| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,829,766 | T→C | 5.8% | Q475R (CAG→CGG) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,829,766 | 0 | T | C | 5.8% | 210.4 / 2.1 | 69 | Q475R (CAG→CGG) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/31); new base C (2/2); total (36/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 | |||||||||||
GTCGGCGACGACCTGGCGCAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTCTGGCCGTC > NC_002947/4829618‑4829914 | gTCGGCGACGACCTGGCGCAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCt > 2:11584/1‑149 (MQ=255) tCGGCGACGACCTGGCGCAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTg > 7:53099/1‑149 (MQ=255) gCGACGACCTGGCGCAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGAc < 2:26794/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCt > 6:207230/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAg < 7:184712/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTc < 7:322484/138‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACAGCGACACCGATGCCCTCATCGCCCTGGTGCTCGACTGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGACCCTGGACTTc > 8:322484/1‑138 (MQ=255) tCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTg < 8:83567/127‑1 (MQ=255) tCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTg > 7:83567/1‑127 (MQ=255) tCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCtttt > 7:2100/1‑149 (MQ=255) gATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTcc > 4:150386/1‑148 (MQ=255) tCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAg > 4:129310/1‑149 (MQ=255) tCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCCGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAg > 2:80812/1‑149 (MQ=255) ggTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑Tcc < 1:251076/149‑1 (MQ=255) gTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGa > 4:293847/1‑131 (MQ=255) gTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGa < 3:293847/131‑1 (MQ=255) ccTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGc > 2:217986/1‑149 (MQ=255) gCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAg < 4:216742/124‑1 (MQ=255) ttGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAg > 4:121125/1‑149 (MQ=255) gAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAgg < 3:153510/148‑1 (MQ=255) gAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAg < 3:297434/147‑1 (MQ=255) gAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATATCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCTCCTGGACTTCACGCTCGAgg > 5:313488/1‑121 (MQ=255) gAGTGCCGTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCTACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAgg < 6:313488/121‑1 (MQ=255) gTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTAc < 6:238048/143‑1 (MQ=255) gTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTAc > 5:238048/1‑143 (MQ=255) ccTTTTGCACGTTGCGGCTGATCACCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGt > 6:361246/1‑149 (MQ=255) 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gCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGc < 5:104903/148‑1 (MQ=255) gCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCa > 3:10970/1‑149 (MQ=255) cTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCAt < 4:102653/149‑1 (MQ=255) cTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCAt > 3:102653/1‑149 (MQ=255) cTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCCGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCAt < 1:80812/149‑1 (MQ=255) tcCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCttt > 4:345923/1‑149 (MQ=255) cACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCtt < 3:121125/146‑1 (MQ=255) gACACCGATGGCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGGCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGGTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGcc < 6:25299/149‑1 (MQ=255) gACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGcc < 6:329575/149‑1 (MQ=255) cacCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCg < 1:11584/149‑1 (MQ=255) acCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCgg > 4:107419/1‑149 (MQ=255) aTGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAAc < 8:53099/149‑1 (MQ=255) aTGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAAc < 5:361246/149‑1 (MQ=255) aTGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAAc < 3:129310/149‑1 (MQ=255) cctcctCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACAGCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGaa > 1:33931/1‑148 (MQ=255) cctcctCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGaa < 3:37003/148‑1 (MQ=255) ctcctcGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAaca > 7:220922/1‑149 (MQ=255) tcctcGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAacac > 2:296614/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGccc > 4:345307/1‑149 (MQ=255) tCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAAt > 1:125900/1‑149 (MQ=255) tCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAAt > 7:264281/1‑149 (MQ=255) gACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATg < 3:35931/148‑1 (MQ=255) gACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATg < 1:217986/148‑1 (MQ=255) cGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGaaa < 3:345923/149‑1 (MQ=255) acacCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAgg < 5:207230/149‑1 (MQ=255) acCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTGACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTc > 5:293505/1‑149 (MQ=255) cacaCGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCgg < 8:220922/149‑1 (MQ=255) acacGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCgg > 6:282870/1‑148 (MQ=255) acGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCAGGTAc > 5:338558/1‑149 (MQ=255) ggCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACg > 6:104678/1‑148 (MQ=255) gCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCa < 5:104678/149‑1 (MQ=255) ctatGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGc > 3:102589/4‑149 (MQ=255) cgcAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAgg < 5:282870/148‑1 (MQ=255) gcagcaCCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAGTTCTTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCGGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCGGGTAACGAACCCCTCGCCGTCACGATTGAAACCAAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGt > 1:253035/1‑149 (MQ=255) gcagcaCCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGCCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTc > 5:62723/1‑149 (MQ=255) gcaCCTTGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGGCCCGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTCt < 1:296614/149‑1 (MQ=255) cTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTCTGGCCGt > 7:239254/1‑149 (MQ=255) cTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTCTGGCCGt < 3:107419/149‑1 (MQ=255) tGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTCTGGCCGTc > 1:49684/1‑149 (MQ=255) | GTCGGCGACGACCTGGCGCAGGGTCTTGATCAGGTCCTGGGGCTTGAGTGCCTTTTGCACGTTGCGGCTGATCTCCACCGCGACACCGATGCCCTCCTCGCCCTGGTGCTCGACGGCGAACACCGCCACACGGCCTTTGCGCAGCACCTGGACTTCACGCTCGAGGGCTTTTTCCAAG‑TCCTGCGGGTACAGGTTCTGTCCGCGCACGATCAGCATGTCTTTCAGG‑‑CGCCCGGTAACGAACACCTCGCCCTCACGAATGAAACCCAGGTCGCCGGTACGCAGCCAGGTCTGGCCGTC > NC_002947/4829618‑4829914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |