Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,959,835 | G→A | 6.8% | A33V (GCC→GTC) | rnk ← | nucleotide diphosphokinase regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,959,835 | 0 | G | A | 6.8% | 303.7 / 7.7 | 102 | A33V (GCC→GTC) | rnk | nucleotide diphosphokinase regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/45); new base A (3/4); total (53/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-02 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GGCATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGCAAATAAAGC > NC_002947/5959687‑5959982 | ggcATCCTTGGGGTACACCAGTATCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAggg < 2:224073/149‑1 (MQ=255) aTCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGa < 3:209057/149‑1 (MQ=255) cTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGc < 3:153053/148‑1 (MQ=255) cTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGct > 1:200244/1‑148 (MQ=255) cTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGct < 1:221645/149‑2 (MQ=255) cTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGct < 4:163753/149‑2 (MQ=255) tGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGcaca > 5:311272/1‑149 (MQ=255) ggggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGctt < 2:200244/147‑3 (MQ=255) ggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGca > 6:369856/1‑144 (MQ=255) ggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGca < 5:369856/144‑1 (MQ=255) acacCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGc > 8:108950/1‑149 (MQ=255) cacCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGc < 5:57104/148‑1 (MQ=255) acCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGct > 4:262085/1‑147 (MQ=255) acCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCg > 7:71280/1‑148 (MQ=255) cAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTAc > 8:45909/1‑149 (MQ=255) tCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCTAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACtctc < 5:81180/148‑1 (MQ=255) tCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCtcg > 6:135763/1‑149 (MQ=255) cAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCtcgt > 3:249652/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCtcgtc < 6:311272/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCtcgtc < 7:346231/149‑1 (MQ=255) gtAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAgg < 5:135763/148‑1 (MQ=255) gTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGt < 4:249652/149‑1 (MQ=255) tCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTc < 7:77476/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGa > 5:78157/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGAt < 6:78157/147‑1 (MQ=255) gCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGc < 4:144950/117‑1 (MQ=255) ttCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGAc < 6:306825/143‑1 (MQ=255) ttCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGAc > 5:306825/1‑143 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAGCCGGCGTACTCTCGTCGAg < 5:4081/125‑1 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAg < 5:9376/125‑1 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACg > 6:319876/1‑149 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACg > 2:138109/1‑149 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAACCGGCGTACTCTCGTCGAg > 6:4081/1‑125 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAACCGGCGTACTCTCGTCGAg > 6:9376/1‑125 (MQ=255) aCGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGc < 3:101730/148‑1 (MQ=255) aCGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCt > 3:228071/1‑149 (MQ=255) ggCAGTGGACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑t < 4:336375/149‑1 (MQ=255) ccGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TAc > 8:6306/1‑141 (MQ=255) ccGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TAc < 7:6306/141‑1 (MQ=255) gTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGt > 6:189540/1‑147 (MQ=255) 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ttCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGa > 1:111983/1‑149 (MQ=255) ccTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGa < 5:39209/147‑1 (MQ=255) ccTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGAATGTCGATCAAACGATCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATc > 1:118943/1‑149 (MQ=255) cTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATc < 1:16928/148‑1 (MQ=255) cTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCGCATGATc > 3:306387/1‑148 (MQ=255) 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ccTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCttt < 7:108950/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGaa > 5:147959/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGaa > 3:228320/1‑148 (MQ=255) ggCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACa < 5:189540/147‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAgg > 5:7144/1‑149 (MQ=255) gccgGTCACGCTCGTCCGGCAGGGCGAGCACCCCCGGCGTACTCCCGTCGAGGCTGGCGATCCGACGCTCCCGACGCGG‑TCCGCCCAATCGGGTGAGGATGAGGCAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGGCACACTCCTTTGAACAGGCa < 4:340980/147‑1 (MQ=255) cgcgGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCa < 5:65988/149‑1 (MQ=255) tCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGtttt < 6:286638/149‑1 (MQ=255) gtgtgCTCGCCCTGCAGGACGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGtttt > 4:118434/5‑149 (MQ=255) aaGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTc > 4:313897/1‑148 (MQ=255) cTCGCCCTGCAGGACGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAAtg > 6:76286/1‑149 (MQ=255) gTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGc < 1:354071/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGc < 5:20106/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGc > 1:296121/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTc < 5:120772/112‑1 (MQ=255) gCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTc < 7:128783/112‑1 (MQ=255) gCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTc > 6:120772/1‑112 (MQ=255) gCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTc > 8:128783/1‑112 (MQ=255) aGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGCCTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGCAAATa > 5:189874/1‑147 (MQ=255) aGGACGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGCAAATaaa < 5:76286/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGCAAATAAAGc < 6:72404/149‑1 (MQ=255) | GGCATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTG‑TACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGTGCAAATAAAGC > NC_002947/5959687‑5959982 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |