| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 605,126 | A→T | 6.3% | S147C (AGC→TGC) | thiL → | thiamin monophosphate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 605,126 | 0 | A | T | 6.3% | 240.4 / 5.1 | 80 | S147C (AGC→TGC) | thiL | thiamin monophosphate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/39); new base T (3/2); total (39/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.74e-01 | |||||||||||
CTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAG > NC_002947/604981‑605272 | ctggctggCGGCCTATGCCGACGGCCGTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCg < 6:19114/149‑1 (MQ=255) ggctggcGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGt > 5:138904/1‑149 (MQ=255) tggcGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTCGTGACACCACGCGCGGCCAGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGc > 2:224330/1‑148 (MQ=255) ggcggcCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCaa < 7:127289/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg < 8:342731/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg < 7:295071/149‑1 (MQ=255) cTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGGGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg < 3:270971/149‑1 (MQ=255) tATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCggg > 4:194395/1‑149 (MQ=255) tGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGt < 6:125293/148‑1 (MQ=255) tGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGt < 3:67796/148‑1 (MQ=255) tGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTGCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCggg < 3:122507/147‑1 (MQ=255) ccGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGAt < 5:304297/149‑1 (MQ=255) gACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCt < 1:254773/149‑1 (MQ=255) ccTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCtgttgt < 6:138904/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTtgtg > 3:184046/1‑149 (MQ=255) cTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGGGCCCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTTCGCCGCAGCGGTGCAAGGACGGGTGCTCTGTtgtg > 8:241144/1‑149 (MQ=255) cATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg > 5:157570/1‑128 (MQ=255) cATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg < 6:157570/128‑1 (MQ=255) gCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGTTCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGGTTGACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTc < 5:293433/149‑1 (MQ=255) gCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCGGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGttg > 4:44537/1‑148 (MQ=255) ccACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCACCGCTGCGGCGCAAgg < 3:245431/118‑1 (MQ=255) ccACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCACCGCTGCGGCGCAAgg > 4:245431/1‑118 (MQ=255) aCCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGAAACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGCTGGTTCGCTg > 3:286010/1‑149 (MQ=255) cGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGCGTCGGTGGTTCGCTggg > 1:120843/1‑149 (MQ=255) ccGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAgg < 1:224330/149‑1 (MQ=255) cGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGGGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGgc < 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gATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCt > 8:248318/1‑149 (MQ=255) ggtggtGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCCTCAGCGTGACCGTGTTCGGCCGGGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAATGCCGCCGGTGCCTTGcc < 4:286010/149‑1 (MQ=255) gACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGc > 8:105100/1‑145 (MQ=255) gACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGc < 7:105100/145‑1 (MQ=255) acacCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg < 4:296096/90‑1 (MQ=255) acacCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTg > 3:199264/1‑149 (MQ=255) acacCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACAGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg > 3:296096/1‑90 (MQ=255) accacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg < 2:166841/88‑1 (MQ=255) accacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCgg > 1:166841/1‑88 (MQ=255) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGt < 1:19082/76‑1 (MQ=255) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGt > 2:19082/1‑76 (MQ=255) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTgg > 5:36802/1‑149 (MQ=255) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTgg > 4:182370/1‑149 (MQ=255) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCACCGCTGCGGCGCAAGGc < 6:275998/83‑1 (MQ=38) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCACCGCTGCGGCGCAAGGc > 5:275998/1‑83 (MQ=38) cacGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGGGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCGGGCCAGGCCTTGCGCCTCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCttg < 7:241144/149‑3 (MQ=255) gCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAgcgc < 4:199264/149‑1 (MQ=255) cccGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAgcgc > 5:293014/1‑148 (MQ=255) ccGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGa < 3:175841/149‑1 (MQ=255) ccGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGCGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGa < 2:120843/149‑1 (MQ=255) aGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGgcgc < 3:194395/148‑1 (MQ=255) tCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGcc < 6:293014/149‑1 (MQ=255) cACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTgg > 4:96946/1‑128 (MQ=255) cACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTgg < 3:96946/128‑1 (MQ=255) ccgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCggt < 4:25243/77‑1 (MQ=255) ccgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCggt > 3:25243/1‑77 (MQ=255) ccgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGtt < 7:94341/81‑1 (MQ=255) ccgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGtt > 8:94341/1‑81 (MQ=255) cgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGcc > 4:283582/1‑135 (MQ=255) cgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGcc < 3:283582/135‑1 (MQ=255) cgtgTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGcc > 1:266612/1‑148 (MQ=255) tgtTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAg > 5:272840/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCgct > 4:259734/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCggt < 1:345343/67‑1 (MQ=255) ccGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCggt > 2:345343/1‑67 (MQ=255) gcgTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGctgctg < 7:248318/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCgcgc > 4:66015/1‑127 (MQ=255) ccGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCgcgc < 3:66015/127‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCa > 7:99837/1‑149 (MQ=255) acccggCCTTGCACCGCTGCGGCGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTgg > 3:265483/5‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGt > 3:366832/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGt > 8:101936/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAgg < 3:278082/121‑1 (MQ=255) cAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAgg > 4:278082/1‑121 (MQ=255) ggCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCAc < 3:182370/149‑1 (MQ=255) gccgcAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGcc > 6:226424/1‑148 (MQ=255) gccgcAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCg > 8:201621/1‑149 (MQ=255) gcAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAg > 8:216494/1‑149 (MQ=255) | CTGGCTGGCGGCCTATGCCGACGGCCTTGGTCGCATGGCCCACCGTTGCCGCATGAGCCTGATCGGTGGTGACACCACGCGCGGCCCGTTGAGCATCACCGTGACCGTGTTCGGCCGCGTGCCGGCTGGCCAGGCCTTGCGCCGCAGCGGTGCAAGGCCGGGTGATCTGTTGTGTGTCGGTGGTTCGCTGGGCAAGGCCGCCGGTGCCTTGCCGCTGGTGCTGGGTGAGCGCGAGGCGCCTGCCGCGCAGGCCGAGCCGCTGCTGGCTCATTACTGGTCACCGATGCCGCAG > NC_002947/604981‑605272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |