑1 (MQ=255) ggCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCg > 2:224118/1‑139 (MQ=255) ggCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCgg > 7:306071/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCg < 8:273178/137‑1 (MQ=255) cAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCg > 7:273178/1‑137 (MQ=255) aGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCATGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGt < 3:254171/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGTGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTg > 8:132082/1‑149 (MQ=255) ggCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTc < 3:89404/147‑1 (MQ=255) gCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGc < 7:108997/148‑1 (MQ=255) caacaagtcgaccgaaatgcgcgccgcactggtgcgtgatgtaccggtcgaCTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGc > 8:81673‑M2/52‑149 (MQ=255) cTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGc > 3:63016/1‑149 (MQ=255) tcgaccgaaatgcgcgccgcactggtgcgtgatgtaccggtcgaCTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCt > 5:298422‑M2/45‑149 (MQ=255) GACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGa < 7:316529‑M1/149‑1 (MQ=255) accgaaatgcgcgccgcactggtgcgtgatgtaccggtcgaCTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGAt < 7:81673‑M2/108‑1 (MQ=255) tCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTtctc > 8:163003/1‑110 (MQ=255) tCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTtctc < 7:163003/110‑1 (MQ=255) aCCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCAcggc > 8:354180/1‑149 (MQ=255) aGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACggcggc < 8:316529/149‑1 (MQ=255) gTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg < 4:309197/71‑1 (MQ=255) gTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg > 3:309197/1‑71 (MQ=255) ggcgCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCtt < 8:43576/149‑1 (MQ=255) | GTTGTTCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTA‑CATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGTTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTT > NC_002947/5727053‑5727331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |