| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,707 | G→C | 5.4% | D38E (GAC→GAG) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,707 | 0 | G | C | 5.4% | 281.0 / 4.0 | 87 | D38E (GAC→GAG) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/39); new base C (3/2); total (46/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
GCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGC > NC_002947/1561‑1854 | gCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCATACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTc < 4:91712/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt < 1:332343/149‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca < 1:260185/149‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCAAAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGAGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca < 7:250817/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATCCGCAgg < 3:248127/149‑1 (MQ=255) ctggaGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGac < 1:298014/145‑1 (MQ=255) gAAGCCTCTGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGacac > 4:90955/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGacac > 6:158166/1‑149 (MQ=255) cTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacgacac > 5:80868/1‑147 (MQ=255) cTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCg > 1:363760/1‑149 (MQ=255) ggAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcag > 2:221154/1‑149 (MQ=255) agtagtGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcagcc < 4:245107/149‑1 (MQ=255) aTAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgca > 1:120860/1‑118 (MQ=255) aTAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgca < 2:120860/118‑1 (MQ=255) gggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc > 8:180791/1‑110 (MQ=255) gggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc < 7:180791/110‑1 (MQ=255) ggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACACTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAt < 6:80868/149‑1 (MQ=255) cAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGa < 3:23013/149‑1 (MQ=255) gTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCtt < 8:49334/117‑1 (MQ=255) gTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCtt > 7:49334/1‑117 (MQ=255) gCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCATGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAgg < 1:238702/149‑1 (MQ=255) gCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAgg > 8:247165/1‑149 (MQ=255) gCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAgg > 7:24219/1‑149 (MQ=255) gCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGCTCGCTCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAgg > 5:363968/1‑149 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCTGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtg > 1:303057/1‑149 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtg > 1:4405/1‑149 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtg < 1:221154/149‑1 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcag > 1:326826/1‑118 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcag < 2:326826/118‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTg > 8:260425/1‑149 (MQ=255) cGATGAGCAGGTCGTAGACCTATGGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCTTGGTGGCTTTGCCCTGCGTATCGCGGTCGAACAGCTGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTc < 2:363760/149‑1 (MQ=255) aTGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt > 3:348746/1‑86 (MQ=255) aTGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt < 4:348746/86‑1 (MQ=255) gCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGcc > 5:315280/1‑148 (MQ=255) gCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGcc > 3:37628/1‑148 (MQ=255) gCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGcc > 2:244892/1‑148 (MQ=255) ggTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCcaca > 7:119265/1‑149 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGGTCCAAACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCAcacca > 1:210748/1‑149 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGCTTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCAcaccac > 6:310237/1‑149 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCAcaccac > 4:216820/1‑149 (MQ=255) gACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACAACGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTAGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCtt > 4:45792/1‑149 (MQ=255) aCCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCtt > 4:366983/1‑148 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCtt > 6:371989/1‑131 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCtt < 5:371989/131‑1 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCAAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 5:314986/149‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGtt < 8:119265/149‑1 (MQ=255) cTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcg > 5:204002/1‑149 (MQ=255) tCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCtt < 4:269892/125‑1 (MQ=255) tCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCtt > 3:269892/1‑125 (MQ=255) gAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGa < 7:260425/149‑1 (MQ=255) gCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGaa > 4:290091/1‑148 (MQ=255) gTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATAcc < 6:204002/148‑1 (MQ=255) tCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCt > 3:144924/1‑148 (MQ=255) ccACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCt > 6:334122/1‑147 (MQ=255) cacaCCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCGTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAg > 5:223644/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 6:300634/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc < 3:290091/149‑1 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 3:349872/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc < 3:366983/149‑1 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGCATCGAGGTCGATCAGCAGGCCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATAAACGTGG‑‑ATGTCTTGCCAACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 5:188043/1‑149 (MQ=255) acCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCa > 5:42534/1‑149 (MQ=255) gCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt > 4:62188/1‑145 (MQ=255) gCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt < 3:62188/145‑1 (MQ=255) cccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc < 4:349872/149‑1 (MQ=255) cATGTTGGCGTTTCCCTGCGGTTGTAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGATGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACGTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 6:188043/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 1:244892/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 5:300634/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 2:303057/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 7:247165/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 2:4405/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAg > 2:172013/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTc > 4:68366/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTc > 8:254897/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTc < 2:210748/148‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTTCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCa < 1:279731/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCt < 8:144709/125‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttgt < 8:69468/135‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttgt > 7:69468/1‑135 (MQ=255) ttGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAg < 6:223644/149‑1 (MQ=255) tccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 2:83653/2‑149 (MQ=255) cccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 6:362945/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa > 3:18571/1‑122 (MQ=255) ccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa < 4:18571/122‑1 (MQ=255) tGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGAAAAGGCTTGCCCACATAACCTATATGGTTAGCGATTGAGAATACATTAGCCATTGTTGCGAGTGTTACCAgaaat > 1:114941/1‑145 (MQ=255) gCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGcc > 7:54356/1‑149 (MQ=255) ggATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCtt < 5:334122/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg < 3:312960/149‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg < 2:3137/145‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcg > 1:3137/1‑145 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGgcgc < 3:68366/149‑1 (MQ=255) | GCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTT‑GTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGG‑‑TTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGC > NC_002947/1561‑1854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |