| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,054,757 | 0 | C | T | 9.9% | 223.2 / 11.5 | 81 | I45I (ATC→ATT) ‡ | exbD | TonB‑gated outer membrane transporter gating inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/33); new base T (4/4); total (44/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.14e-01 | |||||||||||
AAGTGGGGTAAGCCATGGGCCTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACATCAAGGTCGACCTGCCGGCCTCAACCGCCAAACCGGCGCCAAGGCCGGAGAAACCGGTGTTCGTCAGCGTCAAGGCCGACCAGAAGCTGTATGTCGGCGACGATCAGGTTGCTGCACCCGACCAGCTTGGCCCGATGCTCGACGCCAA > NC_002947/6054609‑6054903 | aaGTGGGGTAAGCCATGGGCCTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACATc < 5:66231/149‑1 (MQ=255) tGGGGTAAGCCATGGGCCTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAATACCTCGAAATCAACGTTACGCCTGTCATCGACGTGTGGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCG‑TTGGCTA‑CGGTCGACATCAAg < 2:143450/149‑1 (MQ=255) gggTAAGCCATGGGCCTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACATCAAgg < 3:299868/148‑1 (MQ=255) 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gCCTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACATCAAGGTCGACCTGCCGGcc > 5:91342/1‑149 (MQ=255) ccTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTACCGGTCGACATCAAGGTCGACCTGCCGGcc < 1:210080/149‑1 (MQ=255) ccTGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACATCAAGGTCGACCTGCCGGCCt < 7:305388/149‑1 (MQ=255) tGCATCTCAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACATCAAGGTCGACCTGCCGGCCTc > 2:84275/1‑148 (MQ=255) tcAACGAAGGTGGCGACGACCTCGCCGAAAACCACGAAATCAACGTTACGCCGTTCATCGACGTGATGCTGGTGCTGCTGATCATCTTCATGGTCGCCGCTCCC‑TTGGCTA‑CGGTCGACCTTGATGTCGAccgta > 8:154238/1‑132 (MQ=39) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |