Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,951,279 | T→C | 6.7% | I332V (ATC→GTC) | fliK ← | flagellar hook‑length control protein FliK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,951,279 | 0 | T | C | 6.7% | 173.5 / 2.8 | 61 | I332V (ATC→GTC) | fliK | flagellar hook‑length control protein FliK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/26); new base C (2/2); total (32/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 |
CTGCGCCTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCG > NC_002947/4951133‑4951427 | cTGCGCCTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCtgatg > 5:329520/1‑148 (MQ=255) gcCTGGCCCTGCTGGTGTTGCTGCACGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGt < 4:289250/149‑1 (MQ=255) cTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGa > 2:158681/1‑149 (MQ=255) cTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGACGAAGGTGa > 7:162437/1‑149 (MQ=255) cTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGACGAAGGTGa > 3:198541/1‑149 (MQ=255) ccccTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCt < 2:180679/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTCGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTgg > 7:274995/1‑149 (MQ=255) ctgTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTg < 6:92692/148‑1 (MQ=255) gttgttGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGcc > 7:302916/1‑149 (MQ=255) gctgcCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTc < 6:329520/148‑1 (MQ=255) gcCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTg > 6:106986/1‑142 (MQ=255) gcCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTg < 5:106986/142‑1 (MQ=255) tGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGAc > 4:32088/1‑149 (MQ=255) ccACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATg > 1:356384/1‑149 (MQ=255) gACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAgg < 2:356384/148‑1 (MQ=255) aTCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGAc < 4:77090/102‑1 (MQ=255) aTCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGAc > 3:77090/1‑102 (MQ=255) ccGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑cc > 2:91778/1‑148 (MQ=255) gCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCaa < 5:315436/120‑1 (MQ=255) gCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCaa > 6:315436/1‑120 (MQ=255) cTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGtt < 1:158681/149‑1 (MQ=255) gcCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTctgc > 3:235642/1‑149 (MQ=255) ccccTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCGGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCt > 4:360302/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTc > 3:198273/1‑148 (MQ=255) tgctgGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAg > 7:319636/1‑149 (MQ=255) ggCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTTGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGTCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGAcgc < 1:107598/110‑1 (MQ=255) ggCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGa < 3:363197/149‑1 (MQ=255) ggCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGa > 7:292127/1‑149 (MQ=255) ggCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTCGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGTCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGAcgc > 2:107598/1‑110 (MQ=255) cAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGt > 1:234426/1‑90 (MQ=255) cAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGt < 2:234426/90‑1 (MQ=255) aaaCAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACAt > 1:53522/1‑101 (MQ=255) aaaCAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACAt < 2:53522/101‑1 (MQ=255) aaaCAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTAACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGatat > 5:294282/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGatat > 3:62451/1‑148 (MQ=255) aaCAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATc < 2:330307/149‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGACGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGcc < 8:162437/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGACGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCGGTTGGATATCAGcc < 4:198541/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACt > 5:330543/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGa < 8:302916/149‑1 (MQ=255) ggTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTc < 3:32088/149‑1 (MQ=255) cACGTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGGCGCTGAGGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGTTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCCGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTctggc < 8:274995/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTctggctg > 7:36693/1‑149 (MQ=255) cTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGACCCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTctggctg < 1:91778/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTctggctg > 8:251278/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGa < 8:319636/147‑1 (MQ=255) gCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGAc < 4:198273/148‑1 (MQ=255) cTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAg < 6:330543/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAgg > 3:143976/1‑148 (MQ=255) tCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTa < 7:251278/149‑1 (MQ=255) gggCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACAt > 7:248277/1‑148 (MQ=255) gggCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACAt > 3:151181/1‑148 (MQ=255) cGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTAACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGAcc < 6:294282/149‑1 (MQ=255) aCGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGCTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATCTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGTTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGAc > 5:60673/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGAc > 6:198690/1‑147 (MQ=255) gCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGAc > 6:125487/1‑147 (MQ=255) cGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGAcc < 1:109545/137‑1 (MQ=255) cGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGAcc > 2:109545/1‑137 (MQ=255) gCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGACCAGGCCCTCgg < 4:151181/149‑1 (MQ=255) ccGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGACCAGGCCCTCGGc < 5:125487/149‑1 (MQ=255) gCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCgg < 8:110988/130‑1 (MQ=255) gCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCgg > 7:110988/1‑130 (MQ=255) gatgaAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAg > 5:121005/1‑99 (MQ=255) gatgaAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAg < 6:121005/99‑1 (MQ=255) tgaAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCg < 4:62451/149‑1 (MQ=255) | CTGCGCCTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCCCGCGCGACTGGTCAGCCACGTTGACATCCGGCTGCGCCAACCCCTGCTGGGCAAACAGTTCGCGCAGGCGGTGCACCTGGCTGTCGAGGGCGTCACGTACGCCGGCGTGGCCGCTGATGAAGGTGACCTGGGTGGCCTGGTCCGCCGCAACATTGACGCGAATGTCGAGGCGA‑CCGAGTTCTGCTGGCTCCAGTTGGATATCAGCCGACTTGAGGTTCTGGCTGGACAGGTACATGACCCGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCG > NC_002947/4951133‑4951427 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |