| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,267,497 | T→A | 5.4% | L28Q (CTG→CAG) | PP_4643 → | xanthine/uracil permease family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,267,497 | 0 | T | A | 5.4% | 221.2 / 2.5 | 74 | L28Q (CTG→CAG) | PP_4643 | xanthine/uracil permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/30); new base A (2/2); total (42/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.06e-01 | |||||||||||
TTGTGGCAATCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGAC > NC_002947/5267350‑5267638 | ttGTGGCAATCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGCAGGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCt > 1:60725/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGTCTACAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCAt < 8:59111/148‑1 (MQ=255) cctgtgtCTACAGTATC‑GTCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCAtag < 1:264873/146‑3 (MQ=255) tCTACAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTAtggtg < 5:362356/149‑1 (MQ=255) aCAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCAt < 1:245639/138‑1 (MQ=255) aCAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCAt > 2:245639/1‑138 (MQ=255) aCAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCAta > 4:169909/1‑138 (MQ=255) aCAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCAta < 3:169909/139‑2 (MQ=255) cAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGa < 7:21292/148‑1 (MQ=255) cAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAt > 5:378973/1‑149 (MQ=255) aGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAtc < 6:378973/149‑1 (MQ=255) gCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAg > 7:231693/1‑149 (MQ=255) aacaaTAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAc‑c > 5:276266/1‑149 (MQ=255) tAACCAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCAGGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGAGCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGa < 3:232551/149‑1 (MQ=255) tAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGa > 6:265716/1‑149 (MQ=255) aCAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATcc > 7:151470/1‑149 (MQ=255) aCAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATcc > 7:50677/1‑149 (MQ=255) agagagCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTg < 6:276266/149‑1 (MQ=255) agagagCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTg > 7:134864/1‑149 (MQ=255) agagCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTggg < 6:321749/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGAGCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTgggg > 1:259770/1‑147 (MQ=255) ccTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAg > 4:183033/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAg > 3:17707/1‑149 (MQ=255) gCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGcc > 5:130120/1‑149 (MQ=255) tCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAAGCCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCcg > 1:97216/1‑149 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCAt > 2:234546/1‑102 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCAt < 1:234546/102‑1 (MQ=255) cATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCgg > 2:39407/1‑149 (MQ=255) aTGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCggg > 8:285644/1‑149 (MQ=255) aTGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATCGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGcccgcgg > 7:143977/1‑144 (MQ=255) tGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGc > 7:273853/1‑149 (MQ=255) aCGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAtcgtcg > 7:40132/1‑112 (MQ=255) aCGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGAtcgtcg < 8:40132/112‑1 (MQ=255) cGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTCAGGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGaa > 1:81931/1‑149 (MQ=255) cccTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCCGCGGCCTgccccag < 8:143977/148‑7 (MQ=255) ccTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGc > 8:268731/1‑149 (MQ=255) cACGTCTCCCGCCAAGCGTCCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGt < 7:275324/86‑1 (MQ=255) cACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGt > 8:275324/1‑86 (MQ=255) cACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGaaa < 7:68110/149‑1 (MQ=255) cACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGaaa > 8:68110/1‑149 (MQ=255) cACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGaaa < 3:369161/149‑1 (MQ=255) cACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGaaa > 4:369161/1‑149 (MQ=255) ccGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCCTG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTgg > 7:242376/1‑111 (MQ=255) ccGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTgg < 8:242376/111‑1 (MQ=255) ccGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATg < 7:295571/149‑1 (MQ=255) cGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGc < 2:60725/149‑1 (MQ=255) cGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGc < 8:151470/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCt < 2:81931/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCt < 7:268731/149‑1 (MQ=255) gCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATcg > 3:177188/1‑149 (MQ=255) gCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATcg > 1:2293/1‑149 (MQ=255) gACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATcgcc < 4:17707/149‑1 (MQ=255) ccGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCgccgcc > 1:297785/1‑149 (MQ=255) gATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCt > 7:105595/1‑149 (MQ=255) aaaa‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTc < 8:231693/149‑1 (MQ=255) aaa‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGACTCGCAGTTCg > 8:214105/1‑149 (MQ=255) ccTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCg < 2:2293/149‑1 (MQ=255) cTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCgg < 6:130120/149‑1 (MQ=255) cTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCgg > 5:372427/1‑149 (MQ=255) tC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGt > 1:337929/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGt < 7:285644/147‑1 (MQ=255) ggCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTg < 3:183033/148‑1 (MQ=255) gCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGGTCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGc > 4:102356/1‑149 (MQ=255) ggTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCtt < 4:177188/147‑1 (MQ=255) ggTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGc > 6:8129/1‑149 (MQ=255) ggTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCATGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGc > 4:105713/1‑149 (MQ=255) gTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGcc > 4:29660/1‑149 (MQ=255) gCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCAc > 4:5500/1‑149 (MQ=255) ccAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCAcc < 8:50677/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTAGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCAAGGCCAccgg < 2:40333/149‑3 (MQ=255) tGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTACGCCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCctgct > 1:96813/1‑149 (MQ=255) gCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCctgctg < 2:259770/147‑1 (MQ=255) tacaTGGTCAGCA‑CATGCTGCAGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAg > 3:115414/4‑149 (MQ=255) cTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGa > 3:319458/1‑149 (MQ=255) tATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTACCACCCTGCTGCAGAc > 1:168113/1‑149 (MQ=255) | TTGTGGCAATCATTTGTAGGAAGTGTCTACAGTAGC‑GGCACAACAATAAACAGAGAGCCTGCTCCATGACTACGTCCCCTAGCACGTCTCCCGCCAAGCGACCCGAGGATGAAAA‑CCTC‑GGCCTTGGTGCCAACCTGGCCTATGGTCTGCAGCATG‑TGCTGACCATGTATGGTGGGATCGTCGCAGTAC‑CCCTGATCCTGGGGCAGGCCGCGGGCCTGAATGGTGCCGAAATCGGCATGCTGATCGCCGCCTCGCTGTTCGCCGGTGGCCTTGCCACCCTGCTGCAGAC > NC_002947/5267350‑5267638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |