| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 600,244 | T→G | 7.3% | V24G (GTC→GGC) | nrdR → | DNA‑binding transcriptional repressor NrdR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 600,244 | 0 | T | G | 7.3% | 210.0 / 6.1 | 68 | V24G (GTC→GGC) | nrdR | DNA‑binding transcriptional repressor NrdR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/31); new base G (3/2); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 | |||||||||||
ACGGGCATATTTCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACGAAGAAAAGCTGC > NC_002947/600096‑600387 | aCGGGCATATTTCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCtcgt < 2:268713/149‑1 (MQ=255) ggCATATTTCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGc > 3:350359/1‑149 (MQ=255) gCATATTTCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCtcgtcgac > 8:243555/1‑147 (MQ=255) tttCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAgg < 6:137677/148‑1 (MQ=255) tCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAgg > 5:296727/1‑146 (MQ=255) tCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAgg < 6:296727/146‑1 (MQ=255) tCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGc < 3:280216/148‑1 (MQ=255) cATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATTGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCGCCCTCGGCGACGAggcgaga < 6:367009/149‑6 (MQ=255) cATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCGCCCTCGGCGACGAggcga < 1:294089/147‑4 (MQ=255) cATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCGCCCTCGGCGACGAggcga > 2:294089/1‑144 (MQ=255) cATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGc < 5:47068/149‑1 (MQ=255) tGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAg < 2:1926/149‑1 (MQ=255) gTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAg > 2:9520/1‑141 (MQ=255) gTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAg < 1:9520/141‑1 (MQ=255) tAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGcgcc > 3:217885/1‑149 (MQ=255) ccccTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGcgccgcc > 1:213749/1‑149 (MQ=255) tGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGt < 4:217885/148‑1 (MQ=255) cTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCGTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAAt > 5:222425/1‑149 (MQ=255) ttGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATg > 7:142499/1‑149 (MQ=255) cTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑g > 6:366114/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑gg > 5:49459/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑gg > 5:34864/1‑149 (MQ=255) gCCATTGAAATGCTCTACCATGGCCCTCACTTTTTTTTTTGCCTGCCACAATTCACTTTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTAAT‑CGAATCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGTTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑g < 6:324284/146‑1 (MQ=255) gCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGc < 7:152235/148‑1 (MQ=255) ccAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCt < 4:350359/149‑1 (MQ=255) tGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTgcgg > 7:86053/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCATCCGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTgc < 1:48975/119‑1 (MQ=255) aaTGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGa < 3:191662/149‑1 (MQ=255) aaTGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTAAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTgc > 2:48975/1‑118 (MQ=255) tGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAgc < 2:2831/149‑1 (MQ=255) gcgcTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGAGT‑GGCCTGCGGCGAgcg > 8:160056/1‑149 (MQ=255) cATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTcacc < 8:86053/149‑1 (MQ=255) cATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTcac > 3:214300/1‑148 (MQ=255) ccctccctTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCtt > 8:74286/1‑149 (MQ=255) tccctTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCg > 1:183616/1‑148 (MQ=255) tttttttGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAAcc > 3:220267/1‑149 (MQ=255) tttttttGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCACCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAAcc > 1:330626/1‑149 (MQ=255) gttgCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAg < 5:366114/148‑1 (MQ=255) gcctgccACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTg < 6:49459/148‑1 (MQ=255) gcctgccACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTg < 2:183616/148‑1 (MQ=255) ctgccACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACAAAGGTCAT‑CGACTATCG‑CCTCGTCGCCGACGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCCTGAATGCCT‑GGCCTGCGCCCAGCCCTTCACCACCATCCAAACCGCCgcgcagctg > 1:96574/1‑144 (MQ=255) ccagcaTGCACTGTCCCTTTTTCGGTGGCAACGTCACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTTCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGtgctg < 8:142499/149‑1 (MQ=255) ccaccaTGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGtgc < 7:74286/147‑1 (MQ=255) cACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCt > 6:356222/1‑149 (MQ=255) cTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGa < 6:222425/149‑1 (MQ=255) ccTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCaa < 7:297926/148‑1 (MQ=255) ttttGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGa > 6:1709/1‑142 (MQ=255) ttttGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGa < 5:1709/142‑1 (MQ=255) ttttGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGc > 7:220389/1‑148 (MQ=255) ttGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGc < 8:220389/146‑1 (MQ=255) cGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGc < 7:340414/143‑1 (MQ=255) cGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGc > 8:340414/1‑143 (MQ=255) cGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACg < 6:34864/149‑1 (MQ=255) aaCGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCt < 1:130757/113‑1 (MQ=255) aaCGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCt > 2:130757/1‑113 (MQ=255) aCGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACgcgc > 4:225148/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGcccc > 1:362415/1‑116 (MQ=255) cAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGcccc < 2:362415/116‑1 (MQ=255) cAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCt > 2:74583/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCt > 1:204235/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCt > 5:190434/1‑149 (MQ=255) t‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACgaa < 4:220267/149‑1 (MQ=255) gctcgcccTCGGCGACGA‑GGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACgaagaa > 6:76432/7‑147 (MQ=255) ctcgcccTCGGCGACGA‑GGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGTGGGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACgaagaa > 1:272951/6‑147 (MQ=255) ctcG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGc > 3:130206/1‑114 (MQ=255) ctcG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGc < 4:130206/114‑1 (MQ=255) tcG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGc > 2:316079/1‑89 (MQ=255) tcG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACGAAGaaaa < 6:190434/147‑1 (MQ=255) g‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACGAAGAAAAGCTg > 2:18194/1‑149 (MQ=255) ccTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACGAAGAAAAGCTgc < 2:204235/149‑1 (MQ=255) | ACGGGCATATTTCCCATGGATGTTAACCCCTTTGGCTTGTCTTGCCAGTGCAATGCGCTACCATGGCCCTCCCTTTTTTTGTTGCCTGCCACCATGCACTGTCCCTTTTGCGGTGCCAACGACACCAAGGTCAT‑CGACTCTCG‑CCTCGTCGCCGAGGGCGAGCAGGTGCGCCGCCGCCGTGAATGCGT‑GGCCTGCGGCGAGCGCTTCACCACCTTCGAAACCGCCGAGCTGGTGCTGCCCCGGCTGATCAAGCAGGACGGCACGCGCCAGCCCTTCGACGAAGAAAAGCTGC > NC_002947/600096‑600387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |