Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,041,195 | C→G | 7.5% | intergenic (+173/‑489) | PP_5680 → / → PP_4447 | Cro/CI family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,041,195 | 0 | C | G | 7.5% | 290.2 / 8.5 | 90 | intergenic (+173/‑489) | PP_5680/PP_4447 | Cro/CI family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/40); new base G (2/5); total (45/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACACTTGTACTCCACACCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAGTAGAGC > NC_002947/5041048‑5041342 | acacTTGTACTCCACACCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGg‑cgcg > 2:256903/1‑149 (MQ=255) acTTGTACTCCACACCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGcc > 6:8284/1‑149 (MQ=255) ttGTACTCCACACCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCt > 2:205182/1‑148 (MQ=255) gTACTCCACACCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCtt > 1:276225/1‑147 (MQ=255) cacaCCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCccgc > 6:89605/1‑149 (MQ=255) cccAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCccgcc < 6:70333/146‑1 (MQ=255) cccAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCccgcc > 5:70333/1‑146 (MQ=255) aGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGGGCTTAAGGCGCGCCgatgaa < 8:183197/149‑5 (MQ=255) gTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGa‑gaaga < 2:276225/149‑1 (MQ=255) gTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGa‑gaaga < 8:143623/149‑1 (MQ=255) gTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTC‑TCGG‑CGGGCTTAAGGCGCGCCGATgaaga < 3:149848/149‑1 (MQ=38) tctcACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAagag > 8:197380/1‑149 (MQ=255) tcACATCTGACCCTGTCAGCGACGGTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGc > 7:52526/1‑148 (MQ=255) tcACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAataga > 8:146935/1‑147 (MQ=255) cacaTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGc > 5:241560/1‑147 (MQ=255) acaTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGGCCGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCa < 1:205182/149‑1 (MQ=255) acaTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGc > 6:139066/1‑146 (MQ=255) acaTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCa < 8:52526/148‑1 (MQ=255) aaaTCTGACCCTGTCAGCGACCCTAATGACGGTGTTGATCCAGAGAGGGTTAGGGAAATCCTTAAGGCTTAATTGTCTGATACCAACTCCTCTGCGATGATTACATGACATCTTCATCGT‑CGGGCCTTAAGCCCTCAGA‑GAATAGCCag < 8:341501/147‑1 (MQ=255) caTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTC‑TCGG‑CGGGCTTAAGGCGCGCCgatgaa < 1:334048/141‑5 (MQ=255) caTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTC‑TCGG‑CGGGCTTAAGGCGCGCCgatgaa > 2:334048/1‑137 (MQ=255) aTCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCagag > 8:276134/1‑149 (MQ=255) aCCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGAcccc > 1:305695/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) cAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGACAGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGc > 8:307353/1‑146 (MQ=255) aGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGa < 2:305695/149‑1 (MQ=255) gCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGAc > 1:135736/1‑149 (MQ=255) gCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGAc < 5:89605/149‑1 (MQ=255) gACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGAccc < 6:155051/149‑1 (MQ=255) aCGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGAcccc < 3:170863/149‑1 (MQ=255) tAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAAc > 3:362680/1‑149 (MQ=255) tAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAAc > 2:307907/1‑149 (MQ=255) tAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTAATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAACACACCTAAc > 1:184448/1‑149 (MQ=255) gACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGcc > 6:274469/1‑149 (MQ=255) aCGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCt > 6:273753/1‑149 (MQ=255) aCGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCt > 4:198455/1‑149 (MQ=255) ggTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCCACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTa > 8:281611/1‑149 (MQ=255) tCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCATAAGGCGGt < 3:66048/148‑1 (MQ=255) cacaGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTtc > 7:6954/1‑149 (MQ=255) acaGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTtct < 5:8284/149‑1 (MQ=255) caGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTtctc < 3:125378/149‑1 (MQ=255) agagGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTctct < 7:276134/149‑1 (MQ=255) ggTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCt < 7:146935/149‑1 (MQ=255) ttAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTcc < 1:116590/149‑1 (MQ=255) 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cAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTccaac < 6:241560/149‑1 (MQ=255) ggACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGAc > 7:303126/1‑149 (MQ=255) ggACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGACAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGAc > 4:260391/1‑149 (MQ=255) gACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGAcc > 5:23592/1‑149 (MQ=255) gACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGACTTAAGCCAGCCGA‑GAACAGCGAGAGACACCGAGCAAGCCCCCTAACCGCCATATGGCGGTTTCTCTTCCTCCAAGTATGCTGGGACTGCAGATATCCGAGTCCCCCAAATGCTATTTTTAGAcc > 4:184369/1‑149 (MQ=255) cATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTg < 6:23592/149‑1 (MQ=255) aTGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGAc < 6:281957/61‑1 (MQ=255) aTGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGAc > 5:281957/1‑61 (MQ=255) aTGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTgg > 7:21549/1‑149 (MQ=255) aTGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGACACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCCGTTTCTCTGCCTCCCCCTCTGCTGCGAAGGCCGAGAGCCGACTCCAACCAAATCTAATTTTCGACCTgg > 7:72814/1‑149 (MQ=255) ctctTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCTCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATATCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGa < 6:371603/149‑1 (MQ=255) ctctTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCt < 4:268968/147‑1 (MQ=255) ctctTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCt > 3:268968/1‑147 (MQ=255) tctTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCACTAACAGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTATATTTATCGACCAGGCCTGa > 4:26935/1‑148 (MQ=255) ttgaTCGG‑CTCGCATTAAGCCCGCCGA‑GAATAGCCAGAGACCGCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCATTCTGCTGCGTATGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGAc < 2:184448/144‑1 (MQ=255) tCGG‑CGGGCTTAAGGCGCGCCGATGAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTAt > 7:340932/1‑65 (MQ=18) tCGG‑CGGGCTTAAGGCGCGCCGATGAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTAt < 8:340932/65‑1 (MQ=18) tCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCAAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAg > 4:290801/1‑148 (MQ=255) cgg‑cggGCTTAAGGCGCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAg > 8:30875/1‑147 (MQ=255) gg‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAGTa < 7:281611/148‑1 (MQ=255) gg‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAGTa < 2:135736/148‑1 (MQ=255) g‑cgtgcCTTAAGCCCTCAGA‑GAAGATCCTGAGACCCCTAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCTGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTGTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAGTaga < 7:344506/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAGTAGAGc > 7:22694/1‑149 (MQ=255) | ACACTTGTACTCCACACCCAGTCTCACATCTGACCCTGTCAGCGACGCTAATGACGGTGTTGATCCACAGAGGGTTAGGGATAGCCTTAAGGCGTAATTGTCTGATACCAACACCTCTGCGATGAGGACATGACCTCTTCATCGG‑CGCGCCTTAAGCCCGCCGA‑GAAGAGCCAGAGACCCCGAGCAAGACCCCTAACCGCCTTATGGCGGTTTCTCTGCCTCCCAGTCTGCTGCGAAGGCCGATAGCCGAGTCCAACCAATTCTATTTTTCGACCTGGCCTGACCGCAGTAGAGC > NC_002947/5041048‑5041342 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |