| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,574,182 | A→T | 5.3% | intergenic (+234/+71) | rsgA → / ← motB | ribosome biogenesis GTPase RsgA/flagellar motor rotation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,574,182 | 0 | A | T | 5.3% | 239.4 / 2.2 | 75 | intergenic (+234/+71) | rsgA/motB | ribosome biogenesis GTPase RsgA/flagellar motor rotation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/36); new base T (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
GGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTT > NC_002947/5574036‑5574329 | ggAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAAc > 6:142372/1‑149 (MQ=255) gAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAAc < 5:75564/148‑1 (MQ=255) cagcagGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 3:111073/1‑148 (MQ=255) gcagGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 3:277113/149‑1 (MQ=255) cagGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGt < 4:111073/149‑1 (MQ=255) cagGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGt < 1:79180/149‑1 (MQ=255) ccGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 4:130109/1‑143 (MQ=255) ccGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 3:130109/143‑1 (MQ=255) ccGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATcg > 2:293058/1‑149 (MQ=255) ggCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa < 1:52617/136‑4 (MQ=255) ggCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa < 1:58009/136‑4 (MQ=255) ggCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa > 2:58009/1‑133 (MQ=255) ggCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa > 2:52617/1‑133 (MQ=255) tttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 5:234323/135‑1 (MQ=255) tttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 6:234323/1‑135 (MQ=255) tttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGc > 7:99796/1‑149 (MQ=255) gggTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAg > 2:54373/1‑149 (MQ=255) tGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAggtg > 6:107368/1‑149 (MQ=255) gAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAggtgg < 1:340564/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAggtggt < 3:74604/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAggtggt < 2:261940/148‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTggtggg < 8:99796/149‑1 (MQ=255) gCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTaaa > 3:186143/1‑107 (MQ=255) gCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTaaa < 4:186143/107‑1 (MQ=255) cTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGgtgggtgg > 6:143235/1‑149 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAg > 5:268699/1‑135 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAg < 6:268699/135‑1 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGca < 5:143235/148‑1 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGca > 7:84847/1‑148 (MQ=255) cTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGca > 8:85541/1‑148 (MQ=255) tACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAgg > 2:350583/1‑135 (MQ=255) tACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAgg < 1:350583/135‑1 (MQ=255) tACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGca > 2:251710/1‑147 (MQ=255) cgacgGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGcac < 8:185723/146‑1 (MQ=255) cgacgGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGcac > 7:185723/1‑146 (MQ=255) gacgGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGtt > 6:152936/1‑149 (MQ=255) gacgGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGAGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGtt < 5:107368/149‑1 (MQ=255) cgGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGc < 1:293058/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCAc < 1:251710/149‑1 (MQ=255) gcCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCAcccc > 6:31769/1‑148 (MQ=255) cccAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCAccccc > 6:145270/1‑148 (MQ=255) ccAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGc > 5:185739/1‑113 (MQ=255) ccAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGc < 6:185739/113‑1 (MQ=255) gccGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAg < 2:252140/112‑1 (MQ=255) tGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTc < 5:31769/148‑1 (MQ=255) gTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCt > 5:226033/1‑149 (MQ=255) tAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCtt > 7:349799/1‑149 (MQ=255) gCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTgg > 6:237514/1‑149 (MQ=255) cGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGc < 5:142372/149‑1 (MQ=255) ggCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCt < 6:226033/149‑1 (MQ=255) cTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCtt > 8:10585/1‑148 (MQ=255) tAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGCACCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTc < 1:54373/147‑1 (MQ=255) tAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTcat < 8:84847/148‑1 (MQ=255) tAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTca < 7:10585/147‑1 (MQ=255) aGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTcatc < 8:349799/148‑1 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTcatccat > 8:137851/1‑149 (MQ=255) cgcgAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTcatccatc < 7:85541/149‑1 (MQ=255) cgAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCtt < 5:152936/149‑1 (MQ=255) gcacCGGCGTTGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCtt > 3:252748/2‑146 (MQ=255) 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5:291374/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCtt < 5:37983/149‑1 (MQ=255) gTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCaaa < 5:237514/149‑1 (MQ=255) tGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAg < 4:50013/149‑1 (MQ=255) aTTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGt > 8:108811/1‑149 (MQ=255) ttCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGtt < 7:137851/149‑1 (MQ=255) cgcTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTACTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTc > 4:21640/1‑149 (MQ=255) ggAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAg > 5:158909/1‑133 (MQ=255) ggAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAg < 6:158909/133‑1 (MQ=255) aGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGgcg > 5:254947/1‑148 (MQ=255) ggCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGA‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTAAGCTTCTGgcg > 1:68426/1‑147 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTc < 3:21640/149‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGTGCAGCTCGCGCGGt > 1:226636/1‑149 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGtt < 6:254947/148‑1 (MQ=255) | GGAAATTGGCCAGCAGGTCCGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAATCACCGATGCGTATGTAGCGGCTTTAGCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATTCACCGCGCTGGAGGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGTGATCGCGCCAGCGTTCAGGTGGTGGGTGGCACAGTTGC‑CCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTT > NC_002947/5574036‑5574329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |