Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,182,059 | G→T | 26.0% | intergenic (‑117/+37) | PP_4560 ← / ← csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,182,059 | 0 | G | T | 26.0% | 104.7 / 42.1 | 65 | intergenic (‑117/+37) | PP_4560/csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/19); new base T (8/9); total (37/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.55e-01 |
GGCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCC > NC_002947/5181914‑5182206 | ggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCgg > 5:245282/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCggg > 2:275094/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGt > 6:175698/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCgg < 8:190516/146‑1 (MQ=255) aaGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCgg > 7:190516/1‑146 (MQ=255) cgcgCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCAcc < 5:301302/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCAccc > 3:315089/1‑148 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaa < 6:304728/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaa < 6:245282/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaag < 3:181697/149‑1 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGc > 1:169198/1‑149 (MQ=255) ggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGGCGCTTGAGCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTTTGTGAAGAATTTGCTTACGATTAAGTGCGG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGcc < 1:106962/149‑1 (MQ=255) ggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaa > 4:73632/1‑143 (MQ=255) ggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaa < 3:73632/143‑1 (MQ=255) ggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGcc < 2:222705/149‑1 (MQ=255) aTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAagag < 2:8180/141‑1 (MQ=255) aTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAagag > 1:8180/1‑141 (MQ=255) ccTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaaga < 3:200042/128‑1 (MQ=255) ccTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGcgaaga > 4:200042/1‑128 (MQ=255) cGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGc > 6:178766/1‑148 (MQ=255) acaGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCtt > 3:242489/1‑148 (MQ=255) acaGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTc < 1:275094/149‑1 (MQ=255) caGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca < 4:315089/149‑1 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca > 4:363644/1‑148 (MQ=255) cAAGTCTAATCGACCGGCCCCGAGCTGTGCTGCCCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTCCTAACTAATACGGGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑GCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACAtt < 7:24582/149‑1 (MQ=255) aaGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCg > 7:94396/1‑94 (MQ=255) aaGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCg < 8:94396/94‑1 (MQ=255) tAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAc > 4:114557/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCGGCGCCTCATCGCGGGT‑TGACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTGAAGTCAAGGCTTCTTAACCGCATACTTGACATTTACCATGAcc > 1:105775/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCC‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATATCCCTTGACct > 1:218421/1‑149 (MQ=255) aCCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACctg > 7:78640/1‑149 (MQ=255) gTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCTAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACctgctg < 5:178766/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttc > 6:322222/1‑110 (MQ=255) ccGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttc < 5:322222/110‑1 (MQ=255) cGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGcgcct > 1:286360/1‑149 (MQ=255) tgctgcTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt > 1:324926/1‑149 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGa < 3:114557/149‑1 (MQ=255) cccGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTcc > 3:369280/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCt > 7:143632/1‑149 (MQ=255) tGGTTTAAGATTTTGCTTACGAATATGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcctt < 8:78640/149‑1 (MQ=255) gaagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCGCCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCGTCCCATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt > 3:29022/1‑149 (MQ=255) gaagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGa > 2:240247/1‑110 (MQ=255) gaagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt > 4:309440/1‑149 (MQ=255) caataaTTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGa < 1:240247/106‑1 (MQ=255) aagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTc > 1:344377/1‑149 (MQ=255) gaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCgg > 3:349356/1‑149 (MQ=255) ttttGCTTAGGAATAAGTGCGG‑GCCTCTTCGCGGTT‑TCACCCGATATGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGc < 2:324926/147‑1 (MQ=255) aCGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCt < 4:242489/148‑1 (MQ=255) gAATACGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCACCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCgg < 2:193113/137‑1 (MQ=255) gAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGTGTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCACCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCgg > 1:193113/1‑138 (MQ=255) atcaGTGCCG‑GCCGCTTCGCGGGG‑TCACCCGATATGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 4:29022/145‑1 (MQ=255) tGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt < 2:286360/148‑1 (MQ=255) gCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg < 3:309440/149‑1 (MQ=255) ccG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTccg > 5:325316/1‑147 (MQ=255) gCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg > 8:165028/1‑145 (MQ=255) gCCTCTTCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg < 7:165028/145‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCa > 7:39564/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCCCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCACCTTTTCGTTGACGGTc > 2:78026/1‑148 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCAc > 6:219327/1‑149 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGT‑CCACCCGATAATAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCAc < 2:344377/149‑1 (MQ=255) ctctTCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCAcc > 5:187200/1‑149 (MQ=255) ctctTCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGAACCTTTTCGTTGTAGGTCAcc > 5:37711/1‑149 (MQ=255) ctTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCtt > 7:14262/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 7:146037/133‑1 (MQ=255) ttCTCGGGT‑GAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc > 8:146037/1‑133 (MQ=255) cgcgGGT‑TCACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGcc < 4:349356/149‑1 (MQ=255) | GGCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCG‑GCCTCTTCGCGGGT‑TCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCC > NC_002947/5181914‑5182206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |