| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,037,111 | T→A | 7.0% | G73G (GGT→GGA) | argB → | acetylglutamate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,037,111 | 0 | T | A | 7.0% | 172.8 / 3.3 | 57 | G73G (GGT→GGA) | argB | acetylglutamate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/25); new base A (2/2); total (30/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.24e-01 | |||||||||||
GCTTTGTCGGCAAGACCCTGGTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGATCAACCGCCACGGCGGCAGC > NC_002947/6036963‑6037258 | gcTTTGTCGGCAAGACCCTGGTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGt < 2:253283/149‑1 (MQ=255) ttGTCGGCAAGACCCTGGTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGt > 3:17902/1‑146 (MQ=255) ttGTCGGCAAGACCCTGGTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGt < 4:17902/146‑1 (MQ=255) ggTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGAc > 8:86834/1‑133 (MQ=255) ggTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGAc < 7:86834/133‑1 (MQ=255) aaGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGtcgatcga < 2:304902/149‑1 (MQ=255) cggcggCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGc > 4:96287/1‑148 (MQ=255) ggcggcAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCa < 8:15789/149‑1 (MQ=255) aaCGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCAt > 1:79604/1‑149 (MQ=255) gATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACg < 3:269809/149‑1 (MQ=255) ggAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGAGACCTg < 5:215139/109‑1 (MQ=255) ggAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGAGACCTg > 6:220316/1‑109 (MQ=255) ggAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGAGACCTg > 6:215139/1‑109 (MQ=255) ggAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGAGACCTg < 5:220316/109‑1 (MQ=255) gagCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATgc > 4:189983/1‑149 (MQ=255) gagCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCAc < 6:379328/149‑1 (MQ=255) cTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGa > 8:334110/1‑149 (MQ=255) tCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGa > 4:199560/1‑148 (MQ=255) gACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCgg > 8:340201/1‑149 (MQ=255) gACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCgg > 3:187866/1‑149 (MQ=255) aCGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGc < 3:199560/149‑1 (MQ=255) gggCTTCGCCCGTGTCATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATgcgc < 7:100149/133‑1 (MQ=255) gggCTTCGCCCGTGTCATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATgcgc > 8:100149/1‑133 (MQ=255) gCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGAc > 1:257604/1‑148 (MQ=255) gCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGa < 4:187866/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGa < 3:96287/149‑1 (MQ=255) ccGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGt > 8:213086/1‑92 (MQ=255) ccGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGt < 7:213086/92‑1 (MQ=255) ccGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACg > 8:163670/1‑149 (MQ=255) tGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTtg < 7:340201/149‑1 (MQ=255) gACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTtgt > 4:209077/1‑149 (MQ=255) aTCGTGATGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGga > 6:47688/1‑149 (MQ=255) tCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTtgtgag > 3:65582/1‑146 (MQ=255) tCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTtgt < 4:65582/145‑1 (MQ=255) tCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGgag < 5:270783/149‑1 (MQ=255) atgaAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCt > 5:157131/1‑149 (MQ=255) tgaAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTg < 3:189983/149‑1 (MQ=255) aaGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTgg < 5:47688/148‑1 (MQ=255) tgtgGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGc > 3:301309/1‑140 (MQ=255) tgtgGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGc < 4:301309/140‑1 (MQ=255) ggCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAgg < 7:163670/148‑1 (MQ=255) gCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCgg > 6:110646/1‑108 (MQ=255) gCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGt > 1:2891/1‑148 (MQ=255) gCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGt > 5:255086/1‑148 (MQ=255) aCCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAg > 8:82308/1‑149 (MQ=255) cccGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAgg < 7:334110/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGa < 3:209077/149‑1 (MQ=255) gtggtAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACAt > 2:114445/1‑149 (MQ=255) gtAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCg < 6:157131/148‑1 (MQ=255) tCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAAc < 2:79604/149‑1 (MQ=255) tCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAAc > 5:105848/1‑149 (MQ=255) tCCACGGTGGTGGACCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCAAGGTCAACAAGGACATCGTCAAc > 5:3860/1‑149 (MQ=255) cACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCt > 7:161593/1‑149 (MQ=255) cACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCt > 4:301476/1‑149 (MQ=255) cACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCt > 8:233670/1‑149 (MQ=255) ggtggtGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGAt < 6:105848/149‑1 (MQ=255) gtggtgGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGATc < 3:301476/149‑1 (MQ=255) ggTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGATCa > 2:151128/1‑133 (MQ=255) ggTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGATCa < 1:151128/133‑1 (MQ=255) gTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGATCAACCGCCACGGCGGCAgc < 7:82308/149‑1 (MQ=255) | GCTTTGTCGGCAAGACCCTGGTGATCAAGTACGGCGGCAACGCGATGGAGAGCGAGGAGCTCAAGACGGGCTTCGCCCGTGACATCGTGCTGATGAAGGCTGTGGGCATCAACCCGGTGGTAGTCCACGGTGGTGGCCCGCAGATCGGTGACCTGCTCAAGCGCCTGTCGATCGAAAGCCACTTCATCGACGGCATGCGCGTCACCGATTCGGCGACCATGGACGTTGTGGAGATGGTGCTGGGCGGCCAGGTCAACAAGGACATCGTCAACCTGATCAACCGCCACGGCGGCAGC > NC_002947/6036963‑6037258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |