Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 491,089 | G→A | 6.2% | N444N (AAC→AAT) ‡ | lptD ← | LPS‑assembly protein LptD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 491,089 | 0 | G | A | 6.2% | 243.2 / 3.7 | 80 | N444N (AAC→AAT) ‡ | lptD | LPS‑assembly protein LptD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/40); new base A (3/2); total (38/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCTGGAACGGCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATCCAGCGCTGAT > NC_002947/490947‑491237 | gCTGGAACGGCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTcag > 2:186066/1‑148 (MQ=255) tGGAACGGCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTcagcag > 1:109575/1‑149 (MQ=255) aaCGGCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGAACCAGCAgggt < 5:50024/149‑3 (MQ=255) aCGGCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGTCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGAACCAGCAgggt < 8:104562/148‑3 (MQ=255) gCAGCGTACCGTTCTGGGTATGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCgg < 7:149174/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCgg < 3:315044/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCgg < 2:106574/149‑1 (MQ=255) gTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTc < 7:186896/149‑1 (MQ=255) gTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTc > 6:44844/1‑149 (MQ=255) tACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTcc < 1:2292/149‑1 (MQ=255) aCCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCa > 3:34186/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCTTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGc > 2:294468/1‑149 (MQ=255) gggTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATc < 2:185150/149‑1 (MQ=255) gTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTg < 5:13368/149‑1 (MQ=255) gTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCAACCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTg > 6:22207/1‑149 (MQ=255) aGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTc < 3:267015/149‑1 (MQ=255) gCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCg > 4:260106/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCg > 1:149704/1‑148 (MQ=255) cTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCg > 1:145223/1‑148 (MQ=255) tGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTc > 7:41905/1‑146 (MQ=255) tGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTc < 8:41905/146‑1 (MQ=255) gCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACAATCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGa > 3:38425/1‑148 (MQ=255) cAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCGATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCa < 7:81561/149‑1 (MQ=255) aGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAg < 2:335968/149‑1 (MQ=255) aGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAg > 5:139395/1‑149 (MQ=255) gATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTcc > 6:368209/1‑149 (MQ=255) gATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTcc > 7:39381/1‑149 (MQ=255) aTCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCt < 6:272018/149‑1 (MQ=255) tACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGaa < 4:34186/149‑1 (MQ=255) ggCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATc < 3:309563/123‑1 (MQ=255) ggCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATc > 4:309563/1‑123 (MQ=255) gCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAg < 3:85124/149‑1 (MQ=255) tGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAAc < 5:44844/149‑1 (MQ=255) tGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAAc < 6:116175/149‑1 (MQ=255) aTCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACg < 3:260106/148‑1 (MQ=255) cTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACggg < 8:39381/148‑1 (MQ=255) gCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCg > 8:183864/1‑149 (MQ=255) cGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACggg < 6:139395/145‑1 (MQ=255) ttctgtggCCATCTAGTAGTCATGCACATTCTACGGCGCTGTGTAGCTGTCGCCTCGGTTGGTCTACGCAGCCTTATGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTACACGCCAATCTGGTCGGATTGCTGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGa < 8:151341/142‑1 (MQ=255) gaTGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGa > 1:216731/1‑149 (MQ=255) gaTGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGa > 3:197913/1‑149 (MQ=255) gTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGt < 7:183864/148‑1 (MQ=255) tCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGAtaga > 7:151341/1‑145 (MQ=255) ccATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGgtg < 2:149704/149‑1 (MQ=255) cATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGTAGGTCGCGGCTTTc < 8:34178/90‑1 (MQ=255) gTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAg < 5:368209/145‑1 (MQ=255) aTGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGa > 4:285274/1‑128 (MQ=255) aTGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGa < 3:285274/128‑1 (MQ=255) aTGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCg > 2:361218/1‑133 (MQ=255) aTGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCg < 1:361218/133‑1 (MQ=255) aTTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGtcat > 5:240990/1‑147 (MQ=255) cgcgcgGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCAACAGGCGtt > 2:95552/1‑148 (MQ=255) gcgcgGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAg > 3:256389/1‑142 (MQ=255) gcgcgGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAg < 4:256389/142‑1 (MQ=255) ggTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCa < 6:240990/149‑1 (MQ=255) gtgtAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAg < 5:22207/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCAc < 4:38425/149‑1 (MQ=255) gCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTtgt > 8:11884/1‑149 (MQ=255) cTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTTATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGtgc < 1:283570/149‑1 (MQ=255) cTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGtgc < 4:197913/149‑1 (MQ=255) gTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGTCACCCTTGtgctgc > 3:345261/1‑148 (MQ=255) gTCAACGCACCTTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGtt < 1:294468/149‑1 (MQ=255) gTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATGTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCAtgc < 5:194911/126‑3 (MQ=255) gTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATcc > 6:194911/1‑126 (MQ=255) gTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTtgtg < 6:13937/140‑1 (MQ=255) gTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTtgtg > 5:13937/1‑140 (MQ=255) gTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGtt > 8:127026/1‑149 (MQ=255) gTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGtt > 6:109087/1‑149 (MQ=255) aaCGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGTCACCCTTGTGCTGCCAGTTGa < 4:345261/148‑1 (MQ=255) aaCGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGa < 7:127026/148‑1 (MQ=255) ccgcgaccTGCTGAACCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGAc > 7:110593/7‑148 (MQ=255) ccgcgaccTGCTGAACCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGAc > 7:105349/7‑148 (MQ=255) aCGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAg < 7:133722/124‑1 (MQ=255) aCGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAg > 8:133722/1‑124 (MQ=255) aCCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATcc < 2:216731/149‑1 (MQ=255) accTGCTGAACCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCAACAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATc > 7:46893/2‑147 (MQ=255) ccTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGGCCATCCAg > 5:305784/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATCCAg > 1:24379/1‑149 (MQ=255) tgctgGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATCCAgcg > 6:11364/1‑149 (MQ=255) gctgGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATCCAgcgc > 1:196425/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCGACGCCAATCTGTTCTGATTCCAGGTCCTGTAAGTAGAACGTGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCt < 8:191853/89‑1 (MQ=255) gTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATCCAGCGCTGAt > 7:23562/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCAGGTCGAGGCTTTCCACGACAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCt > 7:191853/1‑89 (MQ=255) | GCTGGAACGGCAGCGTACCGTTCAGGGTCAGCTGCGGCAGGCGATCATACGGCGTGATCTGCGAGATGGTCGCCATCTCGTAGGCATGCACATTCAACCGCGCGGTGTAGCTGTCGCCTCGGTAGGTCAACGCACCCTGCTGGTTCAGCAGGTCGCGGCTTTCCACGCCAATCTGGTCGGATTCCAGGTCCTGGAAGTAGAACGGGTCGCTGATGTCGGTGTAGTCCACCTCGGTCATCAGGCGTTCATCCAGGCCACCCTTGTGCTGCCAGTTGACCATCCAGCGCTGAT > NC_002947/490947‑491237 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |