| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,123,458 | T→A | 5.1% | D225V (GAC→GTC) | PP_4510 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,123,458 | 0 | T | A | 5.1% | 239.6 / 2.6 | 78 | D225V (GAC→GTC) | PP_4510 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/40); new base A (2/2); total (36/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 | |||||||||||
CGGCCCCCTGCCCTCGAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAGGTACGC > NC_002947/5123314‑5123606 | cggcCCCCTGCCCTCGAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCAc > 8:100990/1‑149 (MQ=255) ccccTGCCCTCGAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTca > 1:177418/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCTCGAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcacc > 7:97031/1‑149 (MQ=255) cccTCGAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcacccacc > 6:156479/1‑149 (MQ=255) gatccTTAAGCCGGCTCGAGAAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGc < 7:341004/145‑1 (MQ=255) gAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGc < 3:66301/148‑1 (MQ=255) aGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCTCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCTTCCCAATGCTCGATCAGGTCCTTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCgg < 5:166511/149‑1 (MQ=255) ccTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGAt < 1:132002/149‑1 (MQ=255) tAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGAtctc > 5:240324/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcaccc > 8:113611/1‑134 (MQ=255) aaGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcaccc < 7:113611/134‑1 (MQ=255) aGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTGGACTACCTcaattgcg < 6:3575/136‑7 (MQ=255) aGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTGGACTACCTcaattgcg > 5:3575/1‑130 (MQ=255) aGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCg < 7:100990/148‑1 (MQ=255) cTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCatgat < 8:97031/149‑1 (MQ=255) cTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCatgat < 5:156479/149‑1 (MQ=255) cAACGACGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCTATACAGCTCGACACTGCCGTCACAATTCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGatat < 7:12505/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATg > 2:33787/1‑149 (MQ=255) gccgccACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGccc < 2:46673/149‑1 (MQ=255) gccgccACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGccc > 8:296299/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGca > 7:349362/1‑148 (MQ=255) cACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGcaca > 7:284809/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCAcaccac > 8:305381/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGaaaa < 2:177418/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGaaaa < 6:240324/148‑1 (MQ=255) gCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGTGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACACCGTGAAAAc > 8:197004/1‑148 (MQ=255) aTACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGTATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCggg < 7:296299/149‑1 (MQ=255) aGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCa > 4:319580/1‑149 (MQ=255) tCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcac < 6:274781/79‑1 (MQ=255) tCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcac > 5:274781/1‑79 (MQ=255) cTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGc < 8:284809/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGCCCAATGCTAGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGc < 7:161615/149‑1 (MQ=255) tGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAAc > 7:11515/1‑126 (MQ=255) tGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAAc < 8:11515/126‑1 (MQ=255) gCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCaa > 1:148127/1‑149 (MQ=255) tCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCg < 3:239895/114‑1 (MQ=255) tCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCg > 4:239895/1‑114 (MQ=255) ccAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGt > 4:36554/1‑149 (MQ=255) ccAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGGAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGt > 1:283155/1‑149 (MQ=255) cAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCatgatg > 4:308870/1‑89 (MQ=255) cAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCatgatg < 3:308870/89‑1 (MQ=255) cAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGtt < 2:283155/149‑1 (MQ=255) gCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTtctc > 3:139015/1‑148 (MQ=255) tCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATgg > 7:337805/1‑132 (MQ=255) tCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATgg < 8:337805/132‑1 (MQ=255) cGATCAGGGCGGTGGAGGATTCCTGCCAGTCGCATAAATTGATGTAGTCCTGCTCAGCGACCTTGCGGATCTCGGCATGTTTGAAATGCGAGTACACCTCGCCGTGAAATCCTCGGAGGGTGCACTCATGGGCAATGTGGTTCTCGaa < 4:328382/148‑1 (MQ=255) gATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAg < 3:36554/148‑1 (MQ=255) cAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGc < 8:288609/149‑1 (MQ=255) gggCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcacccacc > 8:175386/1‑56 (MQ=255) gggCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTcacccacc < 7:175386/56‑1 (MQ=255) ggCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCtga < 1:33787/149‑1 (MQ=255) cggTGCACTACTCCACCATGTCCGCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCGCTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCtgat < 6:259825/146‑1 (MQ=255) ccGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCGCTCATGGCCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCtgat > 5:259825/1‑148 (MQ=255) ccGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCtgatg < 4:139015/149‑1 (MQ=255) cccgccTCCCCCCAGTCCCCGCCATTGAGGTAGGCCACCTCACCCACCTTGCGGAGCTCGGCATGAGGGATATGCCCGCCCACCACCCCGTGACCCCCCCGGCGGGGGCACGCCTGGGCCATGGCGGTCTCGCAGTCGCTGATGACGtg > 5:328915/6‑148 (MQ=255) cACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGtt > 5:334379/1‑149 (MQ=255) tCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCAcggcgg < 4:193818/99‑1 (MQ=255) tCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCAcggcgg > 3:193818/1‑99 (MQ=255) tCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATg < 7:189690/117‑1 (MQ=255) tCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATg > 8:189690/1‑117 (MQ=255) cAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCttt < 1:227169/149‑1 (MQ=255) ccccGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCAcc > 7:345970/1‑149 (MQ=255) ccGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCtt < 6:334379/149‑1 (MQ=255) ccGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCtt > 5:147441/1‑149 (MQ=255) ccGCAAGTGCGGTCGTCCACCTCACCGACCTTGCGGAGCTCGGCAGGAGGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAACACCCCGGCGGGTGCACTCCTGGGCAATGGCGTGCTCGAAGTCGCTGCTGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCtt < 6:328915/149‑1 (MQ=255) cGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTtg > 6:75623/1‑149 (MQ=255) cGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTtg > 2:66794/1‑149 (MQ=255) gCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACACCGTGAAAACCACGTCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTtgt < 7:197004/149‑1 (MQ=255) ggtGAGGTGGACTACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACcg > 7:5287/3‑131 (MQ=255) ggtGAGGTGGACTACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACcg < 8:5287/129‑1 (MQ=255) gAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCttt > 6:258076/1‑135 (MQ=255) gAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCttt < 5:258076/135‑1 (MQ=255) aGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGa < 1:66794/148‑1 (MQ=255) aGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGa < 8:345970/148‑1 (MQ=255) aGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAg > 4:364471/1‑149 (MQ=255) aGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAg < 3:319580/149‑1 (MQ=255) gTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAGGt < 7:305381/149‑1 (MQ=255) gTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAGGTAc < 6:147441/148‑1 (MQ=255) tCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAGGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAGGTACGc > 2:220439/1‑149 (MQ=255) | CGGCCCCCTGCCCTCGAGCCTTAAGCCGGCTCGCGCAACGCCGCCACGGCCTGCGCTTCGGCCAGCCGATACAGCTCGACACTGCCGTCCCAATGCTCGATCAGGGCCGTGCACGACTCCACCCAGTCCCCGCAATTGAGGTAGTCCACCTCACCCACCTTGCGGATCTCGGCATGATGGATATGCCCGCACACCACCCCGTGAAAACCACGGCGGGTGCACTCATGGGCAATGGCGTTCTCGAAGTCGCTGATGAAGTTCACCGCGCCTTTCACCTTGTGCTTGAGGTACGC > NC_002947/5123314‑5123606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |